Twist 的 RNA 产品提供完整的 NGS 解决方案,可为 RNA 测序生成均一的测序文库。端到端的工作流程通过结合简化且高效的文库制备试剂盒、高质量的唯一双标签 (UDI)、唯一分子标识符、优化的靶向富集和专有的外显子感知组合设计算法,实现了这一点。
Twist 靶向 RNA 测序工作流程
- 创建定制组合,以仅对重要的 RNA 转录本进行测序
- 结合 Twist RNA 文库制备、Twist 杂交和 RNA 靶向富集组合
- 即使对于来自 FFPE 样本的低质量、降解的 RNA,也能增强关键靶标的检测灵敏度
Twist 全转录组测序工作流程
- 测量 mRNA、lncRNA 和其他 RNA 种类的表达水平
- 利用从新鲜样本和 FFPE 样本中提取的总 RNA 制备文库
- 将 Twist RNA 文库制备与 Twist rRNA & Globin 去除试剂盒结合使用
- 在 5 小时内完成 RNA 文库制备
相关资源
- 产品说明书:Twist RNA 测序工作流程解决方案
- 方案:使用 Twist 通用接头的 RNA 去除和 RNA 文库制备方案
- 方案:使用 Twist UMI 接头的 RNA 去除和 RNA 文库制备方案
- 方案:利用 Twist 通用接头系统进行 RNA 文库制备
- 方案:利用 Twist UMI 接头系统进行 RNA 文库制备
Twist 的 RNA 产品提供完整的 NGS 解决方案,可为 RNA 测序生成均一的测序文库。端到端的工作流程通过结合简化且高效的文库制备试剂盒、高质量的唯一双标签 (UDI)、唯一分子标识符、优化的靶向富集和专有的外显子感知组合设计算法,实现了这一点。
Twist 靶向 RNA 测序工作流程
- 创建定制组合,以仅对重要的 RNA 转录本进行测序
- 结合 Twist RNA 文库制备、Twist 杂交和 RNA 靶向富集组合
- 即使对于来自 FFPE 样本的低质量、降解的 RNA,也能增强关键靶标的检测灵敏度
Twist 全转录组测序工作流程
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- 在 5 小时内完成 RNA 文库制备
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- 方案:利用 Twist 通用接头系统进行 RNA 文库制备
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RNA 外显子组
Twist RNA 外显子组、Twist RNA 文库制备和 Twist 靶向富集提供了可靠的工具,可利用从各种来源(包括 FFPE)中提取的 RNA 生成转录组测序数据。RNA 外显子组不仅增加了信号,而且检测相同数量的基因需要的测序读取更少。因此能够检测低表达靶标,这些靶标对于准确了解生物样本的转录状态至关重要。此外,RNA 外显子组的外显子感知设计方式具有检测亚型和连接位点的能力,而传统的设计方法可能会丢失这些功能。这种完整的测序解决方案可以产生高度复杂和均一的测序读数,用于人类转录组蛋白质编码序列的 RNA 测序分析。
更多靶标,更少读数
Twist RNA 外显子组在不同起始量的 FFPE 和通用人类参考 RNA 中以更少的读数检测更多靶标。所有文库均使用 Twist RNA 文库制备试剂盒制备。
RNA 外显子组
Twist RNA 外显子组、Twist RNA 文库制备和 Twist 靶向富集提供了可靠的工具,可利用从各种来源(包括 FFPE)中提取的 RNA 生成转录组测序数据。RNA 外显子组不仅增加了信号,而且检测相同数量的基因需要的测序读取更少。因此能够检测低表达靶标,这些靶标对于准确了解生物样本的转录状态至关重要。此外,RNA 外显子组的外显子感知设计方式具有检测亚型和连接位点的能力,而传统的设计方法可能会丢失这些功能。这种完整的测序解决方案可以产生高度复杂和均一的测序读数,用于人类转录组蛋白质编码序列的 RNA 测序分析。
更多靶标,更少读数
Twist RNA 外显子组在不同起始量的 FFPE 和通用人类参考 RNA 中以更少的读数检测更多靶标。所有文库均使用 Twist RNA 文库制备试剂盒制备。
RNA 融合
基因融合通常在多种癌症类型中充当致癌驱动突变。快速准确地检测这些融合可以为临床行动提供信息并推动治疗决策。Twist Alliance CeGaT RNA 融合组合试剂盒是一种基于 RNA 的富集组合,与传统方法相比,它提供了优化灵敏的靶向方法来研究基因融合。
该组合包括与大约 30 种癌症类型相关的 160 个融合基因。融合基因由欧洲的领先基因诊断和测序公司 CeGaT 选定。该设计不仅用于检测已知的基因融合,还用于识别新的基因融合。
