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Présentation

Présentation des fragments de gènes multiplex Twist

Les fragments de gènes multiplex Twist sont des séquences de fragments de gènes à double brin d’une longueur maximale de 500 paires de bases qui sont livrées sous forme de pool au lieu d’un fragment par matrice de puits. Ce format groupé de fragments permet des applications de criblage à haut débit telles que l’édition primaire, le criblage fonctionnel extrêmement complexe basé sur CRISPR, l’ingénierie des peptides et des protéines, la recherche d’anticorps et les tests de rapporteurs massivement parallèles (MPRA), où le coût par fragment peut être un obstacle au nombre désiré de variants.

Les fragments de gènes multiplex sont synthétisés à partir de séquences définies par l’utilisateur dans des longueurs allant jusqu’à 500 paires de bases par gène. Ces séquences définies par l’utilisateur sont initialement synthétisées dans des pools d’oligonucléotides d’une longueur maximale de 500 nucléotides, puis amplifiées dans de l’ADN double brin et livrées sous forme de fragments de gènes multiplex qui ont été soigneusement analysés pour s’assurer que >90 % des gènes du pool sont de la bonne longueur. Ce produit est optimisé pour les applications de criblage rapide à haut débit.

Personnalisable 
Personnalisable 
Synthèse de fragments groupés à grande échelle avec des options de conception sans précédent
Longueurs allant jusqu’à 500 pb pour le criblage à haut débit
Fragments de haute qualité à la pointe de l’industrie 
Fragments de haute qualité à la pointe de l’industrie 
Qualité maximale du pool avec de faibles taux d’erreur
Représentation homogène des longueurs de fragments et des teneurs en GC
Flexibilité 
Flexibilité 
Contrôle absolu sur les séquences précises de votre pool
Région codante élargie

Témoignages

Les fragments de gènes multiplexés de Twist repoussent les limites de ce que nous pouvons synthétiser, tout en s’inscrivant dans les limites de ce que nous sommes capables de séquencer. Nous pouvons désormais explorer les régions de séquence de manière ciblée et déterministe pour bâtir une compréhension holistique des mécanismes de liaison des protéines. Nous espérons tirer parti de ces données pour créer de nouveaux médicaments.
Pierce Ogden
Cofondateur et directeur scientifique, Manifold Biosciences Inc.
Nous essayons de créer des protéines sur mesure pour des problèmes de conception spécifiques. Les fragments de gènes multiplexés de 450 pb de Twist ont la longueur idéale pour nous permettre de cribler des banques de protéines candidates à la liaison de ligands à l’aide d’une expression de levure.
Jeffrey Chang
Étudiant diplômé, laboratoire Nick Polizzi, Université de Harvard et Dana Farber Cancer Center
Les éléments régulateurs ont été étudiés en profondeur avec des banques traditionnelles de 120 paires de bases, mais en réalité, de nombreux éléments régulateurs sont beaucoup plus longs que cela. En utilisant les fragments de gènes multiplexés ≥ 450 paires de bases de Twist, nous sommes désormais en mesure de rechercher systématiquement des éléments régulateurs plus finement adaptés pour piloter l’expression des gènes dans notre type de cellule spécifique.
Josh Tycko
Chercheur postdoctoral, Département de neurobiologie, Harvard Medical School

Présentation des fragments de gènes multiplex Twist

Les fragments de gènes multiplex Twist sont des séquences de fragments de gènes à double brin d’une longueur maximale de 500 paires de bases qui sont livrées sous forme de pool au lieu d’un fragment par matrice de puits. Ce format groupé de fragments permet des applications de criblage à haut débit telles que l’édition primaire, le criblage fonctionnel extrêmement complexe basé sur CRISPR, l’ingénierie des peptides et des protéines, la recherche d’anticorps et les tests de rapporteurs massivement parallèles (MPRA), où le coût par fragment peut être un obstacle au nombre désiré de variants.

Les fragments de gènes multiplex sont synthétisés à partir de séquences définies par l’utilisateur dans des longueurs allant jusqu’à 500 paires de bases par gène. Ces séquences définies par l’utilisateur sont initialement synthétisées dans des pools d’oligonucléotides d’une longueur maximale de 500 nucléotides, puis amplifiées dans de l’ADN double brin et livrées sous forme de fragments de gènes multiplex qui ont été soigneusement analysés pour s’assurer que >90 % des gènes du pool sont de la bonne longueur. Ce produit est optimisé pour les applications de criblage rapide à haut débit.

