Multiplexed Gene Fragments

概要

Twist のMultiplexed Gene Fragments とは

Twist Multiplexed Gene Fragments は、最大鎖長 500 塩基対の二本鎖遺伝子断片で、ウェルマトリックスあたり 1 つの断片ではなく、プールとしてお届けします。このように断片がプールされた形式のため、断片あたりのコストの高さが目的のバリアント数を得るのに支障となりうる、プライム編集、極めて複雑な CRISPR による機能的スクリーニング、ペプチド工学、タンパク質工学、抗体探索、超並列レポーターアッセイ（MPRA）などのハイスループットスクリーニングアプリケーションが可能になります。

Multiplexed Gene Fragments は、ユーザー定義の塩基配列から遺伝子ごとに最大 500 塩基対の鎖長で合成されます。これらのユーザー定義の配列は、最初に最大鎖長 500 ヌクレオチドのオリゴプールとして合成され、次に二本鎖 DNA に増幅され、慎重に分析されプール内の 90% を超える遺伝子が正しい鎖長を持つことが確認された Multiplexed Gene Fragments としてお届けします。本製品は、迅速・ハイスループットスクリーニング用途に最適化されています。

利点

カスタマイズ可能

これまでにないほどの選択肢で設計し、大規模プール断片を合成

最大鎖長 500 bp でハイスループットスクリーニングを実現

業界をリードする高品質な断片

低エラー率でプール品質を最大化

断片長や GC 含量に左右されない均一性

柔軟性

プール内の正確な配列を完全に制御

コード領域を拡張

Express Genes とは

わずか 4 日で出荷*

詳細をご確認ください

お客様の声

…

Twist's Multiplexed Gene Fragments push the limits of what we can synthesize, while fitting within the limits of what we can sequence. We can now explore sequence space in a targeted, deterministic fashion to build a holistic understanding of the mechanisms of protein binding. We will hopefully leverage that data to make new medicines.

Pierce Ogden

Co-founder and CSO, Manifold Biosciences inc

…

We are trying to tailor make proteins for specific design problems. Twist's 450bp Multiplexed Gene Fragments are the ideal length for us to screen libraries of candidate proteins for ligand binding using yeast display.

Jeffrey Chang

大学院生、Nick Polizzi Laboratory、ハーバード大学およびDana Farber Cancer Center

…

Regulatory elements have been studied deeply with traditional 120 base pair libraries, but in reality many regulatory elements are much longer than that. Using ≥450 base pair Multiplexed Gene Fragments from Twist we are now able to systematically screen for regulatory elements more finely tuned to drive gene expression in our specific cell type.

Josh Tycko

ハーバード大学神経生物学部ポスドク研究員

Twist のMultiplexed Gene Fragments とは

Twist Multiplexed Gene Fragments は、最大鎖長 500 塩基対の二本鎖遺伝子断片で、ウェルマトリックスあたり 1 つの断片ではなく、プールとしてお届けします。このように断片がプールされた形式のため、断片あたりのコストの高さが目的のバリアント数を得るのに支障となりうる、プライム編集、極めて複雑な CRISPR による機能的スクリーニング、ペプチド工学、タンパク質工学、抗体探索、超並列レポーターアッセイ（MPRA）などのハイスループットスクリーニングアプリケーションが可能になります。

Multiplexed Gene Fragments は、ユーザー定義の塩基配列から遺伝子ごとに最大 500 塩基対の鎖長で合成されます。これらのユーザー定義の配列は、最初に最大鎖長 500 ヌクレオチドのオリゴプールとして合成され、次に二本鎖 DNA に増幅され、慎重に分析されプール内の 90% を超える遺伝子が正しい鎖長を持つことが確認された Multiplexed Gene Fragments としてお届けします。本製品は、迅速・ハイスループットスクリーニング用途に最適化されています。

利点

カスタマイズ可能

これまでにないほどの選択肢で設計し、大規模プール断片を合成

最大鎖長 500 bp でハイスループットスクリーニングを実現

業界をリードする高品質な断片

低エラー率でプール品質を最大化

断片長や GC 含量に左右されない均一性

柔軟性

プール内の正確な配列を完全に制御

コード領域を拡張

Express Genes とは

わずか 4 日で出荷*

詳細をご確認ください

お客様の声

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Twist's Multiplexed Gene Fragments push the limits of what we can synthesize, while fitting within the limits of what we can sequence. We can now explore sequence space in a targeted, deterministic fashion to build a holistic understanding of the mechanisms of protein binding. We will hopefully leverage that data to make new medicines.

