Les problèmes de synthèse sont principalement dus à des structures répétitives, à une teneur en GC extrême et à des homopolymères. Pour déterminer les chances de réussite, nous nous appuyons sur une méthode d’apprentissage automatique. Par conséquent, la plupart du temps, le rejet d’une séquence ne s’explique pas par un motif unique. La complexité ou le rejet résultent plutôt d’un ensemble de caractéristiques qui portent une séquence au-delà d’un certain niveau de complexité. Les seules règles strictes sont les suivantes :

• Éviter les homopolymères >= 14 bp

• Ne pas inclure de CcdB (système toxine-antitoxine de type II)

Si vous faites face à un problème, nous vous recommandons de supprimer ou de minimiser les répétitions, les régions à teneur extrême en GC et les homopolymères. Nous mettrons en évidence les zones préoccupantes si votre séquence s’avère complexe, impossible à construire ou contient des séquences qui entrent en conflit avec nos processus internes.