概要 ご注文 資料
概要

CNV 検出を改善

エクソームシーケンスは、ゲノムのタンパク質コード領域を解析する強力な手法であり、ヒトゲノム全塩基数のおよそ1~2%をカバーします。これにより全ゲノムシーケンスより効率的に遺伝解析が行えますが、大きな遺伝子間領域が対象外になるため、コピー数変異(CNV)の検出が難しくなる場合があります。

CNVは多くの遺伝性疾患で重要な役割を果たしますが、標準的なエクソームシーケンスでは等間隔のプローブが不足し、信頼性の高い検出が困難です。

Twist CNVバックボーンスパイクインパネルは、ゲノム全体に等間隔のプローブを追加することでCNV検出を強化するよう設計されています。これらのパネルは100 kb、50 kb、25 kbという3段階の解像度で提供され、研究者は目的に合わせてCNV解析を微調整できます。

CNVバックボーンスパイクインパネルをエクソームワークフローに組み込むのは簡単です。お手持ちの—エクソームパネルに混ぜ、Twistの標準ターゲットエンリッチメントプロトコールに従うだけです。

CNVの解像度を微調整
CNVの解像度を微調整
100 kb(低解像度)、50 kb(中解像度)、25 kb(高解像度)から選択可能
遺伝子間領域に戦略的にプローブをタイリングすることで、CNV検出性能を向上
エクソームパネルに容易にスパイクインするだけで、全エクソームシーケンスを強化
シームレスな統合
Twistエクソームソリューションとのシームレスな統合
Twist Exome 2.0 + Comprehensive Spike-inパネルとの組み合わせを想定して設計
2反応(16サンプル)と12反応(96サンプル)のサイズでご用意

必要なCNV解像度を選択してください

CNVバックボーンスパイクインパネル:
25 kb
50 kb
100 kb

パネル設計サイズ(Mb)

8.32

3.33

1.39

検出されたSNVおよびINDEL数

265138

207765

181956

検出されたすべてのCNV数

472

446

411

50 kb未満のCNV数

417

385

361

Mean Target Coverage

150

171

161

 

表1. Twist CNVバックボーンスパイクインパネルのデータ例。 CNVを含むことがわかっている詳細なサンプルセット(1)と、12名の健常者ベースラインセットを用いて、Illumina NovaSeq 6000で2×150リードのシーケンスを実施しました。Twist Exome 2.0プラスComprehensive Spike-inにスパイクインした各パネルについて、プローブ密度ごとのSNV・INDEL・CNVの平均検出数とシーケンス深度を測定しました。CNVコールは市販のソフトウェアソリューション(2)を用いて行いました。
 

(1) Coriell InstituteのCNVPANEL01 - Human CNV Reference Panel。
(2) eVai Platform(セカンダリワークフロー)、enGenome Software。 

CNV 検出を改善

エクソームシーケンスは、ゲノムのタンパク質コード領域を解析する強力な手法であり、ヒトゲノム全塩基数のおよそ1~2%をカバーします。これにより全ゲノムシーケンスより効率的に遺伝解析が行えますが、大きな遺伝子間領域が対象外になるため、コピー数変異(CNV)の検出が難しくなる場合があります。

CNVは多くの遺伝性疾患で重要な役割を果たしますが、標準的なエクソームシーケンスでは等間隔のプローブが不足し、信頼性の高い検出が困難です。

Twist CNVバックボーンスパイクインパネルは、ゲノム全体に等間隔のプローブを追加することでCNV検出を強化するよう設計されています。これらのパネルは100 kb、50 kb、25 kbという3段階の解像度で提供され、研究者は目的に合わせてCNV解析を微調整できます。

CNVバックボーンスパイクインパネルをエクソームワークフローに組み込むのは簡単です。お手持ちの—エクソームパネルに混ぜ、Twistの標準ターゲットエンリッチメントプロトコールに従うだけです。