该组合通过优化和验证,可与 Twist RNA 文库制备试剂盒配合使用,以实现完整的端到端工作流程的卓越性能。基于 RNA 的富集方法具有高捕获效率,可提高检测的灵敏度。该组合非常适合用于筛选肿瘤学样本,为确定治疗方案提供信息或发现用于肿瘤分类的新型融合*。
组合设计
- 在断点设计中与 66 个基因相关的 160 个融合基因
- 7394 个探针
- 涵盖多种不同的癌症类型
*注:Twist Alliance CeGaT RNA 融合组合 – 3 MB 已通过 ISO-13485 认证。
相关资源
“在 CeGaT,我们希望为我们的客户提供全面且平价的肿瘤诊断。Twist 靶向富集技术是一个强大的工作流程,帮助我们在高通量实验室工作流程中准确分析具有 80 多种治疗可操作性融合变异的患者样本。我们可以避免与基于扩增子的工作流程相关的等位基因丢失问题。从我们自己的验证结果来看,该组合使我们能够报告临床上可操作的结果并为治疗决策提供支持。”**
Florian Battke 博士,CeGaT GmbH 开发部主管
**免责声明:所得结果特定于获得该结果的机构,可能无法反映在其他机构可实现的结果。
RNA 融合
基因融合通常在多种癌症类型中充当致癌驱动突变。快速准确地检测这些融合可以为临床行动提供信息并推动治疗决策。Twist Alliance CeGaT RNA 融合组合试剂盒是一种基于 RNA 的富集组合,与传统方法相比,它提供了优化灵敏的靶向方法来研究基因融合。
该组合包括与大约 30 种癌症类型相关的 160 个融合基因。融合基因由欧洲的领先基因诊断和测序公司 CeGaT 选定。该设计不仅用于检测已知的基因融合,还用于识别新的基因融合。
该组合通过优化和验证,可与 Twist RNA 文库制备试剂盒配合使用,以实现完整的端到端工作流程的卓越性能。基于 RNA 的富集方法具有高捕获效率,可提高检测的灵敏度。该组合非常适合用于筛选肿瘤学样本,为确定治疗方案提供信息或发现用于肿瘤分类的新型融合*。
“在 CeGaT,我们希望为我们的客户提供全面且平价的肿瘤诊断。Twist 靶向富集技术是一个强大的工作流程,帮助我们在高通量实验室工作流程中准确分析具有 80 多种治疗可操作性融合变异的患者样本。我们可以避免与基于扩增子的工作流程相关的等位基因丢失问题。从我们自己的验证结果来看,该组合使我们能够报告临床上可操作的结果并为治疗决策提供支持。”**
Florian Battke 博士,CeGaT GmbH 开发部主管
**免责声明:所得结果特定于获得该结果的机构,可能无法反映在其他机构可实现的结果。
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- 在断点设计中与 66 个基因相关的 160 个融合基因
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*注:Twist Alliance CeGaT RNA 融合组合 – 3 MB 已通过 ISO-13485 认证。
相关资源
107060
Twist RNA 文库制备试剂盒、16 个样本107061
Twist RNA 文库制备试剂盒、96 个样本107147
Twist RNA 文库制备与去除,16 个样本107148
Twist RNA 文库制备与去除,96 个样本107143
RNA 外显子组 2 次反应107144
RNA 外显子组 12 次反应107146
RNA 外显子组 96 次反应106067
Twist Alliance CeGaT RNA 融合组合 – 3 MB,2 次反应试剂盒106101
Twist Alliance CeGaT RNA 融合组合 – 3 MB,12 次反应试剂盒106100
Twist Alliance CeGaT RNA 融合组合 – 3 MB,96 次反应试剂盒107060
Twist RNA 文库制备试剂盒、16 个样本107061
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RNA 外显子组 96 次反应106067
Twist Alliance CeGaT RNA 融合组合 – 3 MB,2 次反应试剂盒106101
Twist Alliance CeGaT RNA 融合组合 – 3 MB,12 次反应试剂盒106100
Twist Alliance CeGaT RNA 融合组合 – 3 MB,96 次反应试剂盒
应用说明
Evaluation of a targeted RNA sequencing workflow for variant calling from FFPE samples in NSCLC
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