Personnalisable 
Personnalisable 
Synthèse de fragments groupés à grande échelle avec des options de conception sans précédent
Longueurs allant jusqu’à 500 pb pour le criblage à haut débit
Fragments de haute qualité à la pointe de l’industrie 
Fragments de haute qualité à la pointe de l’industrie 
Qualité maximale du pool avec de faibles taux d’erreur
Représentation homogène des longueurs de fragments et des teneurs en GC
Flexibilité 
Flexibilité 
Contrôle absolu sur les séquences précises de votre pool
Région codante élargie
Présentation des gènes Express Twist

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Témoignages

Les fragments de gènes multiplexés de Twist repoussent les limites de ce que nous pouvons synthétiser, tout en s’inscrivant dans les limites de ce que nous sommes capables de séquencer. Nous pouvons désormais explorer les régions de séquence de manière ciblée et déterministe pour bâtir une compréhension holistique des mécanismes de liaison des protéines. Nous espérons tirer parti de ces données pour créer de nouveaux médicaments.
Pierce Ogden
Cofondateur et directeur scientifique, Manifold Biosciences Inc.
Nous essayons de créer des protéines sur mesure pour des problèmes de conception spécifiques. Les fragments de gènes multiplexés de 450 pb de Twist ont la longueur idéale pour nous permettre de cribler des banques de protéines candidates à la liaison de ligands à l’aide d’une expression de levure.
Jeffrey Chang
Étudiant diplômé, laboratoire Nick Polizzi, Université de Harvard et Dana Farber Cancer Center
Les éléments régulateurs ont été étudiés en profondeur avec des banques traditionnelles de 120 paires de bases, mais en réalité, de nombreux éléments régulateurs sont beaucoup plus longs que cela. En utilisant les fragments de gènes multiplexés ≥ 450 paires de bases de Twist, nous sommes désormais en mesure de rechercher systématiquement des éléments régulateurs plus finement adaptés pour piloter l’expression des gènes dans notre type de cellule spécifique.
Josh Tycko
Chercheur postdoctoral, Département de neurobiologie, Harvard Medical School
DONNÉES RELATIVES AUX FGM
Un pool de fragments de gènes multiplex

Les pools de fragments de gènes multiplex Twist permettent une représentation complète de chaque séquence commandée, afin d’assurer un contrôle précis de la construction des variants pour un criblage plus ciblé et plus rationnel.

Un pool de fragments de gènes multiplex de variants à double ARNg de 500 pb montre une représentation complète des fragments avec des absences d’amplification minimales (Fig. 1), tout comme un pool de variants à triple ARNg de 450 pb (Fig. 2). Enfin, un pool de fragments de gènes multiplex avec des variants contenant des GC sur une large gamme, y compris des fragments atteignant 80% de GC, montre une forte représentation et un biais minimal (Fig. 3).

g1

Figure 1. Graphique du nombre de lectures de chacun des variants à double ARNg cartographiés (axe des abscisses) pour un pool amplifié de fragments de gènes multiplex de 500 pb.

 

g2

Figure 2. Graphique du nombre de lectures de chacun des variants à triple ARNg cartographiés (axe des abscisses) pour un pool amplifié de fragments de gènes multiplex de 450 pb.
 

g3


Figure 3. Création de diagrammes GC d’un pool amplifié de fragments de gènes multiplex d’une longueur de 500 pb, montrant un biais minimal parmi une large gamme de teneur en GC allant jusqu’à 80 %. L’axe des abscisses représente les catégories de 14 groupes de séquences ayant des teneurs en GC différentes. L’axe des ordonnées représente le nombre de lectures.

Un pool de fragments de gènes multiplex

Les pools de fragments de gènes multiplex Twist permettent une représentation complète de chaque séquence commandée, afin d’assurer un contrôle précis de la construction des variants pour un criblage plus ciblé et plus rationnel.

Un pool de fragments de gènes multiplex de variants à double ARNg de 500 pb montre une représentation complète des fragments avec des absences d’amplification minimales (Fig. 1), tout comme un pool de variants à triple ARNg de 450 pb (Fig. 2). Enfin, un pool de fragments de gènes multiplex avec des variants contenant des GC sur une large gamme, y compris des fragments atteignant 80% de GC, montre une forte représentation et un biais minimal (Fig. 3).

