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概要

高感度・高コンバージョン率・低インプット

Twist cfDNA Library Preparation Kit は、血中循環セルフリー DNA (cfDNA) からのライブラリ調製に関連する課題に対応します。リキッドバイオプシーは、がん研究、特に末梢血中を循環する、腫瘍由来の遺伝物質内における潜在的バイオマーカーの研究で注目を集めています。このキットは、 Illumina 次世代シーケンシング (NGS) システムのための高変換率での cfDNA ライブラリ生成を可能にし、入手が困難かつ DNA 量が限られている cfDNA やその他のサンプル (例:尿、CSF サンプル) の低インプット量や分解に関連する技術的課題を克服します。

Twist cfDNA Library Preparation Kit は、 Twist が提供する最高品質のライブラリ調製ソリューションであり、低インプットのサンプルでも堅牢なパフォーマンスと共に高いコンバージョン率が得られます。

F1

Twist cfDNA Library Preparation Kit、または Twist cfDNA Library Preparation and Hyb Mix Kit を用いることで、WGS およびターゲットエンリッチメントのワークフローが可能になります。 

検出
レアバリアントの検出感度を最大化
高コンバージョン率のため、レアバリアント(≦ 0.1% VAF)を確実に検出
Twist UMI Adapter System によりサポートされる Duplex シーケンシングワークフローに対応した高カバレッジライブラリ
ワークフロー
貴重なサンプルのワークフローを合理化
低インプット量(< 1 ng)のサンプルでも堅牢なパフォーマンス
すぐシーケンシングできるライブラリを 2 時間で作製

※ 研究専用です。診断や臨床用途には使用できません。

お客様の声

「固形臓器に蓄積する遺伝子変異のゲノム解析を行い、体細胞変異の低頻度変異体を確実に検出できる検出システムを構築しています。Twist cfDNA ライブラリ調製キットを用いることで、PCR サイクルを 1 サイクル減らしても、少量(1.5 ng)の断片化 DNA から従来法と同等のライブラリ収量が得られるだけでなく、分子バーコードを用いてエラー補正したリードを構築した後、既存のターゲットキャプチャ配列の平均カバレッジを 30% 向上させることができます。Twist のライゲーションプロセスは、ライブラリ調製が簡単かつ迅速であり、微量システムにおける分子バーコードの応用を拡大することが期待されます。」垣内 伸之 博士   



京都大学大学院 医学研究科 腫瘍生物学講座・白眉プロジェクト 准教授

 

*この結果は、当該研究機関独自で得られたものであり、他の研究機関では必ずしも同じ結果が得られない可能性もあります。

高感度・高コンバージョン率・低インプット

Twist cfDNA Library Preparation Kit は、血中循環セルフリー DNA (cfDNA) からのライブラリ調製に関連する課題に対応します。リキッドバイオプシーは、がん研究、特に末梢血中を循環する、腫瘍由来の遺伝物質内における潜在的バイオマーカーの研究で注目を集めています。このキットは、 Illumina 次世代シーケンシング (NGS) システムのための高変換率での cfDNA ライブラリ生成を可能にし、入手が困難かつ DNA 量が限られている cfDNA やその他のサンプル (例:尿、CSF サンプル) の低インプット量や分解に関連する技術的課題を克服します。

Twist cfDNA Library Preparation Kit は、 Twist が提供する最高品質のライブラリ調製ソリューションであり、低インプットのサンプルでも堅牢なパフォーマンスと共に高いコンバージョン率が得られます。

F1

Twist cfDNA Library Preparation Kit、または Twist cfDNA Library Preparation and Hyb Mix Kit を用いることで、WGS およびターゲットエンリッチメントのワークフローが可能になります。 

検出
レアバリアントの検出感度を最大化
高コンバージョン率のため、レアバリアント(≦ 0.1% VAF)を確実に検出
Twist UMI Adapter System によりサポートされる Duplex シーケンシングワークフローに対応した高カバレッジライブラリ
ワークフロー
貴重なサンプルのワークフローを合理化
低インプット量(< 1 ng)のサンプルでも堅牢なパフォーマンス
すぐシーケンシングできるライブラリを 2 時間で作製

※ 研究専用です。診断や臨床用途には使用できません。

お客様の声

「固形臓器に蓄積する遺伝子変異のゲノム解析を行い、体細胞変異の低頻度変異体を確実に検出できる検出システムを構築しています。Twist cfDNA ライブラリ調製キットを用いることで、PCR サイクルを 1 サイクル減らしても、少量(1.5 ng)の断片化 DNA から従来法と同等のライブラリ収量が得られるだけでなく、分子バーコードを用いてエラー補正したリードを構築した後、既存のターゲットキャプチャ配列の平均カバレッジを 30% 向上させることができます。Twist のライゲーションプロセスは、ライブラリ調製が簡単かつ迅速であり、微量システムにおける分子バーコードの応用を拡大することが期待されます。」垣内 伸之 博士   



