ÜBERSICHT SO WERDEN ENZYME FÜR DAS SCREENING AUSGEWÄHLT RESSOURCEN Häufig gestellte Fragen (FAQ)
Übersicht

Erschließen Sie sich einen unerkundeten Enzym-Sequenzabschnitt für eine optimale Exploration

Unsere neuartigen Enzymsequenzen wurden aus verschiedenen nicht kultivierten mikrobiellen Einzelzellgenomen identifiziert und mit Hilfe von auf Machine Learning basierenden Modellen, die auf Strukturvorhersage, strukturbasiertem Clustering und Filterung beruhen, nach wünschenswerten Eigenschaften ausgewählt – diese Sequenzen werden Sie wahrscheinlich nirgendwo anders finden.


Transaminasen (TAs) sind Enzyme, die die Übertragung einer Aminogruppe von einem Aminodonor auf ein Keton oder Aldehyd katalysieren. Diese Fähigkeit, die stereoselektive Aminierung prochiraler Ketone zu erleichtern, ist für die pharmazeutische Produktion von großem Wert, da die Nachfrage nach chiralen Aminen als Bausteine für pharmazeutische Wirkstoffe (APIs) hoch ist.


Wir haben eine Untergruppe von TA-Enzymen identifiziert und eingegrenzt, die ihre Aktivität unter einer Vielzahl von extremen Bedingungen und bei vielen verschiedenen Substraten aufrechterhalten, was für den pharmazeutischen Herstellungsprozess nützlich ist.


Unser Screening-Kit ermöglicht die Auswahl funktionell relevanter Sequenzen mit der Möglichkeit, diese in Zukunft mit nachgeschalteten Enzym-Engineering-Ressourcen zu kombinieren, um einen effizienteren Weg für das Protein-Engineering zu schaffen.

So werden Enzyme für das Screening ausgewählt

Die bitBiome bit-GEM Datenbank ist die führende Ressource für durchsuchbare und gut nutzbare Mikroben-Genomsequenzen. Die bit-GEM Datenbank, die sich auf die stärksten mikrobiellen Ressourcen der Natur stützt, darunter Proben aus Umgebungen wie Erde, heißen Quellen, Meerwasser, Bergbaustandorten und anderen extremen Bedingungen, enthält eine Vielzahl von Gensequenzen, die mit der bitBiome Plattform für die Einzelzellsequenzierung erfasst wurden. Diese Sequenzierungsmethode gewährleistet eine tiefere Genomabdeckung und ermöglicht die Entdeckung der mikrobiellen „dunklen Materie“. Diese Sequenzen haben eine geringe Ähnlichkeit mit denen im öffentlichen Raum, so dass der Kunde die Freiheit hat, in diesem Sequenzabschnitt zu agieren.

Erschließen Sie sich unerkundete Enzym-Sequenzabschnitte
Erschließen Sie sich unerkundete Enzym-Sequenzabschnitte
Tausende vorab auf Aktivität geprüfte Enzymkandidaten
Hohe Sequenzvielfalt zur Erfüllung spezifischer Bedürfnisse
Neuartige Sequenzen, die der Öffentlichkeit unbekannt sind, für mehr Handlungsfreiheit
Maximieren Sie Ihre Entwicklungsergebnisse
Maximieren Sie Ihre Entwicklungsergebnisse
Screening durch vorselektierte neue Transaminase-Varianten, die für die Identifizierung von Treffern benötigt werden
Vielfältige Substratspezifität, einschließlich schwer zu handhabender sperriger Substrate 
Beratung durch Experten
Beratung durch Experten
 bitBiome und Twist bieten zusammen alle Ressourcen, die für die weitere Generierung, Optimierung und Prüfung von Variant Librarys benötigt werden
Einfacher Zugang zu Experten, die Sie bei Ihren zukünftigen enzymtechnischen Bemühungen unterstützen
Schnelleres Screening mit Twist + bitBiome

Enzym-Screening-Kit 48 Enzyme für das Screening

Versand am nächsten Tag Versand am nächsten Tag

Scale-up verfügbar Scale-up verfügbar

Kontakt

Erschließen Sie sich einen unerkundeten Enzym-Sequenzabschnitt für eine optimale Exploration

Unsere neuartigen Enzymsequenzen wurden aus verschiedenen nicht kultivierten mikrobiellen Einzelzellgenomen identifiziert und mit Hilfe von auf Machine Learning basierenden Modellen, die auf Strukturvorhersage, strukturbasiertem Clustering und Filterung beruhen, nach wünschenswerten Eigenschaften ausgewählt – diese Sequenzen werden Sie wahrscheinlich nirgendwo anders finden.


