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Robuste Chemie für anspruchsvolle Proben

RNA-Seq-Lösungen von Twist, die für anspruchsvolle Proben wie Low-Input und FFPE entwickelt wurden, um mit qualitativ hochwertigen Librarys mit hoher Ausbeute in einem kurzen Arbeitsablauf Ergebnisse erzielen zu können. Twist bietet sowohl Target-Enrichment- als auch Whole-Transcriptome-Workflows an, die Optionen bieten, die Ihren Anwendungsanforderungen am besten entsprechen. Jeder Workflow liefert hochwertige Librarys, die aus einer Vielzahl von Inputs und Probentypen, einschließlich translationaler Forschungsproben, sequenziert werden können.

Robuste Chemie für anspruchsvolle Proben

RNA-Seq-Lösungen von Twist, die für anspruchsvolle Proben wie Low-Input und FFPE entwickelt wurden, um mit qualitativ hochwertigen Librarys mit hoher Ausbeute in einem kurzen Arbeitsablauf Ergebnisse erzielen zu können. Twist bietet sowohl Target-Enrichment- als auch Whole-Transcriptome-Workflows an, die Optionen bieten, die Ihren Anwendungsanforderungen am besten entsprechen. Jeder Workflow liefert hochwertige Librarys, die aus einer Vielzahl von Inputs und Probentypen, einschließlich translationaler Forschungsproben, sequenziert werden können.

Workflows

 

Wählen Sie Ihren Workflow

Target Enrichment

VORTEILE

  • Erfassen Sie alle Gene oder Untergruppen von Genen von Interesse.
  • Reichern Sie beschädigte RNA-Fragmente aus FFPE an.
  • Reichern Sie von Transkripten exprimierte Gene in voller Länge an.
  • Erstellen Sie Ihre eigenen RNA-Panels.

Spezifikationen

infi Schließen Sie das FFPE-Reparaturmodul ein. 
bar 1–1000 ng 
Zeit Libraryvorbereitung: 4,5–5 Stunden
mag Anreicherung: über Nacht (16 Std.) mit Standard Hyb

v2 oder 5 Std. mit Fast Hyb und Wash

 

Produktangebot

Vollständiges Transkriptom

VORTEILE

  • Unverfälschte Erstellung von Profilen exprimierter RNA
  • FFPE-kompatibel
  • rRNA- und Globin-Gen-Deletion
  • Schneller Arbeitsablauf

Spezifikationen

infi Schließen Sie das FFPE-Reparaturmodul ein. 
bar 1–1000 ng 
Zeit Libraryvorbereitung: 4,5–5 Std. (6–6,5 Std. mit Depletions-Modul)
mag Anreicherung: N/A 

 

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  • Erfassen Sie alle Gene oder Untergruppen von Genen von Interesse.
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mag Anreicherung: über Nacht (16 Std.) mit Standard Hyb

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  • Unverfälschte Erstellung von Profilen exprimierter RNA
  • FFPE-kompatibel
  • rRNA- und Globin-Gen-Deletion
  • Schneller Arbeitsablauf

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Zeit Libraryvorbereitung: 4,5–5 Std. (6–6,5 Std. mit Depletions-Modul)
mag Anreicherung: N/A 

 

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Erfahrungsberichte

Meinungen der Wissenschaftler

Das Transkriptom bietet einen besseren Zugang zum tatsächlichen biologischen Status der Tumorzelle, im Gegensatz zu der eher „statischen“ Natur der DNA. Die parallele Analyse von Genexpression, Fusionsdetektion, Variantenaufruf, Tumorsignaturen und vielem mehr, die mit einer einzigen Libraryvorbereitung und ausgehend von drei bis fünf FFPE-Gewebeschnitten möglich ist, macht das RNA-Exom-Kit zu einem vielversprechenden Assay für eine zukunftssichere Implementierung in unsere klinische Routine.

Dr. Koen Jacobs, Molekularpathologe, AZ Sint Lucas

Haftungsausschluss: Die Ergebnisse sind spezifisch für die Institution, an der sie erzielt wurden, und spiegeln möglicherweise nicht die Ergebnisse wider, die an anderen Institutionen erzielt werden können.

Die Twist Target-Enrichment-Technologie ist ein robuster Workflow, der es uns ermöglicht, Patientenproben mit mehr als 80 Fusionsvarianten in einem Hochdurchsatz-Labor-Workflow genau zu analysieren.