Pierce Ogden

Co-founder and CSO, Manifold Biosciences inc

…

We are trying to tailor make proteins for specific design problems. Twist's 450bp Multiplexed Gene Fragments are the ideal length for us to screen libraries of candidate proteins for ligand binding using yeast display.

Jeffrey Chang

大学院生、Nick Polizzi Laboratory、ハーバード大学およびDana Farber Cancer Center

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Regulatory elements have been studied deeply with traditional 120 base pair libraries, but in reality many regulatory elements are much longer than that. Using ≥450 base pair Multiplexed Gene Fragments from Twist we are now able to systematically screen for regulatory elements more finely tuned to drive gene expression in our specific cell type.

Josh Tycko

ハーバード大学神経生物学部ポスドク研究員

MGF データ

マルチプレックス化した二本鎖DNA断片のプール

Twist の Multiplexed Gene Fragments のプールは、ご注文いただいたすべての配列を包括的に表現することで、バリアント構築を正確に制御し、より標的を絞った合理的なスクリーニングを実現します。

500 bp のdual gRNA バリアントの Multiplexed Gene Fragments プールは、ドロップアウトを最小限に抑えた完全な断片表現を示しており（図 1）、これは 450 bp のtriple gRNA バリアントのプール（図 2）でも同様です。最後に、最大 80% の GC 含量を持つ断片など、広範囲の GC 含量を含むバリアントの Multiplexed Gene Fragments プールは、高い表現性を示し、バイアスが最小限に抑えられます（図 3）。

図 1．500 bp の Multiplexed Gene Fragments の増幅プールについて、マッピングされた各 dual gRNA バリアント（X 軸）のリードカウントのグラフ。

図 2．450 bp の Multiplexed Gene Fragments の増幅プールについて、マッピングされた各 triple gRNA バリアント（X軸）のリードカウントのグラフ。

図 3．鎖長 500 bp の Multiplexed Gene Fragments の増幅プールの GC プロットが作成され、最高 80% の広範囲の GC 含量においてバイアスが最小限に抑えられることが示された。X 軸は、GC 含量の異なる配列の 14 グループのカテゴリー。Y 軸はリードカウント。

マルチプレックス化した二本鎖DNA断片のプール

Twist の Multiplexed Gene Fragments のプールは、ご注文いただいたすべての配列を包括的に表現することで、バリアント構築を正確に制御し、より標的を絞った合理的なスクリーニングを実現します。

500 bp のdual gRNA バリアントの Multiplexed Gene Fragments プールは、ドロップアウトを最小限に抑えた完全な断片表現を示しており（図 1）、これは 450 bp のtriple gRNA バリアントのプール（図 2）でも同様です。最後に、最大 80% の GC 含量を持つ断片など、広範囲の GC 含量を含むバリアントの Multiplexed Gene Fragments プールは、高い表現性を示し、バイアスが最小限に抑えられます（図 3）。

図 1．500 bp の Multiplexed Gene Fragments の増幅プールについて、マッピングされた各 dual gRNA バリアント（X 軸）のリードカウントのグラフ。

図 2．450 bp の Multiplexed Gene Fragments の増幅プールについて、マッピングされた各 triple gRNA バリアント（X軸）のリードカウントのグラフ。

図 3．鎖長 500 bp の Multiplexed Gene Fragments の増幅プールの GC プロットが作成され、最高 80% の広範囲の GC 含量においてバイアスが最小限に抑えられることが示された。X 軸は、GC 含量の異なる配列の 14 グループのカテゴリー。Y 軸はリードカウント。

仕様

製品仕様

収量

増幅 dsDNA、200 ng 以上

納期

8 ～ 12 営業日

納品形態

乾燥状態の dsDNA（2 mL チューブにプール）

鎖長

301 ～ 500 bp

プールサイズ

最小数・最大数の制限なし

均一性

90% の配列が平均値の 3 倍以内*

品質管理（QC）

断片解析によりプール中の遺伝子の 90% 超が正しい鎖長を持つことを確保

エラー率

1：2000 塩基（元のプール合成より、増幅前まで）

*ご利用条件：Multiplexed Gene Fragments の標準納期は、8 ～ 12 営業日です。これは配列の長さや複雑さによって変動します。Multiplexed Gene Fragments の鎖長は最大 500 塩基対、可変領域には最大 460 bp が割り当てられ、プライマー領域には最小 40 bp が確保されます。品質管理試験により、プール内の 90% を超える遺伝子配列がユーザー定義の鎖長であることが確保されます。

研究専用です。診断用には使用できません。