Transaminasen (TAs) sind Enzyme, die die Übertragung einer Aminogruppe von einem Aminodonor auf ein Keton oder Aldehyd katalysieren. Diese Fähigkeit, die stereoselektive Aminierung prochiraler Ketone zu erleichtern, ist für die pharmazeutische Produktion von großem Wert, da die Nachfrage nach chiralen Aminen als Bausteine für pharmazeutische Wirkstoffe (APIs) hoch ist.


Wir haben eine Untergruppe von TA-Enzymen identifiziert und eingegrenzt, die ihre Aktivität unter einer Vielzahl von extremen Bedingungen und bei vielen verschiedenen Substraten aufrechterhalten, was für den pharmazeutischen Herstellungsprozess nützlich ist.


Unser Screening-Kit ermöglicht die Auswahl funktionell relevanter Sequenzen mit der Möglichkeit, diese in Zukunft mit nachgeschalteten Enzym-Engineering-Ressourcen zu kombinieren, um einen effizienteren Weg für das Protein-Engineering zu schaffen.

So werden Enzyme für das Screening ausgewählt

Die bitBiome bit-GEM Datenbank ist die führende Ressource für durchsuchbare und gut nutzbare Mikroben-Genomsequenzen. Die bit-GEM Datenbank, die sich auf die stärksten mikrobiellen Ressourcen der Natur stützt, darunter Proben aus Umgebungen wie Erde, heißen Quellen, Meerwasser, Bergbaustandorten und anderen extremen Bedingungen, enthält eine Vielzahl von Gensequenzen, die mit der bitBiome Plattform für die Einzelzellsequenzierung erfasst wurden. Diese Sequenzierungsmethode gewährleistet eine tiefere Genomabdeckung und ermöglicht die Entdeckung der mikrobiellen „dunklen Materie“. Diese Sequenzen haben eine geringe Ähnlichkeit mit denen im öffentlichen Raum, so dass der Kunde die Freiheit hat, in diesem Sequenzabschnitt zu agieren.

Schnelleres Screening mit Twist + bitBiome

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Hohe Sequenzvielfalt zur Erfüllung spezifischer Bedürfnisse
Neuartige Sequenzen, die der Öffentlichkeit unbekannt sind, für mehr Handlungsfreiheit
Maximieren Sie Ihre Entwicklungsergebnisse
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Screening durch vorselektierte neue Transaminase-Varianten, die für die Identifizierung von Treffern benötigt werden
Vielfältige Substratspezifität, einschließlich schwer zu handhabender sperriger Substrate 
Beratung durch Experten
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 bitBiome und Twist bieten zusammen alle Ressourcen, die für die weitere Generierung, Optimierung und Prüfung von Variant Librarys benötigt werden
Einfacher Zugang zu Experten, die Sie bei Ihren zukünftigen enzymtechnischen Bemühungen unterstützen
So werden Enzyme für das Screening ausgewählt

So werden Enzyme für das Screening ausgewählt

Die bit-GEM Datenbank, die sich auf starke mikrobielle Ressourcen der Natur stützt, darunter Proben aus Umgebungen wie Erde, heißen Quellen, Meerwasser, Bergbaustandorten und anderen extremen Bedingungen, enthält eine Vielzahl von Gensequenzen, die mit der bitBiome Plattform für die Einzelzellsequenzierung erfasst wurden. Diese Sequenzierungsmethode gewährleistet eine tiefere Genomabdeckung und ermöglicht die Entdeckung der mikrobiellen „dunklen Materie“. Diese Sequenzen haben eine geringe Ähnlichkeit mit denen im öffentlichen Raum, was eine größere Handlungsfreiheit innerhalb dieses Sequenzabschnitts ermöglicht. Die Auswahl der 48 Enzyme, die in diesem Kit enthalten sind, wurde nicht nur durch die Möglichkeiten der Twist-DNA-Synthese, sondern auch durch eine gemeinsame bioinformatische Arbeit zur Verfeinerung des funktionalen Sequenzabschnitts unterstützt.
 

