Minimal Residual Disease (MRD) ist das Vorhandensein einer kleinen Anzahl bösartiger Krebszellen, die nach erfolgreicher therapeutischer Intervention im Körper verbleiben. MRD kann bei Patienten, die sich möglicherweise in Remission befinden oder keine phänotypischen Symptome zeigen, auf niedrigem Niveau persistieren. Nachweisbare MRD-Werte sind ein Risikofaktor für ein Wiederauftreten, da die verbleibenden Krebszellen im Körper mit der Zeit metastasieren und sich vermehren können. Obwohl herkömmliche Überwachungstechnologien, wie z. B. radiologische Bildgebung, hochempfindliche Methoden sind, kann die Anzahl der verbleibenden Krebszellen so gering sein, dass sie möglicherweise nicht erkannt werden, bis Symptome eines erneuten Ausbruchs auftreten.
Die MRD-Überwachung kann mit Flüssigbiopsie erreicht werden, die diagnostische Tests von Blut oder anderen Körperflüssigkeiten ermöglicht. Dieser Ansatz hat das Potenzial, verbleibende Krebszellen früher als herkömmliche Überwachungsmethoden zu erkennen, was eine frühere therapeutische Intervention ermöglicht. Dazu wird zirkulierende Tumor-DNA (ctDNA) als Biomarker für MRD-Tests mit Flüssigbiopsie verwendet. Ein gängiger Ansatz besteht darin, kurz vor der Therapie ein Variantenprofil des Primärtumors eines Patienten durch Gesamtgenom- oder Gesamtexom-Sequenzierung zu erstellen. Aus diesem Primärtumor wird dann eine Teilmenge patientenspezifischer Varianten ausgewählt und ein kleines Target Enrichment-Panel (MRD-Panel) gegen diese relevanten Varianten entworfen. Nach der Behandlung werden wiederholte MRD-Tests verwendet, um das Wiederauftreten der Krankheit des Patienten in festgelegten Zeitintervallen zu überwachen, damit ein erneutes Auftreten der ausgewählten ctDNA-Biomarker im Blut bewertet werden kann.
Das Twist MRD Rapid 500 Panel ist eine skalierbare Target Enrichment-Lösung zur Überwachung minimaler Resterkrankungen, die die siliziumbasierte DNA-Syntheseplattform von Twist nutzt, um Capture-Panels für die personalisierte Medizin zu entwickeln und herzustellen. Die proprietären Designalgorithmen von Twist und eine optimierte Fertigungspipeline ermöglichen Designautomatisierung, Synthese und eine schnelle Bearbeitungszeit von nur 6 Werktagen ab dem Zeitpunkt der Bestellung. Mit MRD-Panels von 50 bis 500 Sonden pro Panel können Sie ein breiteres Netz auswerfen, um die Adjuvans-Reaktion auf genomischer Ebene vollständig zu charakterisieren, und sie sind mit dem bestehenden NGS-Libraryvorbereitungs- und Hybrid-Capture-Workflow von Twist kompatibel.
Minimal Residual Disease (MRD) ist das Vorhandensein einer kleinen Anzahl bösartiger Krebszellen, die nach erfolgreicher therapeutischer Intervention im Körper verbleiben. MRD kann bei Patienten, die sich möglicherweise in Remission befinden oder keine phänotypischen Symptome zeigen, auf niedrigem Niveau persistieren. Nachweisbare MRD-Werte sind ein Risikofaktor für ein Wiederauftreten, da die verbleibenden Krebszellen im Körper mit der Zeit metastasieren und sich vermehren können. Obwohl herkömmliche Überwachungstechnologien, wie z. B. radiologische Bildgebung, hochempfindliche Methoden sind, kann die Anzahl der verbleibenden Krebszellen so gering sein, dass sie möglicherweise nicht erkannt werden, bis Symptome eines erneuten Ausbruchs auftreten.
