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概述

超高通量测序的简化工作流程

Twist 的 FlexPrepTM UHT 文库制备试剂盒为群体研究、农业基因组学和其他超高通量应用提供了传统基于微阵列技术的新一代测序替代方案。通过将 Twist 的 Normalization by LigationTM (NBL) 技术与酶切片段化相结合,试剂盒可对各种 DNA 输入进行内置的样本归一化处理,从而降低了典型样本处理步骤的成本和复杂性。早期的样本条形码可将 12 个独立样本汇集到一个反应中,从而简化工作流程,提高效率。

一体化
Normalization by Ligation (NBL)
消除前期归一化
无需进行中间定量
使用多种输入(30 ng 至 300 ng)处理样本批次
尽早汇集样本可节约成本
尽早汇集样本可节约成本
连接反应后,将 96 个样本集中到 8 个试管中
上游反应体积微型化
减少下游消耗品
超高容量混样建库
专为超高容量混样建库而设计
利用超高通量标签功能,消除每个流动槽通道的混样建库限制
利用现有实验室设置将容量提高 12 倍*
每个靶向富集反应可支持 96 个样本

仅供研究使用。不适用于任何诊断或临床程序。
*基于 8 与 96 孔工作流程

Pop Gen App Note

Read about Twist's suite of pop gen tools that enable assay flexibility, performance and economies of scale.

阅读应用指南

 

FlexPrep UHT 产品说明书

本文件提供了有关性能的更多细节和支持数据。  


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探索 Twist 的超高通量测序方法

 

 

 

准备好开始了吗? 

 

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常见问题解答

什么是 Normalization by Ligation?
有哪些样本类型和物种演示数据可供下载?
对于 DNA 起始材料和数量有什么建议?
对于 DNA 质量有什么建议?
我可以一次制备少于 192 个样本吗?

超高通量测序的简化工作流程

Twist 的 FlexPrepTM UHT 文库制备试剂盒为群体研究、农业基因组学和其他超高通量应用提供了传统基于微阵列技术的新一代测序替代方案。通过将 Twist 的 Normalization by LigationTM (NBL) 技术与酶切片段化相结合,试剂盒可对各种 DNA 输入进行内置的样本归一化处理,从而降低了典型样本处理步骤的成本和复杂性。早期的样本条形码可将 12 个独立样本汇集到一个反应中,从而简化工作流程,提高效率。

一体化
Normalization by Ligation (NBL)
消除前期归一化
无需进行中间定量
使用多种输入(30 ng 至 300 ng)处理样本批次
尽早汇集样本可节约成本
尽早汇集样本可节约成本
连接反应后,将 96 个样本集中到 8 个试管中
上游反应体积微型化
减少下游消耗品
超高容量混样建库
专为超高容量混样建库而设计
利用超高通量标签功能,消除每个流动槽通道的混样建库限制
利用现有实验室设置将容量提高 12 倍*
每个靶向富集反应可支持 96 个样本
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仅供研究使用。不适用于任何诊断或临床程序。
*基于 8 与 96 孔工作流程

常见问题解答

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有哪些样本类型和物种演示数据可供下载?
对于 DNA 起始材料和数量有什么建议?
对于 DNA 质量有什么建议?
我可以一次制备少于 192 个样本吗?
数据
综合归一化消除步骤

Twist FlexPrepTM UHT 文库制备试剂盒采用了一种新的 Normalization by LigationTM 方法,无需进行
前期和中期样本定量,简化了您的测序工作流程。

说明
简化工作流程

在一个孔中为一个样本制备片段化和连接反应。在连接过程中使用的接头包含嵌入条形码,允许将所有 12 个孔合并为 96 孔板的一排。单个池通过 PCR 添加标签 (UDI) 制备,由此进行池级拆分。通过在一个试剂盒的单次测序运行中运行多达 1,152 个样本,可充分提高测序通量。这一效率的提高还可转化为节省成本和耗材。

图
使用 FlexPrep UHT* 的标准化产量

输入不同 DNA 质量的新一代测序读数深度归一化。每个文库识别的总测序片段计数的百分比是在按双端唯一标签和嵌入条形码拆分后计算的。完全归一化后的平均值估计为 1.04% (100/96)。

图
目标区域的可调覆盖度*

FlexPrep UHT 生成的高复杂度文库在靶向富集后具有均一覆盖度。FlexPrep 与 Twist 定制组合相结合,支持以可调覆盖深度测序 SNP、k-mer、结构变异和其他基因组目标区域。对富集材料进行测序后,将数据截取至平均 75x 的覆盖度。报告了 Picard 的关键靶向富集指标。

