Twist Respiratory Virus Research Panel

Compilées à partir de la base de données GenBank, les 41 047 sondes de ce panel permettront aux chercheurs de distinguer les symptômes du COVID-19 de ceux d’autres maladies respiratoires, liées ou non à la grippe. Le Twist Respiratory Panel permet l’enrichissement de ces séquences virales pour la NGS haute résolution. Cette méthode conduit à une détection très sensible de seulement 100 copies de matériel viral avec un enrichissement de plus de 5000 fois, même à partir d’échantillons difficiles, et à une couverture de plus de 99,9 % du génome à un facteur 1 ou plus après enrichissement.

Chaque contrôle synthétique viral Twist a été introduit dans 50 ng d’ARN porteur humain à 1 000 000 de copies avant la synthèse de l’ADNc. Pour chaque standard, nous indiquons le pourcentage de lectures virales ciblées, l’enrichissement par rapport à l’entrée, la couverture médiane du génome, le pourcentage de bases avec une couverture d’au moins 30x et la longueur de la matrice. Les génomes viraux sont classés par longueur de matrice (de la plus petite à la plus longue) parmi tous les segments du génome. Dans la plupart des cas, nous avons constaté que plus de 70 % des lectures provenaient de génomes viraux dans ces banques, ce qui représente un enrichissement d’au moins 2 500 fois par rapport au contenu de l’entrée.

Comparaison du pourcentage de lectures virales sur cible capturées au moyen des contrôles synthétiques viraux Twist à différents titres viraux, par le biais d’une réaction d’hybridation multiplex et uniplex. Le premier graphique montre les comparaisons effectuées à l’aide d’une réaction d’hybridation multiplex et uniplex avec un million de copies par banque, tandis que le deuxième graphique montre une comparaison similaire avec 100, 10 000 et 1 000 000 de copies par banque. Chaque contrôle viral a été capturé selon le procédé standard d’enrichissement ciblé de Twist et le Twist Respiratory Virus Research Panel. Ces données démontrent que la capture de 8 plexes donne un enrichissement efficace comparable à celui d’un seul plexe lors de l’utilisation du Twist Respiratory Virus Research Panel.

Le Twist Respiratory Virus Research Panel est livré avec un accès à l’outil One Codex basé sur le cloud. Idéal pour la recherche et les applications cliniques, cet outil peut servir à créer des visuels prêts à être publiés et des rapports imprimables pour les laboratoires préparant des tests développés en laboratoire.

Dans le cadre de l’utilisation du Twist Respiratory Virus Research Panel, la plateforme d’analyse One Codex est accessible à tous les clients. Cette plateforme est idéale pour la recherche et les applications cliniques, y compris la production de visuels prêts à être publiés, de rapports partageables et d’autres outils d’analyse. Lors de l’achat du panel, vous recevrez des instructions de mise en service et des crédits pour l’analyse d’échantillons sur la plateforme One Codex. Pour en savoir plus sur cette solution d’analyse d’échantillons microbiens, consultez le site Un Codex.