概述 数据 订购信息 资源
概述

用于液体活检开发和过程控制的高灵敏度合成参考材料

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 是一款综合性工具,用于协助研究人员开发临床相关变异,并对其进行质量监控,以开发以 NGS 为基础的检测方法。此外,研究人员还可以利用这些参考标准品来确定两个基本的分析参数:其检测的检测限(LoD)和空白限(LoB)。该参考物质由来自细胞系的野生型(WT)背景无细胞 DNA(cfDNA)和携带突变等位基因的合成寡核苷酸组成,具有研究液体活检化验开发所需的精确度和灵敏度。 

广泛的变异覆盖度

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 提供了一系列广泛的循环肿瘤 DNA(ctDNA)变异。这些变异密切反映了 cfDNA 片段的尺寸和分布,因此是准确模拟真实情况不可或缺的工具。它包括合成打印的变异体,包括单核苷酸变异(SNV)、插入缺失(INDEL)和结构变异(SV)。

综合性变异位点

此参考标准品拥有跨越 84 个基因的超过 400 个变异位点,包括经文献整理的临床相关变异,可推动 cfDNA 分析的全面性。它使研究人员能够检测与癌症相关的各种基因变异。

增强 LoD 和 LoB 的建立

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 经过精心设计,旨在确定检测的分析的检测限(LoD)和空白限(LoB)。这一关键功能可帮助您确定目标变异的最低可检测水平,并建立检测灵敏度基线。

低背景错误率

对比分析显示,Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 与其前身(v1)和其他竞争产品相比,错误率明显降低。 

兼容性和多功能性

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 标准可与 Twist 的靶向富集系统套件和定制捕获板无缝集成。Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 套装包括 7 个单独试管,每个试管 300 ng,适用于 7 种不同的 VAF:0% (WT)、0.1%、0.25%、0.5%、1%、2%、5%。Twist 还为每种 VAF 提供较小的 600 ng 和较大的 3 ug 配置。

全面检测癌症变异
全面检测癌症变异
456 个自然发生的癌症变异
132 个临床相关变异
涵盖 84 个不同的癌症相关基因
对背景 DNA 异常敏感
对背景 DNA 异常敏感
从非扩增细胞系 DNA 提取的背景 cfDNA
DNA 片段大小图谱和测序后图谱类似天然 cfDNA
设计兼具精确性、灵活性
设计兼具精确性、灵活性
七种个体变异等位基因百分比可供选择,有大配置和小配置
VAF 百分比数字化液滴 PCR 验证
提供所有 VAF 百分比的便捷检测组合

*仅供研究使用。不适用于任何诊断或临床程序。

用于液体活检开发和过程控制的高灵敏度合成参考材料

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 是一款综合性工具,用于协助研究人员开发临床相关变异,并对其进行质量监控,以开发以 NGS 为基础的检测方法。此外,研究人员还可以利用这些参考标准品来确定两个基本的分析参数:其检测的检测限(LoD)和空白限(LoB)。该参考物质由来自细胞系的野生型(WT)背景无细胞 DNA(cfDNA)和携带突变等位基因的合成寡核苷酸组成,具有研究液体活检化验开发所需的精确度和灵敏度。 

广泛的变异覆盖度

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 提供了一系列广泛的循环肿瘤 DNA(ctDNA)变异。这些变异密切反映了 cfDNA 片段的尺寸和分布,因此是准确模拟真实情况不可或缺的工具。它包括合成打印的变异体,包括单核苷酸变异(SNV)、插入缺失(INDEL)和结构变异(SV)。

综合性变异位点

此参考标准品拥有跨越 84 个基因的超过 400 个变异位点,包括经文献整理的临床相关变异,可推动 cfDNA 分析的全面性。它使研究人员能够检测与癌症相关的各种基因变异。

增强 LoD 和 LoB 的建立

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 经过精心设计,旨在确定检测的分析的检测限(LoD)和空白限(LoB)。这一关键功能可帮助您确定目标变异的最低可检测水平,并建立检测灵敏度基线。

低背景错误率

对比分析显示,Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 与其前身(v1)和其他竞争产品相比,错误率明显降低。 

兼容性和多功能性

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 标准可与 Twist 的靶向富集系统套件和定制捕获板无缝集成。Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 套装包括 7 个单独试管,每个试管 300 ng,适用于 7 种不同的 VAF:0% (WT)、0.1%、0.25%、0.5%、1%、2%、5%。Twist 还为每种 VAF 提供较小的 600 ng 和较大的 3 ug 配置。

全面检测癌症变异
全面检测癌症变异
456 个自然发生的癌症变异
132 个临床相关变异
涵盖 84 个不同的癌症相关基因
对背景 DNA 异常敏感
对背景 DNA 异常敏感
从非扩增细胞系 DNA 提取的背景 cfDNA
DNA 片段大小图谱和测序后图谱类似天然 cfDNA
设计兼具精确性、灵活性
设计兼具精确性、灵活性
七种个体变异等位基因百分比可供选择,有大配置和小配置
VAF 百分比数字化液滴 PCR 验证
提供所有 VAF 百分比的便捷检测组合

*仅供研究使用。不适用于任何诊断或临床程序。

数据
Twist 的参考标准品与竞争对手的片段特征比较

对 Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2、天然 cfDNA 和竞争对手参考标准品进行 DNA 片段分析,最大峰值高度均衡。Twist 标准品的大小分布与天然 cfDNA 相似,包括一个突出的单核糖体峰和双核糖体峰。