So wurden die Enzyme für unser Kit ausgewählt

Insgesamt wurden 369 aktive Transaminasen mit 19 Substraten identifiziert. 273 der Enzyme erwiesen sich in 10 % DMSO als aktiv mit 30 aktiv bei 60 °C. Schließlich wurden die Enzyme auf pH-Empfindlichkeit und Selektivität getestet.

Kriterien für das Transaminasen-Screening

Kriterien für das Transaminasen-Screening

 

Im Folgenden werden die Enzyme aufgeschlüsselt, die mit verschiedenen Substraten unter den zuvor beschriebenen unterschiedlichen Bedingungen (verschiedene DMSO-Anteile, organische Lösungsmittel, Temperaturen und pH-Werte) getestet wurden.

Anzahl der Enzyme – Diagramm

Schnelleres Screening mit Twist + bitBiome

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So werden Enzyme für das Screening ausgewählt

Die bit-GEM Datenbank, die sich auf starke mikrobielle Ressourcen der Natur stützt, darunter Proben aus Umgebungen wie Erde, heißen Quellen, Meerwasser, Bergbaustandorten und anderen extremen Bedingungen, enthält eine Vielzahl von Gensequenzen, die mit der bitBiome Plattform für die Einzelzellsequenzierung erfasst wurden. Diese Sequenzierungsmethode gewährleistet eine tiefere Genomabdeckung und ermöglicht die Entdeckung der mikrobiellen „dunklen Materie“. Diese Sequenzen haben eine geringe Ähnlichkeit mit denen im öffentlichen Raum, was eine größere Handlungsfreiheit innerhalb dieses Sequenzabschnitts ermöglicht. Die Auswahl der 48 Enzyme, die in diesem Kit enthalten sind, wurde nicht nur durch die Möglichkeiten der Twist-DNA-Synthese, sondern auch durch eine gemeinsame bioinformatische Arbeit zur Verfeinerung des funktionalen Sequenzabschnitts unterstützt.
 

So wurden die Enzyme für unser Kit ausgewählt

Insgesamt wurden 369 aktive Transaminasen mit 19 Substraten identifiziert. 273 der Enzyme erwiesen sich in 10 % DMSO als aktiv mit 30 aktiv bei 60 °C. Schließlich wurden die Enzyme auf pH-Empfindlichkeit und Selektivität getestet.

Kriterien für das Transaminasen-Screening

Kriterien für das Transaminasen-Screening

 

Im Folgenden werden die Enzyme aufgeschlüsselt, die mit verschiedenen Substraten unter den zuvor beschriebenen unterschiedlichen Bedingungen (verschiedene DMSO-Anteile, organische Lösungsmittel, Temperaturen und pH-Werte) getestet wurden.

Anzahl der Enzyme – Diagramm

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Ressourcen
Häufig gestellte Fragen (FAQ)

ALLGEMEINE INFORMATIONEN

Welchen Reinheitsgrad haben Ihre Enzyme?
Wie lange ist die Haltbarkeit Ihrer Enzyme?
Wie hoch ist die Selektivität der Enzyme?
Was sind die typischen Parameter, unter denen die Enzyme arbeiten?

PLANUNG IHRES SCREENING-EXPERIMENTS

Was sollte ich als Kontrollsubstrat verwenden?
Was sind typische Reaktionsbedingungen für die entwickelten Enzyme?
Welche Puffer können mit den Enzymen verwendet werden?
Welche Lösungsmittel können mit den Enzymen verwendet werden?
Wie hoch ist die Toleranz gegenüber dem pH-Wert?
Wie hoch ist die Temperaturtoleranz?

FEHLERSUCHE

Was mache ich, wenn das Substrat sehr unlöslich in Wasser ist?
Was ist zu tun, wenn keine oder nur eine geringe Aktivität festgestellt wird?
Was mache ich, wenn es zu viele Treffer gibt und die Unterschiede zwischen ihnen nicht leicht zu erkennen sind?
Was ist zu tun, wenn ein Treffer identifiziert wurde und die Reaktion optimiert und hochskaliert werden muss?
Was muss ich tun, wenn ein anderer Aminodonor gewünscht wird?
Was tue ich, wenn ich weitere Fragen habe?

