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概要

超ハイスループットシーケンシングを実現するシンプルなワークフロー

Twist の FlexPrepTM UHT ライブラリ調製キットは、集団研究やアグリゲノミクスなど超ハイスループットアプリケーション向けに、従来のマイクロアレイをベースとした技術に代わる NGS(次世代シーケンシング)を可能とします。Twist の Normalization by LigationTM(NBL)技術と酵素による断片化法を組み合わせたこのキットには、幅広い DNA インプットにわたってサンプルの正規化が組み込まれており、通常のサンプル処理ステップのコストと複雑性が軽減されます。早い段階でサンプルをバーコーディングすることで、下流で 12 個の別々のサンプルを 1 つの反応にプールすることができ、より合理的で効率的なワークフローが可能になります。

統合
Normalization by Ligation(NBL)
事前の正規化不要
中間産物の定量不要
幅広いインプット範囲(30 ng ~ 300 ng)のサンプルに対応
サンプルの早期プーリングによるコスト削減
サンプルの早期プーリングによるコスト削減
ライゲーション反応後、96 サンプルを 8 本のチューブに統合
上流の反応ボリュームを少量化
下流の消耗品を削減
超高容量マルチプレキシング
大規模マルチプレックスアッセイが可能な設計
フローセルレーンごとのマルチプレックス化制限を超ハイスループットインデックス化により解消
既存のラボ設備にて12 倍の増加*
ターゲットエンリッチメント 1 反応あたり 96 サンプルをサポート

研究専用です。診断や臨床用途には使用できません。
*8 ウェル対 96 ウェルのワークフローに基づく

Twist Bioscience と Gencove によるヒト集団ゲノミクス研究の促進

アッセイの柔軟性、性能、スケールメリットを実現する Twist の一連の集団ゲノミクスツールについてお読みください。

アプリケーションノートを読む

 

FlexPrep UHT 製品シート

この文書には性能に関する詳細および補足データが記載されています。  


製品シートをダウンロード

 

超ハイスループットシーケンシングへの Twist の手法をご覧ください

 

 

 

ご準備はよろしいですか? 

 

お見積もりはこちら    お問い合わせ  

 

 

FAQ

Normalization by Ligation とは何ですか?
ダウンロード可能なサンプルの種類や種のデモデータが何かを教えてください。
DNA のインプットと量に関する推奨はありますか?
DNA の品質に関する推奨はありますか?
192 サンプル以下のサンプルを一度に調製できますか?

超ハイスループットシーケンシングを実現するシンプルなワークフロー

Twist の FlexPrepTM UHT ライブラリ調製キットは、集団研究やアグリゲノミクスなど超ハイスループットアプリケーション向けに、従来のマイクロアレイをベースとした技術に代わる NGS(次世代シーケンシング)を可能とします。Twist の Normalization by LigationTM(NBL)技術と酵素による断片化法を組み合わせたこのキットには、幅広い DNA インプットにわたってサンプルの正規化が組み込まれており、通常のサンプル処理ステップのコストと複雑性が軽減されます。早い段階でサンプルをバーコーディングすることで、下流で 12 個の別々のサンプルを 1 つの反応にプールすることができ、より合理的で効率的なワークフローが可能になります。

統合
Normalization by Ligation(NBL)
事前の正規化不要
中間産物の定量不要
幅広いインプット範囲(30 ng ~ 300 ng)のサンプルに対応
サンプルの早期プーリングによるコスト削減
サンプルの早期プーリングによるコスト削減
ライゲーション反応後、96 サンプルを 8 本のチューブに統合
上流の反応ボリュームを少量化
下流の消耗品を削減
超高容量マルチプレキシング
大規模マルチプレックスアッセイが可能な設計
フローセルレーンごとのマルチプレックス化制限を超ハイスループットインデックス化により解消
既存のラボ設備にて12 倍の増加*
ターゲットエンリッチメント 1 反応あたり 96 サンプルをサポート
Twist Bioscience と Gencove によるヒト集団ゲノミクス研究の促進

