Twist FlexPrep UHT ライブラリ調製キット

概要

超ハイスループットシーケンシングを実現するシンプルなワークフロー

Twist の FlexPrep^TM UHT Library Preparation Kitは、集団研究やアグリゲノミクスなど超ハイスループットアプリケーション向けに、従来のマイクロアレイをベースとした技術に代わる NGS（次世代シーケンシング）を実現します。Twist の Normalization by Ligation^TM（NBL）技術と酵素による断片化法を組み合わせたこのキットは、幅広い DNA インプット量に対してサンプルの正規化を行えるため、通常のサンプル処理ステップのコストと複雑性が軽減されます。早い段階でサンプルをバーコーディングすることで、下流で 12 個の別々のサンプルを 1 つの反応にプールすることができ、より合理的で効率的なワークフローが可能になります。

製品の特徴

Normalization by Ligation（NBL）

事前の正規化ステップを排除

中間産物の定量不要

幅広いインプット範囲（30 ng ～ 300 ng）のサンプルに対応

サンプルの早期プーリングによるコスト削減

ライゲーション反応後、96 サンプルを 8 本のチューブに統合

上流の反応ボリュームを少量化

下流の消耗品を削減

大規模マルチプレックスアッセイが可能な設計

フローセルレーンごとのマルチプレックスに対する制限を超ハイスループットインデックス化により解消

すでにお持ちのラボ設備にて12 倍の大規模化*

ターゲットエンリッチメント 1 反応あたり 96 サンプルをサポート

研究用途にのみお使いいただけます。診断や臨床用途には使用できません。
*8 ウェル対 96 ウェルのワークフローに基づく

Twist の超ハイスループットシーケンシングへのアプローチをご覧ください

ご準備はよろしいですか？

お見積もりはこちらお問い合わせ

FAQ

Normalization by Ligation とは何ですか？

ダウンロード可能なサンプルの種類や種のデモデータが何かを教えてください。

DNA のインプットと量に関する推奨はありますか？

DNA の品質に関する推奨はありますか？

192 サンプル以下のサンプルを一度に調製できますか？

超ハイスループットシーケンシングを実現するシンプルなワークフロー

Twist の FlexPrep^TM UHT Library Preparation Kitは、集団研究やアグリゲノミクスなど超ハイスループットアプリケーション向けに、従来のマイクロアレイをベースとした技術に代わる NGS（次世代シーケンシング）を実現します。Twist の Normalization by Ligation^TM（NBL）技術と酵素による断片化法を組み合わせたこのキットは、幅広い DNA インプット量に対してサンプルの正規化を行えるため、通常のサンプル処理ステップのコストと複雑性が軽減されます。早い段階でサンプルをバーコーディングすることで、下流で 12 個の別々のサンプルを 1 つの反応にプールすることができ、より合理的で効率的なワークフローが可能になります。

製品の特徴

Normalization by Ligation（NBL）

事前の正規化ステップを排除

中間産物の定量不要

幅広いインプット範囲（30 ng ～ 300 ng）のサンプルに対応

サンプルの早期プーリングによるコスト削減

ライゲーション反応後、96 サンプルを 8 本のチューブに統合

上流の反応ボリュームを少量化

下流の消耗品を削減

大規模マルチプレックスアッセイが可能な設計

フローセルレーンごとのマルチプレックスに対する制限を超ハイスループットインデックス化により解消

すでにお持ちのラボ設備にて12 倍の大規模化*

ターゲットエンリッチメント 1 反応あたり 96 サンプルをサポート

Twist の超ハイスループットシーケンシングへのアプローチをご覧ください

ご準備はよろしいですか？

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研究用途にのみお使いいただけます。診断や臨床用途には使用できません。
*8 ウェル対 96 ウェルのワークフローに基づく

