概述 数据 数据分析 订购和规格 资源
概述

对急性呼吸道感染相关病毒病原体测序的认识 

根据宿主环境的不同,呼吸道可能含有多种共生和病原体生物。仅检测一个物种可能无法最全面地反映样本的生物分析情况。Twist 呼吸道病毒研究组合能够对呼吸道病毒病原体进行富集和测序,使研究人员能够检测病毒种类并获得病毒基因组的序列信息。

此外,急性呼吸道感染的症状可能与其他呼吸道病毒的症状重叠。Twist 呼吸道病毒研究组合可以帮助研究人员确定感染原因并识别合并感染。

图

全面检测呼吸道病原体
全面检测呼吸道病原体
旨在通过一次捕获靶向多种病毒
靶向 29 种常见人类呼吸道病毒的参考序列
可靠地检测共同感染
可靠地检测共同感染
确定样本中是否含有多种病原体
通过自定义组合添加其他病原体
对低病毒载量高度灵敏
对低病毒载量高度灵敏
从包括鼻咽样本在内的多种样本类型中收集数据
检测低至 100 个病毒基因组拷贝的病毒载量

该面板的设计采用了 CATCH(用于全面杂交的目标紧凑聚合)算法。有关 CATCH 的更多详细信息,请参阅 Metsky HC 和 Siddle KJ 等人的《利用全面、可扩展的探针设计捕捉元基因组中的序列多样性》。Nature Biotechnology, 37(2), 160–168 (2019). doi: 10.1038/ s41587-018-0006-x 

病毒病原体的 NGS 靶向富集

对急性呼吸道感染相关病毒病原体测序的认识 

根据宿主环境的不同,呼吸道可能含有多种共生和病原体生物。仅检测一个物种可能无法最全面地反映样本的生物分析情况。Twist 呼吸道病毒研究组合能够对呼吸道病毒病原体进行富集和测序,使研究人员能够检测病毒种类并获得病毒基因组的序列信息。

此外,急性呼吸道感染的症状可能与其他呼吸道病毒的症状重叠。Twist 呼吸道病毒研究组合可以帮助研究人员确定感染原因并识别合并感染。

图

全面检测呼吸道病原体
全面检测呼吸道病原体
旨在通过一次捕获靶向多种病毒
靶向 29 种常见人类呼吸道病毒的参考序列
可靠地检测共同感染
可靠地检测共同感染
确定样本中是否含有多种病原体
通过自定义组合添加其他病原体
对低病毒载量高度灵敏
对低病毒载量高度灵敏
从包括鼻咽样本在内的多种样本类型中收集数据
检测低至 100 个病毒基因组拷贝的病毒载量
病毒病原体的 NGS 靶向富集

该面板的设计采用了 CATCH(用于全面杂交的目标紧凑聚合)算法。有关 CATCH 的更多详细信息,请参阅 Metsky HC 和 Siddle KJ 等人的《利用全面、可扩展的探针设计捕捉元基因组中的序列多样性》。Nature Biotechnology, 37(2), 160–168 (2019). doi: 10.1038/ s41587-018-0006-x 

数据
单次检测常见的人类呼吸道病原体

该组合中的 41,047 个探针根据 GenBank 数据库汇编而成,研究人员能够通过其将 COVID-19 症状与其他呼吸道疾病(流感相关和非流感相关)的症状区分开来。Twist 呼吸道病毒研究组合能够富集这些病毒序列,以进行高分辨率 NGS。这样一来,即使对于具有挑战性的样本,也能高灵敏度地检测到至少 100 个拷贝的病毒物质,富集超过 5000x,并且富集后 1X 或更高基因组的覆盖度超过 99.9%。

 

NGS 呼吸道病毒质控品分类树
检测来自不同病毒家族的病毒标准品

在 cDNA 合成之前,以 1,000,000 个拷贝将每个 Twist 合成病毒质控品加标至 50 ng 的人类载体 RNA 中。对于每个标准品,我们标注了中靶病毒读长的百分比、输入以上的倍数富集、整个基因组的中位覆盖度、覆盖度至少为 30x 的碱基百分比以及模板长度。病毒基因组在所有基因组片段中按模板长度(从短到长)排序。在大多数情况下,我们发现超过 70% 的读长来自这些文库中的病毒基因组,比加标内容物至少富集了 2500 倍。

 检测来自不同病毒家族的病毒标准品
通过多重分析来提高通量,降低成本

使用多重和单重杂交反应,比较使用 Twist 合成病毒质控品在不同病毒滴度下捕获的中靶病毒读长百分比。第一张图比较了每个文库 1,000,000 个拷贝的多重和单重杂交反应,第二张图比较了每个文库 100、10,000 和 1,000,000 个拷贝的多重和单重杂交反应。使用 Twist 标准靶向富集工作流程和 Twist 呼吸道病毒研究组合捕获每个病毒质控品。该数据表明,当使用 Twist 呼吸道病毒研究组合时,8 重捕获可提供与单重捕获相当的高效富集。

