概要 スクリーニング用の酵素の選定方法 資料 FAQ
概要

未開拓の酵素配列空間を開放し、最適な探索を可能に

当社の新規酵素配列は、多様な未培養微生物単細胞ゲノムから同定され、構造予測、構造に基づくクラスタリング及びフィルタリングをベースとした機械学習支援モデルを用いて、望ましい特性について選択されています。このような配列は他では見つけられないでしょう。


トランスアミナーゼ(TA)は、アミンドナーからケトンまたはアルデヒドへのアミン基の転移を触媒する酵素です。プロキラルケトンの立体選択的アミノ化を促進するこの能力は、医薬品製造において有用であり、医薬品有効成分(API)の構成成分としてキラルアミンの需要が高い製薬業界では貴重な存在です。


当社は、医薬品製造プロセスに有用な、多種多様な基質にわたって様々な極限条件下で活性を維持する TA 酵素のサブセットを同定し、絞り込みました。


弊社のスクリーニングキットは、機能面で重要な配列の選択や、これらを下流の酵素工学のリソースと組み合わせることを可能にし、より効率的なタンパク質工学の経路を提供する可能性を秘めています。

スクリーニングのための酵素の選択方法

bitBiome bit-GEM データベースは、検索可能で有用性の高い微生物ゲノム配列の主要なリソースです。bit-GEM データベースには、土壌、温泉、海水、鉱山、極限環境等の自然環境から採取したサンプルなど、自然界で最も強力な微生物資源を利用し、bitBiome シングルセルシーケンシングプラットフォームによって取得された膨大な遺伝子配列が含まれています。このシーケンシング法は、より深いゲノムカバレッジを保証し、未培養微生物の発見を可能にします。これらの配列は、公知の領域にある配列との類似性が低いため、その配列空間内で操作する自由が得られます。

未開拓の酵素配列空間を開放する
未開拓の酵素配列空間を開放する
事前に活性スクリーニングを行った数千種類の酵素候補物質
配列の多様性の高さで特定のニーズに対応可能
公知ではない新規配列で、自由な操作が可能
エンジニアリングの取り組みを最大化
エンジニアリングの取り組みを最大化
ヒット化合物の同定に必要な新規トランスアミナーゼ変異体を事前に選別してスクリーニング
取り扱いが難しい大きい基質を含む、多様な基質特異性 
専門家に相談可能
専門家に相談可能
 bitBiome + Twist は、変異体ライブラリの生成、最適化、試験に必要なすべてのリソースを提供
酵素工学の取り組みを支援する専門家に容易に連絡可能
Twist + bitBiome で迅速なスクリーニングを体験

酵素スクリーニング 48 種類のスクリーニング用酵素

翌日発送 翌日発送

スケールアップ可能 スケールアップ可能

お問い合わせ

未開拓の酵素配列空間を開放し、最適な探索を可能に

当社の新規酵素配列は、多様な未培養微生物単細胞ゲノムから同定され、構造予測、構造に基づくクラスタリング及びフィルタリングをベースとした機械学習支援モデルを用いて、望ましい特性について選択されています。このような配列は他では見つけられないでしょう。


トランスアミナーゼ(TA)は、アミンドナーからケトンまたはアルデヒドへのアミン基の転移を触媒する酵素です。プロキラルケトンの立体選択的アミノ化を促進するこの能力は、医薬品製造において有用であり、医薬品有効成分(API)の構成成分としてキラルアミンの需要が高い製薬業界では貴重な存在です。


当社は、医薬品製造プロセスに有用な、多種多様な基質にわたって様々な極限条件下で活性を維持する TA 酵素のサブセットを同定し、絞り込みました。


弊社のスクリーニングキットは、機能面で重要な配列の選択や、これらを下流の酵素工学のリソースと組み合わせることを可能にし、より効率的なタンパク質工学の経路を提供する可能性を秘めています。