FAQ

Normalization by Ligation とは何ですか？

ダウンロード可能なサンプルの種類や種のデモデータが何かを教えてください。

DNA のインプットと量に関する推奨はありますか？

DNA の品質に関する推奨はありますか？

192 サンプル以下のサンプルを一度に調製できますか？

データ

正規化の統合でステップを削減

Twist FlexPrep^TM UHT Library Preparation Kit は、Normalization by Ligation^TM という新しい手法を採用しており、 事前および中間のサンプル定量が不要となり、シーケンシングワークフローが合理化されます。

ワークフローの簡素化

断片化反応とライゲーション反応が、サンプルごとに 1 つのウェルで行われます。ライゲーションで使用するアダプターにはインラインバーコードが含まれており、このステップの後に96 ウェルプレートの 1 列の全 12 ウェルをプーリングできます。それぞれのプールは、プールレベルでのデマルチプレックス化用に PCR で追加されたインデックス（UDI）と共に調製されます。FlexPrep キットからの 1 回のシーケンシング実行で最大 1,152 のサンプルを処理することで、シーケンシングスループットを最大化できます。この効率向上によりコストと消耗品の節約につながります。

FlexPrep UHT で正規化された収量*

さまざまな DNA インプット量で NGS のリードデプスを正規化しました。各ライブラリで同定された総リード数の割合は、ユニークデュアルインデックスおよびインラインバーコードのデマルチプレックス化を行った後に算出されます。完全な正規化が行われた場合の平均値は 1.04%（100/96）です。

対象領域で調整可能なカバレッジ*

FlexPrep UHT により、ターゲットエンリッチメント後に均一なカバレッジを持つ複雑性の高いライブラリが調製できます。Twist カスタムパネルと組み合わせて、FlexPrep は SNP、k-mer、構造多型など関心のあるゲノム領域に対してカバー領域を調整することが可能です。濃縮後のサンプルは平均 75x のカバレッジにダウンサンプリングされています。Picard のうち、主なターゲットエンリッチメントメトリクスを示しています。

96-plex のターゲットエンリッチメント

30 ng ～ 300 ng の gDNA インプットをライブラリ調製に使用

METRICS AT 75X RAW TARGETCOVERAGE

平均 ± 標準偏差

Selected Bases

Mean Target Coverage

Chimeras

Fold-80 Base Penalty

Covered Bases at 10X

Covered Bases at 20X

Covered Bases at 0X

79.22% ± 0.54%

32.74 ± 4.78

1.31% ± 0.38%

1.416 ± 0.044

96.06% ± 0.94%

85.41% ± 6.36%

0.43% ± 0.04%

*使用した方法：96 のライブラリを、Twist FlexPrep UHT Library Preparation Kit および FlexPrep ターゲットエンリッチメントプロトコルを用いてヒトゲノム DNA（gDNA）（NA12878）からカスタム 800 kb パネルの 96-plexとして調製し、Illumina NextSeq 550 でシーケンシングを行いました。それぞれ 12 サンプルからなる 8 つのライブラリプールを得ました（各ライブラリプール中のインプットの質量は 30 ng ～ 300 ng の範囲）。**標準キットは、酵素による断片化とその後のライゲーション、そして PCR を用いるワークフローに基づいています。 ***すべてのチャート、図およびグラフは Twist の内部データ（2024 年 9 月）に基づいています。研究専用です。診断や臨床用途には使用できません。

正規化の統合でステップを削減

Twist FlexPrep^TM UHT Library Preparation Kit は、Normalization by Ligation^TM という新しい手法を採用しており、 事前および中間のサンプル定量が不要となり、シーケンシングワークフローが合理化されます。

ワークフローの簡素化

断片化反応とライゲーション反応が、サンプルごとに 1 つのウェルで行われます。ライゲーションで使用するアダプターにはインラインバーコードが含まれており、このステップの後に96 ウェルプレートの 1 列の全 12 ウェルをプーリングできます。それぞれのプールは、プールレベルでのデマルチプレックス化用に PCR で追加されたインデックス（UDI）と共に調製されます。FlexPrep キットからの 1 回のシーケンシング実行で最大 1,152 のサンプルを処理することで、シーケンシングスループットを最大化できます。この効率向上によりコストと消耗品の節約につながります。

