Panel del metiloma humano Twist

El metiloma humano Twist contiene 3,98 M sitios de CpG mediante 123 Mb de contenido genómico dirigidos a marcadores de metilación biológicamente pertinentes. El panel está altamente orientado para capturar y detectar las regiones de metilación CpG más actuales, anotadas y relevantes del genoma. El 84 % (17.915.988) de las islas CpG en el genoma se identifica a través del enriquecimiento con este panel. Están cubiertas 105.288.339 bases adicionales de costas, estantes, CpG de mar abierto y pares de bases posteriores. Superposición de cobertura determinada por datos experimentales internos de la cobertura, incluida la cobertura de sombra en comparación con archivos de datos de cobertura de matrices.

Las micromatrices se diseñan con contenido estático que puede dificultar el descubrimiento de nuevos objetivos epigenéticos de interés. Las matrices actualmente disponibles en el mercado también presentan una cobertura limitada del metiloma en el epigenoma, lo que deja una gran proporción de sitios CpG metilados sin medir. El enfoque de enriquecimiento del objetivo del metiloma humano Twist soluciona estas limitaciones con los paneles de captura híbrida que permiten el contenido expandido y la resolución de una única base en la lectura de secuencia entera proporcionada por plataformas de secuenciación de última generación (NGS).

Las micromatrices presentan limitaciones inherentes en los extremos en cuanto a la detección de la metilación atribuidas a mucho ruido de fondo en el extremo bajo y a la saturación de la señal en el extremo alto. Debido al mayor intervalo dinámico proporcionado por la NGS, el panel del metiloma humano Twist puede proporcionar una activación más precisa de las regiones metiladas de forma diferencial (DMR), especialmente en los extremos superior e inferior de la fracción de metilación. 

El panel del metiloma humano Twist está diseñado y optimizado para laboratorios húmedos con el fin de proporcionar una eficiencia de captura híbrida precisa, sensible y de alto rendimiento. El panel logra una profundidad de cobertura del 90 % de las bases con una cobertura 30 veces superior con especificidades altas de sonda del 95 % de las tasas en el objetivo. El panel también alcanza un fold 80 de 1,54 a la hora de proporcionar una uniformidad alta en la región objetivo al reducir el delta entre picos y valles de las acumulaciones de activaciones de bases. La complejidad de la biblioteca quedó inversamente representada por una tasa de duplicación <4 % a una profundidad de secuenciación alta de 150x cobertura bruta. Las métricas de eficiencia general de captura del panel proporcionan un alto nivel de confianza en la detección en la fracción de metilación con un coste de secuenciación minimizado.