在文库制备中使用 96-plex
30 ng 至 300 ng gDNA 起始量进行靶向富集
在 75x 原始靶标覆盖度下的指标
平均 +/- 标准差
选定碱基
平均靶向覆盖度
嵌合体
Fold 80 碱基罚分
覆盖度为 10X 的碱基
覆盖度为 20X 的碱基
覆盖度为 0X 的碱基
79.22% +/- 0.54%
32.74 +/- 4.78
1.31% +/- 0.38%
1.416 +/- 0.044
96.06% +/- 0.94%
85.41% +/- 6.36%
0.43% +/- 0.04%

*使用的方法:在 Illumina NextSeq 550 上测序之前,使用 Twist FlexPrep UHT 文库制备试剂盒和 FlexPrep 靶向富集实验方案(用一个定制的 800kb 组合进行 96-plex 富集),用人类基因组 DNA (gDNA) (NA12878) 制备 96 个文库。在各个混合文库中,使用 30 ng 至 300 ng 的可变起始量生成了 8 个混合文库,每个混合文库包含 12 个样本。**标准试剂盒基于依次使用酶切片段化、连接和 PCR 的工作流程  ***所有图表、数字和图基于 2024 年 9 月的 Twist 内部数据。仅供研究使用。不适用于任何诊断或临床程序。

综合归一化消除步骤

Twist FlexPrepTM UHT 文库制备试剂盒采用了一种新的 Normalization by LigationTM 方法,无需进行
前期和中期样本定量,简化了您的测序工作流程。

说明
简化工作流程

在一个孔中为一个样本制备片段化和连接反应。在连接过程中使用的接头包含嵌入条形码,允许将所有 12 个孔合并为 96 孔板的一排。单个池通过 PCR 添加标签 (UDI) 制备,由此进行池级拆分。通过在一个试剂盒的单次测序运行中运行多达 1,152 个样本,可充分提高测序通量。这一效率的提高还可转化为节省成本和耗材。

图
使用 FlexPrep UHT* 的标准化产量

输入不同 DNA 质量的新一代测序读数深度归一化。每个文库识别的总测序片段计数的百分比是在按双端唯一标签和嵌入条形码拆分后计算的。完全归一化后的平均值估计为 1.04% (100/96)。

图
目标区域的可调覆盖度*

FlexPrep UHT 生成的高复杂度文库在靶向富集后具有均一覆盖度。FlexPrep 与 Twist 定制组合相结合,支持以可调覆盖深度测序 SNP、k-mer、结构变异和其他基因组目标区域。对富集材料进行测序后,将数据截取至平均 75x 的覆盖度。报告了 Picard 的关键靶向富集指标。

在文库制备中使用 96-plex
30 ng 至 300 ng gDNA 起始量进行靶向富集
在 75x 原始靶标覆盖度下的指标
平均 +/- 标准差
选定碱基
平均靶向覆盖度
嵌合体
Fold 80 碱基罚分
覆盖度为 10X 的碱基
覆盖度为 20X 的碱基
覆盖度为 0X 的碱基
79.22% +/- 0.54%
32.74 +/- 4.78
1.31% +/- 0.38%
1.416 +/- 0.044
96.06% +/- 0.94%
85.41% +/- 6.36%
0.43% +/- 0.04%

*使用的方法:在 Illumina NextSeq 550 上测序之前,使用 Twist FlexPrep UHT 文库制备试剂盒和 FlexPrep 靶向富集实验方案(用一个定制的 800kb 组合进行 96-plex 富集),用人类基因组 DNA (gDNA) (NA12878) 制备 96 个文库。在各个混合文库中,使用 30 ng 至 300 ng 的可变起始量生成了 8 个混合文库,每个混合文库包含 12 个样本。**标准试剂盒基于依次使用酶切片段化、连接和 PCR 的工作流程  ***所有图表、数字和图基于 2024 年 9 月的 Twist 内部数据。仅供研究使用。不适用于任何诊断或临床程序。

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109220

Twist FlexPrep™ UHT 文库制备试剂盒,192 个样本

109223

Twist FlexPrep™ UHT LP 和杂交试剂盒,192 个样本

109224

Twist FlexPrep™ UHT 文库制备试剂盒,1152 个样本

109226

Twist FlexPrep™ UHT LP 和杂交试剂盒,1152 个样本

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一个简单的工作流程,实现超高通量
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