Gibt es Sequenzbeschränkungen/Designanweisungen für Gene, denen ich folgen sollte?
Syntheseprobleme werden hauptsächlich durch sich wiederholende Strukturen, extremen GC-Gehalt und Homopolymere verursacht. Wir verwenden maschinelle Lernverfahren, um die Erfolgschance zu bestimmen. Daher gibt es meistens nicht nur einen Grund für die Ablehnung einer Sequenz. Vielmehr sind Komplexität oder Ablehnung auf eine Kombination von Merkmalen zurückzuführen, die eine Sequenz zu einem bestimmten Komplexitätsniveau bringen. Die einzigen harten Regeln sind die folgenden:
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Vermeidung von Homopolymeren >= 14 bp
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Ausschluss von CcdB (Typ-II-Toxin-Antitoxin-System)
Wenn Sie auf ein Problem stoßen, empfehlen wir, Wiederholungen, Regionen mit extremem GC-Gehalt und Homopolymeren zu entfernen oder zu minimieren. Wir werden problematische Regionen hervorheben, wenn Ihre Sequenz komplex, unverbindlich ist oder Sequenzen enthält, die mit unseren internen Prozessen in Konflikt stehen.
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