Die MRD-Überwachung kann mit Flüssigbiopsie erreicht werden, die diagnostische Tests von Blut oder anderen Körperflüssigkeiten ermöglicht. Dieser Ansatz hat das Potenzial, verbleibende Krebszellen früher als herkömmliche Überwachungsmethoden zu erkennen, was eine frühere therapeutische Intervention ermöglicht. Dazu wird zirkulierende Tumor-DNA (ctDNA) als Biomarker für MRD-Tests mit Flüssigbiopsie verwendet. Ein gängiger Ansatz besteht darin, kurz vor der Therapie ein Variantenprofil des Primärtumors eines Patienten durch Gesamtgenom- oder Gesamtexom-Sequenzierung zu erstellen. Aus diesem Primärtumor wird dann eine Teilmenge patientenspezifischer Varianten ausgewählt und ein kleines Target Enrichment-Panel (MRD-Panel) gegen diese relevanten Varianten entworfen. Nach der Behandlung werden wiederholte MRD-Tests verwendet, um das Wiederauftreten der Krankheit des Patienten in festgelegten Zeitintervallen zu überwachen, damit ein erneutes Auftreten der ausgewählten ctDNA-Biomarker im Blut bewertet werden kann.
Das Twist MRD Rapid 500 Panel ist eine skalierbare Target Enrichment-Lösung zur Überwachung minimaler Resterkrankungen, die die siliziumbasierte DNA-Syntheseplattform von Twist nutzt, um Capture-Panels für die personalisierte Medizin zu entwickeln und herzustellen. Die proprietären Designalgorithmen von Twist und eine optimierte Fertigungspipeline ermöglichen Designautomatisierung, Synthese und eine schnelle Bearbeitungszeit von nur 6 Werktagen ab dem Zeitpunkt der Bestellung. Mit MRD-Panels von 50 bis 500 Sonden pro Panel können Sie ein breiteres Netz auswerfen, um die Adjuvans-Reaktion auf genomischer Ebene vollständig zu charakterisieren, und sie sind mit dem bestehenden NGS-Libraryvorbereitungs- und Hybrid-Capture-Workflow von Twist kompatibel.
Twist MRD Rapid 500 Panels holen das Beste aus Ihren Sequenzierungsdaten heraus, indem sie eine branchenführende einheitliche Capture-Technologie und einen optimierten Designprozess bieten. Sparen Sie Gesamtsequenzierungskosten mit außergewöhnlichen Off-Target- und 80-fachen Erfassungsleistungsraten. Überwachen Sie alle relevanten Varianten mit Abdeckung für jedes Ihrer Ziele.
Twist hat fünf 200-Sonden-MRD-Panels entwickelt, die speziell auf somatische Varianten abzielen, die in Brust, Lunge, CRC, Melanom und Nierenzellkarzinom gefunden werden. Darüber hinaus hat Twist sein bewährtes Kit zur mechanischen Libraryvorbereitung mit dem Twist UMI-Adaptersystem und einem neu optimierten Target Enrichment-Protokoll genutzt, um die Leistung des MRD-Panels weiter zu verbessern.
Die Ergebnisse zeigen, dass das aktualisierte System die Leistung kleiner Panels dramatisch verbessert, wodurch die Off-Target-Raten in jedem Panel auf bis zu 10–15 % reduziert werden können, bei gleichmäßiger Abdeckung aller relevanten Targets.
Die Leistung von Capture-Panels, insbesondere von Panels mit wenigen Sonden, hängt von der Spezifität der Sondensequenzen für die Target-Regionen im Genom ab. Sondenspezies, die repetitive Elemente überlappen, die sich im gesamten Genom befinden, können nicht nur mit relevanten Regionen hybridisieren, sondern auch mit vielen anderen, unerwünschten Library-Fragmenten, was zu verschwendeter Sequenzierung führt.
Twist MRD Rapid 500 Panels werden unter Verwendung proprietärer Filteralgorithmen entwickelt, die Sonden aus einem Panel screenen, wenn sie voraussichtlich zu erhöhten Off-Target-Sequenzierungsdaten führen. Sonden mit überlappenden repetitiven Elementen können unvorhersehbare Off-Target-Ereignisse verursachen. Ohne repetitive Filter, wie in der Abbildung unten gezeigt, könnte die Off-Target-Rate moderat (PanelA kein Filter) oder hoch (PanelB kein Filter) sein. Dagegen sind die Off-Target-Raten durch das Herausfiltern der problematischen Sonden konstant niedrig (PanelA-Filter und PanelB-Filter).