HÄUFIG GESTELLTE FRAGEN ZUM SCREENING

Ich habe meine Puffer-/Cofaktor-Lösung letzte Woche zubereitet. Kann ich sie noch verwenden?
Was kann ich tun, wenn die Löslichkeit der Substrate in wässrigen Medien eine Herausforderung darstellt und das Reaktionsgemisch trüb ist?
Gibt es eine Reihenfolge, in der die Reagenzien hinzugefügt werden müssen?

OPTIMIERUNG

Wie lassen sich die Reaktionsbedingungen (Temperatur, pH-Wert, Co-Lösungsmittel) am besten optimieren?

QUALITÄTSKONTROLLE

Wie wird die Aktivität der einzelnen Enzyme im Kit sichergestellt?
Wie überprüfen Sie die Menge des Enzympulvers in jedem Kit?
Wie stellen Sie sicher, dass das Lysatpulver frei von lebenden Expressionswirten ist?
Wie bestätigen Sie die Haltbarkeit der einzelnen Chargen?
Warum ist es wichtig zu prüfen, dass es keine lebenden Expressionswirte gibt?
Was ist eine kolorimetrische Methode und warum wird sie verwendet?
Was geschieht, wenn eine Charge nicht den Qualitätsstandards entspricht?
Wie stellen Sie die Genauigkeit Ihrer Qualitätskontrollverfahren sicher?
Können Kunden Qualitätskontrollberichte für ihre spezifische Enzymkit-Charge anfordern?

ALLGEMEINE INFORMATIONEN

Welchen Reinheitsgrad haben Ihre Enzyme?
Wie lange ist die Haltbarkeit Ihrer Enzyme?
Wie hoch ist die Selektivität der Enzyme?
Was sind die typischen Parameter, unter denen die Enzyme arbeiten?

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Was sollte ich als Kontrollsubstrat verwenden?
Was sind typische Reaktionsbedingungen für die entwickelten Enzyme?
Welche Puffer können mit den Enzymen verwendet werden?
Welche Lösungsmittel können mit den Enzymen verwendet werden?
Wie hoch ist die Toleranz gegenüber dem pH-Wert?
Wie hoch ist die Temperaturtoleranz?

FEHLERSUCHE

Was mache ich, wenn das Substrat sehr unlöslich in Wasser ist?
Was ist zu tun, wenn keine oder nur eine geringe Aktivität festgestellt wird?
Was mache ich, wenn es zu viele Treffer gibt und die Unterschiede zwischen ihnen nicht leicht zu erkennen sind?
Was ist zu tun, wenn ein Treffer identifiziert wurde und die Reaktion optimiert und hochskaliert werden muss?
Was muss ich tun, wenn ein anderer Aminodonor gewünscht wird?
Was tue ich, wenn ich weitere Fragen habe?

HÄUFIG GESTELLTE FRAGEN ZUM SCREENING

Ich habe meine Puffer-/Cofaktor-Lösung letzte Woche zubereitet. Kann ich sie noch verwenden?
Was kann ich tun, wenn die Löslichkeit der Substrate in wässrigen Medien eine Herausforderung darstellt und das Reaktionsgemisch trüb ist?
Gibt es eine Reihenfolge, in der die Reagenzien hinzugefügt werden müssen?

OPTIMIERUNG

Wie lassen sich die Reaktionsbedingungen (Temperatur, pH-Wert, Co-Lösungsmittel) am besten optimieren?

QUALITÄTSKONTROLLE

Wie wird die Aktivität der einzelnen Enzyme im Kit sichergestellt?
Wie überprüfen Sie die Menge des Enzympulvers in jedem Kit?
Wie stellen Sie sicher, dass das Lysatpulver frei von lebenden Expressionswirten ist?
Wie bestätigen Sie die Haltbarkeit der einzelnen Chargen?
Warum ist es wichtig zu prüfen, dass es keine lebenden Expressionswirte gibt?
Was ist eine kolorimetrische Methode und warum wird sie verwendet?
Was geschieht, wenn eine Charge nicht den Qualitätsstandards entspricht?
Wie stellen Sie die Genauigkeit Ihrer Qualitätskontrollverfahren sicher?
Können Kunden Qualitätskontrollberichte für ihre spezifische Enzymkit-Charge anfordern?
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