スクリーニングのための酵素の選択方法

bitBiome bit-GEM データベースは、検索可能で有用性の高い微生物ゲノム配列の主要なリソースです。bit-GEM データベースには、土壌、温泉、海水、鉱山、極限環境等の自然環境から採取したサンプルなど、自然界で最も強力な微生物資源を利用し、bitBiome シングルセルシーケンシングプラットフォームによって取得された膨大な遺伝子配列が含まれています。このシーケンシング法は、より深いゲノムカバレッジを保証し、未培養微生物の発見を可能にします。これらの配列は、公知の領域にある配列との類似性が低いため、その配列空間内で操作する自由が得られます。

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事前に活性スクリーニングを行った数千種類の酵素候補物質
配列の多様性の高さで特定のニーズに対応可能
公知ではない新規配列で、自由な操作が可能
エンジニアリングの取り組みを最大化
エンジニアリングの取り組みを最大化
ヒット化合物の同定に必要な新規トランスアミナーゼ変異体を事前に選別してスクリーニング
取り扱いが難しい大きい基質を含む、多様な基質特異性 
専門家に相談可能
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 bitBiome + Twist は、変異体ライブラリの生成、最適化、試験に必要なすべてのリソースを提供
酵素工学の取り組みを支援する専門家に容易に連絡可能
スクリーニングのための酵素の選択方法

スクリーニング用の酵素の選定方法

bit-GEM データベースには、土壌、温泉、海水、鉱山、極限環境等の自然環境から採取したサンプルなど、自然界で最も強力な微生物資源を利用し、bitBiome シングルセルシーケンシングプラットフォームによって取得された膨大な遺伝子配列が含まれています。このシーケンシング法は、より深いゲノムカバレッジを保証し、未培養微生物の発見を可能にします。これらの配列は、これらの配列は、公知の領域にある配列との類似性が低いため、その配列空間内でより自由に操作することができます。このキットで提供される 48 種類の酵素は、Twist の DNA 合成能力だけでなく、機能的配列空間を洗練させるために協力して実施したバイオインフォマティクスの取り組みにより選別されました。
 

キットに含まれる酵素の選定方法

19 種類の基質を用いて、活性を持つ計 369 種類のトランスアミナーゼを同定しました。そのうち 273 種類の酵素は 10% DMSO 中で活性を示し、30 種類の酵素は 60 ℃ で活性を示しました。最後に、酵素の pH 感受性と選択性について試験を行いました。

トランスアミナーゼスクリーニングの基準

トランスアミナーゼスクリーニングの基準

 

以下は、前述のさまざまな条件(DMSO の種々の割合、有機溶媒、温度、pH レベル)で、さまざまな基質に対して試験を行った酵素の分析結果です。

酵素数グラフ

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スクリーニング用の酵素の選定方法

bit-GEM データベースには、土壌、温泉、海水、鉱山、極限環境等の自然環境から採取したサンプルなど、自然界で最も強力な微生物資源を利用し、bitBiome シングルセルシーケンシングプラットフォームによって取得された膨大な遺伝子配列が含まれています。このシーケンシング法は、より深いゲノムカバレッジを保証し、未培養微生物の発見を可能にします。これらの配列は、これらの配列は、公知の領域にある配列との類似性が低いため、その配列空間内でより自由に操作することができます。このキットで提供される 48 種類の酵素は、Twist の DNA 合成能力だけでなく、機能的配列空間を洗練させるために協力して実施したバイオインフォマティクスの取り組みにより選別されました。
 

キットに含まれる酵素の選定方法

19 種類の基質を用いて、活性を持つ計 369 種類のトランスアミナーゼを同定しました。そのうち 273 種類の酵素は 10% DMSO 中で活性を示し、30 種類の酵素は 60 ℃ で活性を示しました。最後に、酵素の pH 感受性と選択性について試験を行いました。

トランスアミナーゼスクリーニングの基準

トランスアミナーゼスクリーニングの基準

 