Dr. Florian Battke, Director of Development, CeGaT GmbH

Haftungsausschluss: Die Ergebnisse sind spezifisch für die Institution, an der sie erzielt wurden, und spiegeln möglicherweise nicht die Ergebnisse wider, die an anderen Institutionen erzielt werden können.

Meinungen der Wissenschaftler

Das Transkriptom bietet einen besseren Zugang zum tatsächlichen biologischen Status der Tumorzelle, im Gegensatz zu der eher „statischen“ Natur der DNA. Die parallele Analyse von Genexpression, Fusionsdetektion, Variantenaufruf, Tumorsignaturen und vielem mehr, die mit einer einzigen Libraryvorbereitung und ausgehend von drei bis fünf FFPE-Gewebeschnitten möglich ist, macht das RNA-Exom-Kit zu einem vielversprechenden Assay für eine zukunftssichere Implementierung in unsere klinische Routine.

Dr. Koen Jacobs, Molekularpathologe, AZ Sint Lucas

Haftungsausschluss: Die Ergebnisse sind spezifisch für die Institution, an der sie erzielt wurden, und spiegeln möglicherweise nicht die Ergebnisse wider, die an anderen Institutionen erzielt werden können.

Die Twist Target-Enrichment-Technologie ist ein robuster Workflow, der es uns ermöglicht, Patientenproben mit mehr als 80 Fusionsvarianten in einem Hochdurchsatz-Labor-Workflow genau zu analysieren.

Dr. Florian Battke, Director of Development, CeGaT GmbH

Haftungsausschluss: Die Ergebnisse sind spezifisch für die Institution, an der sie erzielt wurden, und spiegeln möglicherweise nicht die Ergebnisse wider, die an anderen Institutionen erzielt werden können.

Ressourcen
Häufig gestellte Fragen (FAQ)

Häufig gestellte Fragen (FAQ)

Das Twist RNA-Exom ist ein Target Enrichment, das zuverlässige Transkriptom-Sequenzierungsdaten aus RNA generiert, die aus verschiedenen Quellen, einschließlich FFPE, extrahiert wurden. RNA Exom erhöht das Signal und erfordert gleichzeitig weniger Sequenzierungs-Reads für die gleiche Anzahl nachgewiesener Gene. Darüber hinaus lässt der Exon-bewusste Designansatz des RNA-Exoms die Möglichkeit offen, Isoformen und Verbindungen nachzuweisen, die sonst bei typischen Designansätzen verloren gehen könnten.

Das Depletions-Modul ist für die Arbeit mit bluthaltigen Proben oder anderen Proben konzipiert, die von der Entfernung kontaminierender rRNA und Globin profitieren können.

Das FFPE-Reparaturmodul ist ein optionaler Schritt in der Libraryvorbereitung, der bei der Entflechtung der in Formalin fixierten DNA hilft, so dass diese Sequenzen leichter für die anschließende Libraryvorbereitung zur Verfügung stehen.

Ja, das erfahrene Bioinformatik-Team von Twist kann Panels für viele verschiedene Organismen, wie z. B. Mikroben, oder für eine Vielzahl von Anwendungen erstellen.

Häufig gestellte Fragen (FAQ)

Das Twist RNA-Exom ist ein Target Enrichment, das zuverlässige Transkriptom-Sequenzierungsdaten aus RNA generiert, die aus verschiedenen Quellen, einschließlich FFPE, extrahiert wurden. RNA Exom erhöht das Signal und erfordert gleichzeitig weniger Sequenzierungs-Reads für die gleiche Anzahl nachgewiesener Gene. Darüber hinaus lässt der Exon-bewusste Designansatz des RNA-Exoms die Möglichkeit offen, Isoformen und Verbindungen nachzuweisen, die sonst bei typischen Designansätzen verloren gehen könnten.

Das Depletions-Modul ist für die Arbeit mit bluthaltigen Proben oder anderen Proben konzipiert, die von der Entfernung kontaminierender rRNA und Globin profitieren können.

Das FFPE-Reparaturmodul ist ein optionaler Schritt in der Libraryvorbereitung, der bei der Entflechtung der in Formalin fixierten DNA hilft, so dass diese Sequenzen leichter für die anschließende Libraryvorbereitung zur Verfügung stehen.

Ja, das erfahrene Bioinformatik-Team von Twist kann Panels für viele verschiedene Organismen, wie z. B. Mikroben, oder für eine Vielzahl von Anwendungen erstellen.

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