FlexPrep UHT で正規化された収量*

さまざまな DNA インプット量で NGS のリードデプスを正規化しました。各ライブラリで同定された総リード数の割合は、ユニークデュアルインデックスおよびインラインバーコードのデマルチプレックス化を行った後に算出されます。完全な正規化が行われた場合の平均値は 1.04%（100/96）です。

対象領域で調整可能なカバレッジ*

FlexPrep UHT により、ターゲットエンリッチメント後に均一なカバレッジを持つ複雑性の高いライブラリが調製できます。Twist カスタムパネルと組み合わせて、FlexPrep は SNP、k-mer、構造多型など関心のあるゲノム領域に対してカバー領域を調整することが可能です。濃縮後のサンプルは平均 75x のカバレッジにダウンサンプリングされています。Picard のうち、主なターゲットエンリッチメントメトリクスを示しています。

96-plex のターゲットエンリッチメント

30 ng ～ 300 ng の gDNA インプットをライブラリ調製に使用

METRICS AT 75X RAW TARGETCOVERAGE

平均 ± 標準偏差

Selected Bases

Mean Target Coverage

Chimeras

Fold-80 Base Penalty

Covered Bases at 10X

Covered Bases at 20X

Covered Bases at 0X

79.22% ± 0.54%

32.74 ± 4.78

1.31% ± 0.38%

1.416 ± 0.044

96.06% ± 0.94%

85.41% ± 6.36%

0.43% ± 0.04%

*使用した方法：96 のライブラリを、Twist FlexPrep UHT Library Preparation Kit および FlexPrep ターゲットエンリッチメントプロトコルを用いてヒトゲノム DNA（gDNA）（NA12878）からカスタム 800 kb パネルの 96-plexとして調製し、Illumina NextSeq 550 でシーケンシングを行いました。それぞれ 12 サンプルからなる 8 つのライブラリプールを得ました（各ライブラリプール中のインプットの質量は 30 ng ～ 300 ng の範囲）。**標準キットは、酵素による断片化とその後のライゲーション、そして PCR を用いるワークフローに基づいています。 ***すべてのチャート、図およびグラフは Twist の内部データ（2024 年 9 月）に基づいています。研究専用です。診断や臨床用途には使用できません。

ANALYTIC PARTNERS

Curio Genomics

Scale your agrigenomics research with FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit for low-pass sequencing and Curio Genomics for streamlined analysis. Twist's flexible library prep integrates seamlessly with Curio Genomics' platform, which offers high-throughput processing and efficient imputation, enabling cost-effective genotyping across large populations.

Gencove

For streamlined human population genomics, combine the FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit with Gencove's powerful analysis tools. Twist's innovative library preparation, featuring Normalization By Ligation™ (NBL), eliminates bottlenecks while, Gencove's imputation pipeline enables high-confidence variant calling from reduced sequencing coverage, maximizing efficiency and throughput and allowing you to generate valuable insights from genotyping data with exceptional accuracy and reduced sequencing costs.

Curio Genomics

Scale your agrigenomics research with FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit for low-pass sequencing and Curio Genomics for streamlined analysis. Twist's flexible library prep integrates seamlessly with Curio Genomics' platform, which offers high-throughput processing and efficient imputation, enabling cost-effective genotyping across large populations.

Gencove

For streamlined human population genomics, combine the FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit with Gencove's powerful analysis tools. Twist's innovative library preparation, featuring Normalization By Ligation™ (NBL), eliminates bottlenecks while, Gencove's imputation pipeline enables high-confidence variant calling from reduced sequencing coverage, maximizing efficiency and throughput and allowing you to generate valuable insights from genotyping data with exceptional accuracy and reduced sequencing costs.

ご注文

製品 SKU

109220

Twist FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit, 192 Samples

109223

Twist FlexPrep™ UHT LP and Hybridization Kit, 192 Samples

109224

Twist FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit, 1152 Samples

109226

Twist FlexPrep™ UHT LP and Hybridization Kit, 1152 Samples

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