以下は、前述のさまざまな条件(DMSO の種々の割合、有機溶媒、温度、pH レベル)で、さまざまな基質に対して試験を行った酵素の分析結果です。

酵素数グラフ

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酵素スクリーニング 48 種類のスクリーニング用酵素

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スケールアップ可能 スケールアップ可能

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資料
FAQ

一般情報

酵素の純度を教えてください。
酵素の保存可能期間はどのくらいですか?
酵素の選択性について教えてください。
酵素が働く標準的なパラメータについて教えてください。

スクリーニング実験の計画

コントロール用の基質としては何を使えばよいですか?
進化型酵素の標準的な反応条件を教えてください。
酵素にはどのような緩衝液が使えますか?
酵素に使用できる溶媒は何ですか?
pH に対する耐性について教えてください。
温度に対する耐性について教えてください。

トラブルシューティング

基質が水に非常に溶けにくい場合はどうすればよいですか?
活性が低い、または全くない場合はどうすればよいですか?
ヒットの数が多すぎて、それらの違いが簡単に判断できない場合はどうすればよいですか?
ヒットが同定され、反応の最適化とスケールアップが必要な場合はどうすればよいですか?
別のアミンドナーが必要な場合はどうすればよいですか?
他に質問がある場合はどうすればよいですか?

一般的なスクリーニングの質問

先週、緩衝液と補酵素液を準備しました。まだ使えますか?
水性媒体への基質の溶解性に問題があり、反応混合物が濁っている場合はどうすればよいですか?
試薬を加える順番はありますか?

最適化

反応条件(温度、pH、共溶媒)を最適化する最善の方法について教えてください。

品質管理

本キットに含まれる各酵素の活性はどのようにして確認していますか?
各キットの酵素粉末量はどのように確認していますか?
溶解液の粉末に生きた発現宿主が含まれていないことをどのように確認していますか?
各バッチの保存可能期間はどのように確認していますか?
なぜ、生きた発現宿主が存在しないことを確認することが重要なのでしょうか?
比色法とは何であり、なぜ使用されるのでしょうか?
バッチが品質基準を満たさない場合はどうなりますか?
品質管理プロセスの正確性をどのように確保していますか?
本酵素キットの特定のバッチに関する品質管理報告書を請求できますか?

一般情報

酵素の純度を教えてください。
酵素の保存可能期間はどのくらいですか?
酵素の選択性について教えてください。
酵素が働く標準的なパラメータについて教えてください。

スクリーニング実験の計画

コントロール用の基質としては何を使えばよいですか?
進化型酵素の標準的な反応条件を教えてください。
酵素にはどのような緩衝液が使えますか?
酵素に使用できる溶媒は何ですか?
pH に対する耐性について教えてください。
温度に対する耐性について教えてください。

トラブルシューティング

基質が水に非常に溶けにくい場合はどうすればよいですか?
活性が低い、または全くない場合はどうすればよいですか?
ヒットの数が多すぎて、それらの違いが簡単に判断できない場合はどうすればよいですか?
ヒットが同定され、反応の最適化とスケールアップが必要な場合はどうすればよいですか?
別のアミンドナーが必要な場合はどうすればよいですか?
他に質問がある場合はどうすればよいですか?

一般的なスクリーニングの質問

先週、緩衝液と補酵素液を準備しました。まだ使えますか?
水性媒体への基質の溶解性に問題があり、反応混合物が濁っている場合はどうすればよいですか?
試薬を加える順番はありますか?

最適化

反応条件(温度、pH、共溶媒)を最適化する最善の方法について教えてください。

品質管理

本キットに含まれる各酵素の活性はどのようにして確認していますか?
各キットの酵素粉末量はどのように確認していますか?
溶解液の粉末に生きた発現宿主が含まれていないことをどのように確認していますか?
各バッチの保存可能期間はどのように確認していますか?
なぜ、生きた発現宿主が存在しないことを確認することが重要なのでしょうか?
比色法とは何であり、なぜ使用されるのでしょうか?
バッチが品質基準を満たさない場合はどうなりますか?
品質管理プロセスの正確性をどのように確保していますか?
本酵素キットの特定のバッチに関する品質管理報告書を請求できますか?
トランスアミナーゼの配列空間を探索
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