Twist MRD Rapid 500 Panels holen das Beste aus Ihren Sequenzierungsdaten heraus, indem sie eine branchenführende einheitliche Capture-Technologie und einen optimierten Designprozess bieten. Sparen Sie Gesamtsequenzierungskosten mit außergewöhnlichen Off-Target- und 80-fachen Erfassungsleistungsraten. Überwachen Sie alle relevanten Varianten mit Abdeckung für jedes Ihrer Ziele.
Twist hat fünf 200-Sonden-MRD-Panels entwickelt, die speziell auf somatische Varianten abzielen, die in Brust, Lunge, CRC, Melanom und Nierenzellkarzinom gefunden werden. Darüber hinaus hat Twist sein bewährtes Kit zur mechanischen Libraryvorbereitung mit dem Twist UMI-Adaptersystem und einem neu optimierten Target Enrichment-Protokoll genutzt, um die Leistung des MRD-Panels weiter zu verbessern.
Die Ergebnisse zeigen, dass das aktualisierte System die Leistung kleiner Panels dramatisch verbessert, wodurch die Off-Target-Raten in jedem Panel auf bis zu 10–15 % reduziert werden können, bei gleichmäßiger Abdeckung aller relevanten Targets.
Die Leistung von Capture-Panels, insbesondere von Panels mit wenigen Sonden, hängt von der Spezifität der Sondensequenzen für die Target-Regionen im Genom ab. Sondenspezies, die repetitive Elemente überlappen, die sich im gesamten Genom befinden, können nicht nur mit relevanten Regionen hybridisieren, sondern auch mit vielen anderen, unerwünschten Library-Fragmenten, was zu verschwendeter Sequenzierung führt.
Twist MRD Rapid 500 Panels werden unter Verwendung proprietärer Filteralgorithmen entwickelt, die Sonden aus einem Panel screenen, wenn sie voraussichtlich zu erhöhten Off-Target-Sequenzierungsdaten führen. Sonden mit überlappenden repetitiven Elementen können unvorhersehbare Off-Target-Ereignisse verursachen. Ohne repetitive Filter, wie in der Abbildung unten gezeigt, könnte die Off-Target-Rate moderat (PanelA kein Filter) oder hoch (PanelB kein Filter) sein. Dagegen sind die Off-Target-Raten durch das Herausfiltern der problematischen Sonden konstant niedrig (PanelA-Filter und PanelB-Filter).
105878
Twist MRD Rapid 500 Panel, 12 TestProduktname
MRD Rapid 500 Panel, 12 TestsMinimale Anzahl von Sonden
50Maximale Anzahl von Sonden
500Unterstütztes Eingabedateiformat
Target BED-Dateivorlage (siehe Ressourcen)Maximale Panel-Anzahl pro Bestellung
150Qualitätskontrolle
qPCRLiefermethode
Matrix-RöhrchenUnterstütztes Design von Genbaugruppen
hg19, hg38Durchlaufzeit
Panels werden innerhalb von 6 Werktagen geliefert105878
Twist MRD Rapid 500 Panel, 12 TestProduktname
MRD Rapid 500 Panel, 12 TestsMinimale Anzahl von Sonden
50Maximale Anzahl von Sonden
500Unterstütztes Eingabedateiformat
Target BED-Dateivorlage (siehe Ressourcen)Maximale Panel-Anzahl pro Bestellung
150Qualitätskontrolle
qPCRLiefermethode
Matrix-RöhrchenUnterstütztes Design von Genbaugruppen
hg19, hg38Durchlaufzeit
Panels werden innerhalb von 6 Werktagen geliefert
Wegweiser/Leitfaden
Twist MRD Rapid 500 Panel – Bestell- und Designausgabe-Referenzhandbuch
Protokoll
Twist Target Enrichment Standard Hybridization v2 Protocol für MRD-Anwendung
Poster
Hochempfindlicher Nachweis spezifischer extrem niederfrequenter somatischer Mutationen für die MRD-Überwachung
Wegweiser/Leitfaden
Twist MRD Rapid 500 Panel – Bestell- und Designausgabe-Referenzhandbuch
Protokoll
Twist Target Enrichment Standard Hybridization v2 Protocol für MRD-Anwendung
Poster
Hochempfindlicher Nachweis spezifischer extrem niederfrequenter somatischer Mutationen für die MRD-Überwachung