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概述

利用 Twist CNV 骨架加标组合提高 CNV 检测能力

外显子组测序是分析基因组蛋白质编码区的强大工具,它覆盖了人类基因组中约 1-2% 的碱基。虽然这使得基因分析比全基因组测序更有效,但却遗漏了大的基因间区域--这可能会给检测拷贝数变异 (CNV) 带来挑战。

CNV 在许多遗传疾病中起着至关重要的作用,但标准外显子组测序缺乏均匀分布的探针来可靠地对其进行识别。

Twist CNV 骨架加标组合旨在通过向基因组中添加间隔规则的探针来改进 CNV 检测能力。这些组合有 100 kb、50 kb 和 25 kb 三种分辨率级别,研究人员可根据自己的具体需求对 CNV 分析进行微调。

将 CNV 骨架加标组合整合到您的外显子组工作流程中非常简单,只需将其与您的外显子组组合混合,并遵循 Twist 的标准靶向富集方案即可。

微调 CNV 分辨率
微调 CNV 分辨率
可选择 100 kb(低分辨率)、50 kb(中分辨率)或 25 kb(高分辨率)。
探针战略性地排列在基因间区域,以加强 CNV 检测能力。
轻松添加到外显子组组合中,改进全外显子组测序。
无缝整合
与 Twist 外显子组解决方案无缝整合
专为搭配 Twist Exome 2.0 + 全面加标组合而设计。
提供 2 次反应(16 个样本)和 12 次反应(96 个样本)两种规格

选择所需的 CNV 分辨率

CNV 骨架加标组合:
25 kb
50 kb
100 kb

组合设计大小 (Mb)

8.32

3.33

1.39

SNV 和 INDEL 已检出

265138

207765

181956

所有 CNV 均已检出

472

446

411

CNVs less than 50 kb called

417

385

361

平均靶向覆盖度

150

171

161

 

表 1. Twist CNV 骨架加标组合数据示例。 在 Illumina NovaSeq 6000 上,使用 2x150 读长对已知含有 CNV 的高特征样本集 (1) 和由 12 名健康人组成的基线样本集进行了测序。测定了每个组合添加到 Twist 外显子组 2.0 plus 全面加标中后,在每个探针密度下被检出的 SNV、INDEL 和 CNV 的平均数量和测序深度。CNV 检出是通过市售软件解决方案进行的 (2)
 

(1) Coriell 研究所的 CNVPANEL01 - 人类 CNV 参考组合。
(2) eVai 平台(二级工作流程),enGenome 软件。 

利用 Twist CNV 骨架加标组合提高 CNV 检测能力

外显子组测序是分析基因组蛋白质编码区的强大工具,它覆盖了人类基因组中约 1-2% 的碱基。虽然这使得基因分析比全基因组测序更有效,但却遗漏了大的基因间区域--这可能会给检测拷贝数变异 (CNV) 带来挑战。

CNV 在许多遗传疾病中起着至关重要的作用,但标准外显子组测序缺乏均匀分布的探针来可靠地对其进行识别。

Twist CNV 骨架加标组合旨在通过向基因组中添加间隔规则的探针来改进 CNV 检测能力。这些组合有 100 kb、50 kb 和 25 kb 三种分辨率级别,研究人员可根据自己的具体需求对 CNV 分析进行微调。

将 CNV 骨架加标组合整合到您的外显子组工作流程中非常简单,只需将其与您的外显子组组合混合,并遵循 Twist 的标准靶向富集方案即可。

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可选择 100 kb(低分辨率)、50 kb(中分辨率)或 25 kb(高分辨率)。
探针战略性地排列在基因间区域,以加强 CNV 检测能力。
轻松添加到外显子组组合中,改进全外显子组测序。
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专为搭配 Twist Exome 2.0 + 全面加标组合而设计。
提供 2 次反应(16 个样本)和 12 次反应(96 个样本)两种规格

选择所需的 CNV 分辨率

CNV 骨架加标组合:
25 kb
50 kb
100 kb

组合设计大小 (Mb)

8.32

3.33

1.39

SNV 和 INDEL 已检出

265138

207765

181956

所有 CNV 均已检出

472

446

411

CNVs less than 50 kb called

417

385

361

平均靶向覆盖度

150

171

161

 

表 1. Twist CNV 骨架加标组合数据示例。 在 Illumina NovaSeq 6000 上,使用 2x150 读长对已知含有 CNV 的高特征样本集 (1) 和由 12 名健康人组成的基线样本集进行了测序。测定了每个组合添加到 Twist 外显子组 2.0 plus 全面加标中后,在每个探针密度下被检出的 SNV、INDEL 和 CNV 的平均数量和测序深度。CNV 检出是通过市售软件解决方案进行的 (2)
 

(1) Coriell 研究所的 CNVPANEL01 - 人类 CNV 参考组合。
(2) eVai 平台(二级工作流程),enGenome 软件。 

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高分辨率:

110756

Twist 25 kb CNV 骨架加标组合,2 次反应试剂盒

110757

Twist 25 kb CNV 骨架加标组合,12 次反应试剂盒
中级分辨率:

110758

Twist 50 kb CNV 骨架加标组合,2 次反应试剂盒

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Twist 50 kb CNV 骨架加标组合,12 次反应试剂盒
低分辨率:

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Twist 100 kb CNV 骨架加标组合,2 次反应试剂盒

110761

Twist 100 kb CNV 骨架加标组合,12 次反应试剂盒
外显子组组合

104132

Twist 外显子组 2.0,2 次反应,试剂盒

104134

Twist 外显子组 2.0,12 次反应,试剂盒

104136

Twist 外显子组 2.0,96 次反应,试剂盒

105034

Twist 外显子组 2.0 Plus 全面外显子组加标,2 次反应

105035

Twist 外显子组 2.0 Plus 全面外显子组加标,12 次反应

105036

Twist 外显子组 2.0 Plus 全面外显子组加标,96 次反应

*Twist 网站和产品的使用受 Twist 条款和条件的约束,仅供研究使用。 

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