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Figure 1. Graphique du nombre de lectures de chacun des variants à double ARNg cartographiés (axe des abscisses) pour un pool amplifié de fragments de gènes multiplex de 500 pb.

 

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Figure 2. Graphique du nombre de lectures de chacun des variants à triple ARNg cartographiés (axe des abscisses) pour un pool amplifié de fragments de gènes multiplex de 450 pb.
 

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Figure 3. Création de diagrammes GC d’un pool amplifié de fragments de gènes multiplex d’une longueur de 500 pb, montrant un biais minimal parmi une large gamme de teneur en GC allant jusqu’à 80 %. L’axe des abscisses représente les catégories de 14 groupes de séquences ayant des teneurs en GC différentes. L’axe des ordonnées représente le nombre de lectures.

Spécifications
Spécifications du produit

Rendement

Minimum de 200 ng d’ADNdb amplifié

Délai de traitement

8 à 12 jours ouvrables

Format de livraison

ADNdb déshydraté, regroupé dans un tube de 2 ml

Longueur

301 à 500 pb

Taille du pool

Pas de minimum, pas de maximum

Uniformité

90 % des séquences se situent à ~3x de la moyenne*

Contrôle de la qualité (CQ)

Analyse des fragments pour s’assurer que >90 % des gènes d’un pool ont la bonne longueur*

Taux d’erreur

1:2000 nt (à partir de la synthèse du pool original, avant amplification)

*Conditions générales : Pour les fragments de gènes multiplex, le délai de traitement standard est de 8 à 12 jours ouvrables. Cela varie selon la complexité et la longueur de la séquence. La longueur des fragments de gènes multiplex peut atteindre 500 paires de bases, avec jusqu’à 460 pb allouées pour la région variable et un minimum de 40 pb conservées pour la région amorce. Les tests de contrôle de la qualité garantissent que >90 % des séquences de gènes d’un pool seront de la longueur définie par l’utilisateur.



Réservé à l’utilisation dans le cadre de la recherche. Non destiné à être utilisé dans des procédures de diagnostic.

Spécifications du produit

Rendement

Minimum de 200 ng d’ADNdb amplifié

Délai de traitement

8 à 12 jours ouvrables

Format de livraison

ADNdb déshydraté, regroupé dans un tube de 2 ml

Longueur

301 à 500 pb

Taille du pool

Pas de minimum, pas de maximum

Uniformité

90 % des séquences se situent à ~3x de la moyenne*

Contrôle de la qualité (CQ)

Analyse des fragments pour s’assurer que >90 % des gènes d’un pool ont la bonne longueur*

Taux d’erreur

1:2000 nt (à partir de la synthèse du pool original, avant amplification)

*Conditions générales : Pour les fragments de gènes multiplex, le délai de traitement standard est de 8 à 12 jours ouvrables. Cela varie selon la complexité et la longueur de la séquence. La longueur des fragments de gènes multiplex peut atteindre 500 paires de bases, avec jusqu’à 460 pb allouées pour la région variable et un minimum de 40 pb conservées pour la région amorce. Les tests de contrôle de la qualité garantissent que >90 % des séquences de gènes d’un pool seront de la longueur définie par l’utilisateur.



Réservé à l’utilisation dans le cadre de la recherche. Non destiné à être utilisé dans des procédures de diagnostic.

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Commençons

  • Étape 1 : Remplir le formulaire de contact sur cette page
  • Étape 2 : Télécharger le formulaire de demande de FGM et remplir tous les champs du formulaire pour la conception de vos FGM.
  • Étape 3 : Chargez le formulaire de demande complété dans l’onglet « Envoyer fichier » de cette page.

En cas de questions, ne pas hésiter à nous envoyer un e-mail à [email protected].

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Prêt à envoyer ?

  • Étape 1 : Charger le formulaire de demande complété
  • Étape 2 : Les experts de l’équipe chargée des FGM examinent votre projet.
  • Étape 3 : L’équipe chargée des FGM valide le projet et vous contacte pour vous proposer un devis.
  • Étape 4 : Une fois le devis accepté par le client, l’équipe chargée des FGM envoie le projet à l’équipe de production.

En cas de questions, ne pas hésiter à nous envoyer un e-mail à [email protected].

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