NGS 呼吸道病毒质控品多重分析
单次检测常见的人类呼吸道病原体

该组合中的 41,047 个探针根据 GenBank 数据库汇编而成,研究人员能够通过其将 COVID-19 症状与其他呼吸道疾病(流感相关和非流感相关)的症状区分开来。Twist 呼吸道病毒研究组合能够富集这些病毒序列,以进行高分辨率 NGS。这样一来,即使对于具有挑战性的样本,也能高灵敏度地检测到至少 100 个拷贝的病毒物质,富集超过 5000x,并且富集后 1X 或更高基因组的覆盖度超过 99.9%。

 

NGS 呼吸道病毒质控品分类树
检测来自不同病毒家族的病毒标准品

在 cDNA 合成之前,以 1,000,000 个拷贝将每个 Twist 合成病毒质控品加标至 50 ng 的人类载体 RNA 中。对于每个标准品,我们标注了中靶病毒读长的百分比、输入以上的倍数富集、整个基因组的中位覆盖度、覆盖度至少为 30x 的碱基百分比以及模板长度。病毒基因组在所有基因组片段中按模板长度(从短到长)排序。在大多数情况下,我们发现超过 70% 的读长来自这些文库中的病毒基因组,比加标内容物至少富集了 2500 倍。

 检测来自不同病毒家族的病毒标准品
通过多重分析来提高通量,降低成本

使用多重和单重杂交反应,比较使用 Twist 合成病毒质控品在不同病毒滴度下捕获的中靶病毒读长百分比。第一张图比较了每个文库 1,000,000 个拷贝的多重和单重杂交反应,第二张图比较了每个文库 100、10,000 和 1,000,000 个拷贝的多重和单重杂交反应。使用 Twist 标准靶向富集工作流程和 Twist 呼吸道病毒研究组合捕获每个病毒质控品。该数据表明,当使用 Twist 呼吸道病毒研究组合时,8 重捕获可提供与单重捕获相当的高效富集。

NGS 呼吸道病毒质控品多重分析
数据分析
One Codex 分析

Twist 呼吸道病毒研究组合可访问 One Codex 云端工具。它是研究和临床应用的理想之选,因为它可用于创建可发表的视觉图像和可打印的报告,有助于实验室准备实验室开发测试。

使用 Twist 呼吸道病毒研究组合时,所有客户均可访问 One Codex 分析平台。该平台是研究和临床应用案例的理想之选,包括制作可发表的视觉图像、可共享的报告和其他分析工具。在购买该组合时,您将获得在 One Codex 平台上进行样本分析的入门指导和积分。了解该微生物样本分析解决方案的更多信息,请参见 One Codex

One Codex 用户界面
One Codex 分析

Twist 呼吸道病毒研究组合可访问 One Codex 云端工具。它是研究和临床应用的理想之选,因为它可用于创建可发表的视觉图像和可打印的报告,有助于实验室准备实验室开发测试。

使用 Twist 呼吸道病毒研究组合时,所有客户均可访问 One Codex 分析平台。该平台是研究和临床应用案例的理想之选,包括制作可发表的视觉图像、可共享的报告和其他分析工具。在购买该组合时,您将获得在 One Codex 平台上进行样本分析的入门指导和积分。了解该微生物样本分析解决方案的更多信息,请参见 One Codex

One Codex 用户界面
订购和规格
产品 SKU

103066

Twist 呼吸道病毒研究组合(含 One Codex 软件),2 次反应,试剂盒

103067

Twist 呼吸道病毒研究组合(含 One Codex 软件),12 次反应,试剂盒

103068

Twist 呼吸道病毒研究组合(含 One Codex 软件),96 次反应,试剂盒
参数

形式

dsDNA

组合大小

41047 个探针

内容

基于 29 个呼吸道病毒参考序列

设计数据库

RefSeq 与 GenBank

储存温度

-5°C 至-30°C

Twist 呼吸道病毒研究组合仅供研究使用,并遵守 Twist 供应条款和条件中规定的额外使用限制。

产品 SKU

103066

Twist 呼吸道病毒研究组合(含 One Codex 软件),2 次反应,试剂盒

103067

Twist 呼吸道病毒研究组合(含 One Codex 软件),12 次反应,试剂盒

103068

Twist 呼吸道病毒研究组合(含 One Codex 软件),96 次反应,试剂盒
参数

形式

dsDNA

组合大小

41047 个探针

内容

基于 29 个呼吸道病毒参考序列

设计数据库

RefSeq 与 GenBank

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-5°C 至-30°C

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