比较
合成变异 DNA 设计示意图

变异 DNA 分子平铺在变异基因组位点(带星号的紫色虚线)上广泛重叠,提供了变异位点相对于 DNA 分子末端的高覆盖度、片段多样性和位置多样性。 

 

示意图
背景突变率比较

背景突变率分析的定义是在靶向富集的 WT 样本的双链共识读段中检测到的非种系变异率,并在 Twist cfDNA v2 标准品、天然 cfDNA、竞争对手 DNA 标准品和 Twist cfDNA v1 标准品中进行了分析。由于采取了高保真生产工艺,Twist 泛癌种 v2 的背景错误率与天然 cfDNA 相似,低于之前的 v1 和竞争对手产品。

 

背景突变率比较
插入缺失的大小分布

通过二进制直方图1(负数表示删除,正数表示插入)直观显示参考标准中包含的 INDEL 的插入或删除大小。SNV 不显示。所包含的 INDEL 样本范围广泛,可对 INDEL 检测性能进行广泛分析。INDEL 的范围包括 30 bp 的缺失和 15 bp 的插入。

插入缺失的大小分布
靶向富集工作流程中的变异检出

NGS 在不同参考标准品变异等位基因频率中检测到的平均变异等位基因频率 (VAF)(以对数标度显示)。在对 Twist cfDNA 泛癌种参考标准品进行采集时,使用了针对标准品中发现的 215 个单核苷酸变异(SNV)的定制面板,并在进行 UMI 重复数据删除之前对其进行了 80,000 倍原始覆盖度的测序。NGS 检测到的平均 VAF 与所有测试水平的预期 VAF 非常接近,便于进行化验基准测试。

 

变异检出
Twist 的参考标准品与竞争对手的片段特征比较

对 Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2、天然 cfDNA 和竞争对手参考标准品进行 DNA 片段分析,最大峰值高度均衡。Twist 标准品的大小分布与天然 cfDNA 相似,包括一个突出的单核糖体峰和双核糖体峰。

比较
合成变异 DNA 设计示意图

变异 DNA 分子平铺在变异基因组位点(带星号的紫色虚线)上广泛重叠,提供了变异位点相对于 DNA 分子末端的高覆盖度、片段多样性和位置多样性。 

 

示意图
背景突变率比较

背景突变率分析的定义是在靶向富集的 WT 样本的双链共识读段中检测到的非种系变异率,并在 Twist cfDNA v2 标准品、天然 cfDNA、竞争对手 DNA 标准品和 Twist cfDNA v1 标准品中进行了分析。由于采取了高保真生产工艺,Twist 泛癌种 v2 的背景错误率与天然 cfDNA 相似,低于之前的 v1 和竞争对手产品。

 

背景突变率比较
插入缺失的大小分布

通过二进制直方图1(负数表示删除,正数表示插入)直观显示参考标准中包含的 INDEL 的插入或删除大小。SNV 不显示。所包含的 INDEL 样本范围广泛,可对 INDEL 检测性能进行广泛分析。INDEL 的范围包括 30 bp 的缺失和 15 bp 的插入。

插入缺失的大小分布
靶向富集工作流程中的变异检出

NGS 在不同参考标准品变异等位基因频率中检测到的平均变异等位基因频率 (VAF)(以对数标度显示)。在对 Twist cfDNA 泛癌种参考标准品进行采集时,使用了针对标准品中发现的 215 个单核苷酸变异(SNV)的定制面板,并在进行 UMI 重复数据删除之前对其进行了 80,000 倍原始覆盖度的测序。NGS 检测到的平均 VAF 与所有测试水平的预期 VAF 非常接近,便于进行化验基准测试。

 

变异检出
订购信息
产品 SKU

107576

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 组合,300 ng 试剂盒

107577

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0% (WT),3 ug

107578

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0.1%,3 ug

107579

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0.25%,3 ug

107580

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0.5%,3 ug

107581

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 1%,3 ug

107582

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 2%,3 ug

107583

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 5%,3 ug

107584

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0%,600 ng

107585

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0.1%,600 ng

107586

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0.25%,600 ng

107587

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0.5%,600 ng

107588

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 1%,600 ng

107589

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 2%,600 ng

107590

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 5%,600 ng

*试剂盒包括 7 个 VAF,分别为:0% (WT)、0.1%、0.25%、0.5%、1%、2%、5%,每管 300 ng

*仅供研究使用。不适用于任何诊断或临床程序。

产品 SKU

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Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 组合,300 ng 试剂盒

107577

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0% (WT),3 ug

107578

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0.1%,3 ug

107579

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0.25%,3 ug

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Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0.5%,3 ug

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Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 1%,3 ug

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Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 2%,3 ug

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Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 5%,3 ug

107584

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0%,600 ng

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Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0.1%,600 ng

107586

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0.25%,600 ng

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Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 0.5%,600 ng

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Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 1%,600 ng

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Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 2%,600 ng

107590

Twist cfDNA 泛癌种参考标准品 v2 VAF 5%,600 ng

*试剂盒包括 7 个 VAF,分别为:0% (WT)、0.1%、0.25%、0.5%、1%、2%、5%,每管 300 ng

*仅供研究使用。不适用于任何诊断或临床程序。

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