CNVの解像度を微調整
CNVの解像度を微調整
100 kb(低解像度)、50 kb(中解像度)、25 kb(高解像度)から選択可能
遺伝子間領域に戦略的にプローブをタイリングすることで、CNV検出性能を向上
エクソームパネルに容易にスパイクインするだけで、全エクソームシーケンスを強化
シームレスな統合
Twistエクソームソリューションとのシームレスな統合
Twist Exome 2.0 + Comprehensive Spike-inパネルとの組み合わせを想定して設計
2反応(16サンプル)と12反応(96サンプル)のサイズでご用意

必要なCNV解像度を選択してください

CNVバックボーンスパイクインパネル:
25 kb
50 kb
100 kb

パネル設計サイズ(Mb)

8.32

3.33

1.39

検出されたSNVおよびINDEL数

265138

207765

181956

検出されたすべてのCNV数

472

446

411

50 kb未満のCNV数

417

385

361

Mean Target Coverage

150

171

161

 

表1. Twist CNVバックボーンスパイクインパネルのデータ例。 CNVを含むことがわかっている詳細なサンプルセット(1)と、12名の健常者ベースラインセットを用いて、Illumina NovaSeq 6000で2×150リードのシーケンスを実施しました。Twist Exome 2.0プラスComprehensive Spike-inにスパイクインした各パネルについて、プローブ密度ごとのSNV・INDEL・CNVの平均検出数とシーケンス深度を測定しました。CNVコールは市販のソフトウェアソリューション(2)を用いて行いました。
 

(1) Coriell InstituteのCNVPANEL01 - Human CNV Reference Panel。
(2) eVai Platform(セカンダリワークフロー)、enGenome Software。 

ご注文
高解像度:

110756

Twist 25kb CNVバックボーンスパイクインパネル、2反応キット

110757

Twist 25kb CNVバックボーンスパイクインパネル、12反応キット
中解像度:

110758

Twist 50kb CNVバックボーンスパイクインパネル、2反応キット

110759

Twist 50kb CNVバックボーンスパイクインパネル、12反応キット
低解像度:

110760

Twist 100kb CNVバックボーンスパイクインパネル、2反応キット

110761

Twist 100kb CNVバックボーンスパイクインパネル、12反応キット
エクソームパネル

104132

Twist Exome 2.0, 2 Reactions, Kit

104134

Twist Exome 2.0, 12 Reactions, Kit

104136

Twist Exome 2.0, 96 Reactions, Kit

105034

Twist Exome 2.0 plus Comprehensive Exome Spike-in, 2 Reactions

105035

Twist Exome 2.0 plus Comprehensive Exome Spike-in, 12 Reactions

105036

Twist Exome 2.0 plus Comprehensive Exome Spike-in, 96 Reactions

*研究専用です。Twist のウェブサイトおよび製品をご利用になる場合、Twist の利用規約が適用されます。 

高解像度:

110756

Twist 25kb CNVバックボーンスパイクインパネル、2反応キット

110757

Twist 25kb CNVバックボーンスパイクインパネル、12反応キット
中解像度:

110758

Twist 50kb CNVバックボーンスパイクインパネル、2反応キット

110759

Twist 50kb CNVバックボーンスパイクインパネル、12反応キット
低解像度:

110760

Twist 100kb CNVバックボーンスパイクインパネル、2反応キット

110761

Twist 100kb CNVバックボーンスパイクインパネル、12反応キット
エクソームパネル

104132

Twist Exome 2.0, 2 Reactions, Kit

104134

Twist Exome 2.0, 12 Reactions, Kit

104136

Twist Exome 2.0, 96 Reactions, Kit

105034

Twist Exome 2.0 plus Comprehensive Exome Spike-in, 2 Reactions

105035

Twist Exome 2.0 plus Comprehensive Exome Spike-in, 12 Reactions

105036

Twist Exome 2.0 plus Comprehensive Exome Spike-in, 96 Reactions

*研究専用です。Twist のウェブサイトおよび製品をご利用になる場合、Twist の利用規約が適用されます。 

資料
さらに多くの製品をご覧ください

関連製品

エクソームシーケンスをさらに強化
エクソームシーケンスをさらに強化
エクソームシーケンスをさらに強化
Powered by Translations.com GlobalLink Web Software