アッセイの柔軟性、性能、スケールメリットを実現する Twist の一連の集団ゲノミクスツールについてお読みください。

アプリケーションノートを読む

 

FlexPrep UHT 製品シート

この文書には性能に関する詳細および補足データが記載されています。  


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研究専用です。診断や臨床用途には使用できません。
*8 ウェル対 96 ウェルのワークフローに基づく

FAQ

Normalization by Ligation とは何ですか?
ダウンロード可能なサンプルの種類や種のデモデータが何かを教えてください。
DNA のインプットと量に関する推奨はありますか?
DNA の品質に関する推奨はありますか?
192 サンプル以下のサンプルを一度に調製できますか?
データ
統合型の正規化によりステップを削減

Twist FlexPrepTM UHT ライブラリ調製キットは、Normalization by LigationTM という新しい手法を採用しており、
事前および途中でのサンプルの定量の必要を無くし、シーケンシングワークフローを効率化します。

キャプション
ワークフローの簡素化

断片化反応とライゲーション反応が、サンプルごとに 1 つのウェルで行われます。ライゲーションで使用するアダプターにはインラインバーコードが含まれており、96 ウェルプレートの 1 列の全 12 ウェルをプーリングできます。それぞれのプールは、プールレベルでのデマルチプレックス化用に PCR で追加されたインデックス(UDI)と共に調製されます。FlexPrep キットからの 1 回のシーケンシング実行で最大 1,152 のサンプルを処理することで、シーケンシングスループットを最大化できます。この効率向上により、コストや消耗品の削減につながります。

図
FlexPrep UHT で正規化を行った収量*

さまざまな量の DNA インプットに対する NGS リード深度の正規化。各ライブラリで同定された総リード数の割合は、ユニークデュアルインデックスおよびインラインバーコードのデマルチプレックス化を行った後に算出されます。完全な正規化が行われた場合の平均値は 1.04%(100/96)です。

図
対象領域で調整可能なカバレッジ*

FlexPrep UHT により、ターゲットエンリッチメント後に均一なカバレッジを持つ複雑性の高いライブラリを作製します。Twist カスタムパネルと組み合わせて、FlexPrep は SNP、k-mer、構造バリアントなど関心のあるゲノム領域に対してカバー領域を調整することが可能です。濃縮後のサンプルは平均 75x のカバレッジにダウンサンプリングされています。主要なターゲットエンリッチメントの Picard 指標を示しています。

96 プレックスのターゲットエンリッチメント
30 ng から 300 ng の gDNA インプットをライブラリ調製に使用
75x のターゲットカバレッジ(生データ)の指標
平均 ± 標準偏差
選択塩基
平均ターゲットカバレッジ
キメラ
Fold-80 ベースペナルティ
10x でカバーされる塩基の割合
20x でカバーされる塩基の割合
0x でカバーされる塩基の割合
79.22% ± 0.54%
32.74 ± 4.78
1.31% ± 0.38%
1.416 ± 0.044
96.06% ± 0.94%
85.41% ± 6.36%
0.43% ± 0.04%

*使用した方法:96 のライブラリを、Twist FlexPrep UHT ライブラリ調製キットおよび FlexPrep ターゲットエンリッチメントプロトコルを用いてヒトゲノム DNA(gDNA)(NA12878)からカスタム 800 kb パネルの 96 プレックスとして調製し、Illumina NextSeq 550 でシーケンシングを行いました。それぞれ 12 サンプルからなる 8 つのライブラリプールを得ました(各ライブラリプール中のインプットの質量は 30 ng ~ 300 ng の範囲)。**標準キットは、酵素による断片化とその後のライゲーション、そして PCR を用いるワークフローに基づいています。 ***すべてのチャート、図およびグラフは Twist の内部データ(2024 年 9 月)に基づいています。研究専用です。診断や臨床用途には使用できません。

