Le Kit de préparation de banque Twist FlexPrep^TM UHT adopte une nouvelle approche de Normalization by Ligation^TM qui élimine la nécessité d’une
 quantification des échantillons préalable et intermédiaire, fluidifiant ainsi votre flux de travail de séquençage.

Les réactions de fragmentation et de ligature sont préparées dans un puits par échantillon. Les adaptateurs utilisés lors de la ligature contiennent des codes-barres en ligne permettant de regrouper tous les 12 puits sur une ligne d’une plaque de 96 puits. Les pools individuels sont préparés avec des indices (UDI) ajoutés par PCR pour un démultiplexage au niveau du pool. Le débit de séquençage peut être optimisé en traitant jusqu’à 1 152 échantillons en un seul cycle de séquençage à partir d’un même kit FlexPrep. Ce surcroît d’efficacité peut donner lieu à des économies en termes de coûts et de consommables.

Normalisation de la profondeur de lecture NGS avec une entrée de masse d’ADN variable. Le pourcentage du nombre total de lectures identifiées pour chaque banque est calculé après un démultiplexage unique à index double et codes-barres en ligne. La moyenne avec normalisation parfaite est estimée à 1,04 % (100/96).

FlexPrep UHT génère des banques hautement complexes présentant une couverture uniforme après enrichissement ciblé. En association avec les panels personnalisés de Twist, FlexPrep propose une couverture ajustable pour les SNP, les k-mers, les variants structurels ainsi que d’autres domaines d’intérêt génomiques. Du matériel enrichi a été sous-échantillonné pour une moyenne de couverture de 75x. Les paramètres d’enrichissement ciblé de Picard sont indiqués.