Twist RNA Sequenzierungs-Workflow-Lösungen

Twist RNA-Sequenzierungs-Workflows bieten eine vollständige NGS-Lösung, die einheitliche Libraries für die RNA-Sequenzierung erstellt. Twist bietet zielgerichtete und vollständige Transkriptom-Workflows, die die Zeit am Labortisch reduzieren und sich in unseren aktuellen Satz an NGS-Reagenzien, einschließlich unserer Target Enrichment Kits, integrieren lassen. Jeder Workflow liefert hochwertige Libraries, die aus einer Vielzahl von Inputs und Probentypen, einschließlich Translationsforschungsproben, sequenziert werden können.

Twist Custom RNA Panels können so entworfen und erstellt werden, dass sie ein breites Spektrum an Panelgrößen und Transkript-Zielregionen mit außergewöhnlicher und konsistenter Leistung abdecken. Unter Nutzung unserer umfassenden Designerfahrung hat Twist Exon-bewusste Designalgorithmen entwickelt, die auf einzelne Exons abzielen, ohne dabei eine bestimmte Exon-Exon-Verbindungsstelle bevorzugt auszuwählen. Wir haben diesen Designansatz auf das Twist RNA-Exom angewendet, was es zu einem guten Werkzeug für die Transkriptomanalyse und den Fusionsnachweis macht.

Die End-to-End-Workflows erreichen dies durch die Kombination optimierter und effektiver Libraryvorbereitungskits, hochwertiger einzigartiger Dual-Indizes (UDI), einzigartiger molekularer Identifikatoren, optimierter Target Enrichment und eines proprietären Exon-bewussten Panel-Design-Algorithmus.

Zielgerichtete RNA-Sequenzierung

• Erstellen Sie benutzerdefinierte Panels, um nur die wichtigen RNA-Transkripte zu sequenzieren 
• Kombinieren Sie Twist RNA Library Prep, Twist Hybridisierungs- und RNA Target Enrichment-Panels
• Erhöhen Sie die Empfindlichkeit für wichtige Ziele, selbst bei minderwertiger, degradierter RNA aus FFPE

RNA-Exom und zielgerichtete Sequenzierung

• ​​Exon-bewusstes Sondendesign für proteinkodierende Regionen und einzigartige Spleißstellen
• Weniger Reads pro Probe für mehr Proben
• Zielt auf 19708 Gene und 63215 Isoformen ab 
• Mehr als 1,8-fache Anreicherung des gesamten Transkriptoms

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Ganz-Transkriptom-Sequenzierung

• Messen Sie die Expressionsniveaus von mRNA, lncRNA und anderen RNA-Spezies
• Bereiten Sie Libraries aus Gesamt-RNA vor, die aus frischen und FFPE-Proben extrahiert wurde
• Kombinieren Sie unser Twist RNA Library Prep mit dem Twist rRNA- und Globin-Depletions-Kit
• Führen Sie die RNA-Libraryvorbereitung in weniger als 5 Stunden durch

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RNA-Fusionsnachweis

• Reichern Sie bekannte und neuartige Fusionen mit dem Twist Alliance CeGaT Fusion Panel an
• Kompetentes Content-Design durch Zusammenarbeit mit CeGaT
• Optimierter kompletter Workflow mit dem Twist RNA Library Prep Kit für die Sequenzierung einer fertigen Library
• Nutzen Sie die Twist Core Capture Enrichment-Technologie, um die Effizienz zu maximieren

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RNA-Exom

Das Twist RNA-Exom bietet zusammen mit Twist RNA Library Prep und Twist Target Enrichment ein zuverlässiges Werkzeug zur Generierung von Transkriptom-Sequenzierungsdaten aus RNA, die aus verschiedenen Quellen, einschließlich FFPE, extrahiert wurde. RNA Exom erhöht das Signal und erfordert gleichzeitig weniger Sequenzierungs-Reads für die gleiche Anzahl nachgewiesener Gene. Dies ermöglicht den Nachweis schwach exprimierender Ziele, die für ein genaues Bild des Transkriptionszustands der biologischen Probe entscheidend sind. Darüber hinaus lässt der Exon-bewusste Designansatz des RNA-Exoms die Möglichkeit offen, Isoformen und Verbindungen nachzuweisen, die sonst bei typischen Designansätzen verloren gehen könnten. Diese vollständige Sequenzierungslösung kann hochkomplexe und einheitliche Sequenzierungs-Reads für die RNA-Sequenzierungsanalyse der proteinkodierenden Sequenzen des menschlichen Transkriptoms erzeugen.

Mehr Targets, weniger Reads

Twist RNA-Exom erkennt mehr Ziele mit weniger Reads über eine Reihe von RNA-Inputs mit FFPE und universeller menschlicher Referenz-RNA. Alle Libraries wurden mithilfe von Twist RNA Library Prep vorbereitet.

RNA-Fusion

Genfusionen wirken häufig als onkogene Treibermutationen bei einer Vielzahl von Krebsarten. Ihre schnelle und genaue Erkennung kann klinische Maßnahmen beeinflussen und Behandlungsentscheidungen vorantreiben. Das Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel Kit ist ein RNA-basiertes Anreicherungspanel und bietet eine verbesserte zielgerichtete und empfindliche Methode zur Untersuchung von Genfusionen als herkömmliche Methoden.

Dieses Panel umfasst 160 Fusionsgene, die mit etwa 30 Krebsarten assoziiert sind. Die Fusionsgene wurden von CeGaT, einem führenden Unternehmen für genetische Diagnostik und Sequenzierung mit Sitz in Europa, ausgewählt. Das Design dient nicht nur dem Nachweis bekannter Genfusionen, sondern wird auch zur Identifizierung neuer Genfusionen verwendet.

Das Panel ist für die Verwendung mit dem Twist RNA Library Prep Kit optimiert und validiert, um einen kompletten End-to-End-Workflow mit außergewöhnlicher Leistung zu gewährleisten. Eine hohe Capture-Effizienz mit der RNA-basierten Anreicherung erhöht die Nachweisempfindlichkeit. Dieses Panel ist ideal für das Screening onkologischer Proben geeignet, um Behandlungsoptionen zu inspirieren oder neue Fusionen für die Tumorklassifizierung nachzuweisen.*

Panel-Design

• 160 fusionsassoziierte Gene mit 66 Genen im Breakpoint-Design
• 7394 Sonden
• Deckt eine Vielzahl unterschiedlicher Krebsarten ab

* Hinweis: Das Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel – 3 MB ist ISO-13485-zertifiziert.