統合型の正規化によりステップを削減

Twist FlexPrepTM UHT ライブラリ調製キットは、Normalization by LigationTM という新しい手法を採用しており、
事前および途中でのサンプルの定量の必要を無くし、シーケンシングワークフローを効率化します。

キャプション
ワークフローの簡素化

断片化反応とライゲーション反応が、サンプルごとに 1 つのウェルで行われます。ライゲーションで使用するアダプターにはインラインバーコードが含まれており、96 ウェルプレートの 1 列の全 12 ウェルをプーリングできます。それぞれのプールは、プールレベルでのデマルチプレックス化用に PCR で追加されたインデックス(UDI)と共に調製されます。FlexPrep キットからの 1 回のシーケンシング実行で最大 1,152 のサンプルを処理することで、シーケンシングスループットを最大化できます。この効率向上により、コストや消耗品の削減につながります。

図
FlexPrep UHT で正規化を行った収量*

さまざまな量の DNA インプットに対する NGS リード深度の正規化。各ライブラリで同定された総リード数の割合は、ユニークデュアルインデックスおよびインラインバーコードのデマルチプレックス化を行った後に算出されます。完全な正規化が行われた場合の平均値は 1.04%(100/96)です。

図
対象領域で調整可能なカバレッジ*

FlexPrep UHT により、ターゲットエンリッチメント後に均一なカバレッジを持つ複雑性の高いライブラリを作製します。Twist カスタムパネルと組み合わせて、FlexPrep は SNP、k-mer、構造バリアントなど関心のあるゲノム領域に対してカバー領域を調整することが可能です。濃縮後のサンプルは平均 75x のカバレッジにダウンサンプリングされています。主要なターゲットエンリッチメントの Picard 指標を示しています。

96 プレックスのターゲットエンリッチメント
30 ng から 300 ng の gDNA インプットをライブラリ調製に使用
75x のターゲットカバレッジ(生データ)の指標
平均 ± 標準偏差
選択塩基
平均ターゲットカバレッジ
キメラ
Fold-80 ベースペナルティ
10x でカバーされる塩基の割合
20x でカバーされる塩基の割合
0x でカバーされる塩基の割合
79.22% ± 0.54%
32.74 ± 4.78
1.31% ± 0.38%
1.416 ± 0.044
96.06% ± 0.94%
85.41% ± 6.36%
0.43% ± 0.04%

*使用した方法:96 のライブラリを、Twist FlexPrep UHT ライブラリ調製キットおよび FlexPrep ターゲットエンリッチメントプロトコルを用いてヒトゲノム DNA(gDNA)(NA12878)からカスタム 800 kb パネルの 96 プレックスとして調製し、Illumina NextSeq 550 でシーケンシングを行いました。それぞれ 12 サンプルからなる 8 つのライブラリプールを得ました(各ライブラリプール中のインプットの質量は 30 ng ~ 300 ng の範囲)。**標準キットは、酵素による断片化とその後のライゲーション、そして PCR を用いるワークフローに基づいています。 ***すべてのチャート、図およびグラフは Twist の内部データ(2024 年 9 月)に基づいています。研究専用です。診断や臨床用途には使用できません。

ご注文
製品 SKU

109220

Twist FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit, 192 Samples

109223

Twist FlexPrep™ UHT LP and Hybridization Kit, 192 Samples

109224

Twist FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit, 1152 Samples

109226

Twist FlexPrep™ UHT LP and Hybridization Kit, 1152 Samples
製品 SKU

109220

Twist FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit, 192 Samples

109223

Twist FlexPrep™ UHT LP and Hybridization Kit, 192 Samples

109224

Twist FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit, 1152 Samples

109226

Twist FlexPrep™ UHT LP and Hybridization Kit, 1152 Samples
資料
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