Oligo-Pools

Oligo-Pools

Twist Oligo-Pools sind sehr unterschiedliche Sammlungen einzelsträngiger Oligonukleotide, die mithilfe unserer siliziumbasierten DNA-Schreibtechnologie synthetisiert wurden. Unsere Syntheseplattform ermöglicht eine sehr parallele Produktion von Hunderttausenden hochqualitativer, präziser Oligonukleotide pro Lauf, wodurch komplexe und vielfältige Oligo-Pools für Anwendungen wie die CRISPR-Analyse erzeugt werden können.

Funktionsweise

Sie stellen uns Oligonukleotidsequenzen bereit und wir synthetisieren Ihre benutzerdefinierten Oligo-Pool-Libraries, damit Sie sich auf Experimente und Entdeckungen konzentrieren können. 

Äußerst gleichförmige Oligonukleotid-Synthese

NGS-Qualitätskontrolldaten aus einem typischen Oligo-Pool mit 23.000 90mer-Oligonukleotiden zeigen die Gleichmäßigkeit des Pools bei 300-facher Leseabdeckung. Die entsprechende Tabelle gibt die Einförmigkeitsmetriken für diesen Pool an. Twist Bioscience Oligonukleotide werden verzerrungsfrei und mit hoher Einförmigkeit und vollständiger Oligonukleotid-Repräsentation synthetisiert.

Sequenzanalyse von Oligo-Pools

Die von Twist Bioscience und einem Array-basierten Wettbewerber generierte Sequenzanalyse von Oligo-Pools zeigt, dass die Twist Bioscience Oligo-Pools 100 % der erwarteten Sequenzen und einen höheren Prozentsatz korrekter Sequenzen als der Oligo-Pool des Wettbewerbers enthalten.

Spezifikationen

Geklonte Oligo-Pools

Die Oligo-Pool-Qualität ist die Grundlage erfolgreicher Experimente. Fehler während der Synthese oder des Klonens können schnell die Qualität der Oligo-Pools beeinträchtigen und zu einer Über- und Unterrepräsentation der gewünschten Sequenzen führen. Twist bietet jetzt einen optimierten Klonierungsservice, der Ihnen den Aufwand in Verbindung mit den Untersuchungsbedingungen der PCR-Amplifikation, der Auswahl der richtigen Polymerasen und Primerpaare sowie der Gestaltung eines Klonierungs-Workflows erspart. Eliminieren Sie den Aufwand und überlassen Sie Twist Bioscience das Synthetisieren und Klonen von Oligo-Pools.  

Funktionsweise

Nur zwei Schritte von Ihren benutzerdefinierten klonierten Oligo-Pools entfernt. Sie stellen uns Oligonukleotidsequenzen bereit und wir synthetisieren, amplifizieren und klonieren Ihre benutzerdefinierten Oligo-Pool-Libraries, damit Sie sich auf Experimente und Entdeckungen konzentrieren können. 

Twists klonierte Oligo-Pools aller Längen weisen hohe Homogenität und niedrige Fehlerraten auf

Leistungsdaten von amplifizierten und klonierten Oligo-Pools von Längen unter 150 Nukleotiden auch bei hohem GC-Gehalt:

Leistungsdaten von amplifizierten und klonierten Oligo-Pools von Längen bis zu 300 Nukleotiden auch bei hohem GC-Gehalt:
 

Erzielen Sie die höchste Qualität und Genauigkeit Ihrer experimentellen Daten

Die klonierten Oligo-Pools von Twist haben nicht nur niedrige Fehlerraten und ein hohes Maß an Homogenität, sondern auch niedrige Chimärenraten. Chimären sind unerwünschte Hybridmoleküle, die als Ergebnis suboptimaler PCR-Bedingungen erzeugt werden, was zu einer unsachgemäßen Amplifikation und Rekombination verschiedener Oligonukleotide innerhalb des Oligo-Pools führt. Die Abbildung unten zeigt ein Beispiel eines On-Target-Klonpools im Vergleich zu einem Off-Target-Pool, der Chimären enthält, was letztendlich zu klonierten Oligo-Pools führt, die aus unerwünschten Sequenzen bestehen: 

Mit Twist müssen Sie sich keine Sorgen um Chimären machen! Überzeugen Sie sich selbst:

Herkömmliche Amplifikation vs. Leistung der firmeneigenen Amplifikationsmethode von Twist

Spezifikationen

*Geschäftsbedingungen: Die Basisdurchlaufzeit für geklonte Oligo-Pools, einschließlich Klonierung und Amplifikation, von bis zu 100 und 300 Nukleotiden beträgt 4–6 Wochen bzw. 6–8 Wochen. Für alle geklonten Oligo-Pools, die das Onboarding neuer Vektoren erfordern, werden dieser Basisdurchlaufzeit weitere 2 Wochen hinzugefügt, unabhängig von der Länge. Chimärenrate, Dropout-Rate und Homogenität variieren je nach Sequenzkomplexität.

Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung

Die Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung (FISH) ermöglicht die direkte Visualisierung der Häufigkeit und räumlichen Organisation von Nukleinsäuren in biologischen Proben. Oligo-Pools können Sonden codieren, die, wenn sie an fluoreszierende Marker gebunden sind, eine einstellbare, programmierbare Visualisierung einer großen Anzahl von Zielen ermöglichen.

Produktvorteile:

• Schnelle FISH-Sondenentwicklung
• Sequenzkontrolle ermöglicht eine effektive Zielausrichtung
• Längere Oligonukleotide ermöglichen eine spezifischere Zielausrichtung

Webinar ansehen: Schnelle und effiziente Erstellung von FISH-Sonden mithilfe von Oligo-Pools mit Nicola Crosetto