京都大学大学院 医学研究科 腫瘍生物学講座・白眉プロジェクト 准教授

 

*この結果は、当該研究機関独自で得られたものであり、他の研究機関では必ずしも同じ結果が得られない可能性もあります。

データ
高コンバージョン率 = 高収量
Twist cfDNA Library Preparation Kit は、より高い収量での cfDNA ライブラリ調製を実現します。

ライブラリ調製後、サンプルを 20 μL の水に溶出させ、QubitTM dsDNA Broad Range Kit で 1 μL 中の cfDNA 量を測定しました。

F2
より高感度かつ高精度
Twist cfDNA Library Preparation and Hyb Mix Kit を用いることで、0.25% VAF の高感度かつ高精度な検出が可能になります。

Pan-Cancer Standard サンプル中の 217 個の SNP バリアント部位をターゲットとするカスタム 50 kb オンコロジーパネルを用いて、ライブラリをシングルプレックスでキャプチャしました。Variants Missed は、1 バリアントファミリー未満の部位を合計し、検出可能な総バリアント部位で割って算出しています。

F5
Duplication 率の改善 = 複雑性の高さ
Twist cfDNA Library Preparation and Hyb Mix Kit は、分子バーコード(UMI)による Duplication 除去の有無にかかわらず、複雑性の高さを実現します。

現在の推奨ターゲットエンリッチメントプロトコルまたはその更新版を用いて、cfDNA 標準サンプルのバリアント部位をターゲットとするカスタム 50 kb オンコロジーパネルにより、ライブラリをシングルプレックスでキャプチャしました。

 

F3
ネイティブ cfDNA で証明された低インプット許容性
Twist cfDNA Library Preparation Kit は、ネイティブ cfDNA サンプルで、より高い cfDNA ライブラリ収量を実現します。

ライブラリ生成後、サンプルを 20 μL の水に溶出させ、QubitTM dsDNA Broad Range Kit で 1 μL 中の cfDNA 量を測定しました。

F6
高コンバージョン率 = 高収量
Twist cfDNA Library Preparation Kit は、より高い収量での cfDNA ライブラリ調製を実現します。

ライブラリ調製後、サンプルを 20 μL の水に溶出させ、QubitTM dsDNA Broad Range Kit で 1 μL 中の cfDNA 量を測定しました。

F2
より高感度かつ高精度
Twist cfDNA Library Preparation and Hyb Mix Kit を用いることで、0.25% VAF の高感度かつ高精度な検出が可能になります。

Pan-Cancer Standard サンプル中の 217 個の SNP バリアント部位をターゲットとするカスタム 50 kb オンコロジーパネルを用いて、ライブラリをシングルプレックスでキャプチャしました。Variants Missed は、1 バリアントファミリー未満の部位を合計し、検出可能な総バリアント部位で割って算出しています。

F5
Duplication 率の改善 = 複雑性の高さ
Twist cfDNA Library Preparation and Hyb Mix Kit は、分子バーコード(UMI)による Duplication 除去の有無にかかわらず、複雑性の高さを実現します。

現在の推奨ターゲットエンリッチメントプロトコルまたはその更新版を用いて、cfDNA 標準サンプルのバリアント部位をターゲットとするカスタム 50 kb オンコロジーパネルにより、ライブラリをシングルプレックスでキャプチャしました。

 

F3
ネイティブ cfDNA で証明された低インプット許容性
Twist cfDNA Library Preparation Kit は、ネイティブ cfDNA サンプルで、より高い cfDNA ライブラリ収量を実現します。

ライブラリ生成後、サンプルを 20 μL の水に溶出させ、QubitTM dsDNA Broad Range Kit で 1 μL 中の cfDNA 量を測定しました。

F6
ご注文
cfDNA ライブラリ調製製品 SKU

107603

Twist cfDNA Library Preparation Kit–16 Samples

107604

Twist cfDNA Library Preparation Kit–96 Samples
cfDNA ライブラリ調製およびハイブリダイゼーション製品 SKU

107609

Twist cfDNA Library Preparation and Hyb Mix Kit–16 Samples and 2 Reactions

107610

Twist cfDNA Library Preparation and Hyb Mix Kit–96 Samples and 12 Reactions

※ 研究専用です。診断や臨床用途には使用できません。

cfDNA ライブラリ調製製品 SKU

107603

Twist cfDNA Library Preparation Kit–16 Samples

107604

Twist cfDNA Library Preparation Kit–96 Samples
cfDNA ライブラリ調製およびハイブリダイゼーション製品 SKU

107609

Twist cfDNA Library Preparation and Hyb Mix Kit–16 Samples and 2 Reactions

107610

Twist cfDNA Library Preparation and Hyb Mix Kit–96 Samples and 12 Reactions

※ 研究専用です。診断や臨床用途には使用できません。

リソース
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