Présentation

Chimie fiable pour les échantillons difficiles

Les solutions de séquençage d’ARN Twist (RNA-Seq) sont conçues pour les échantillons difficiles (notamment, avec faibles quantités de départ et fixés au formol et inclus en paraffine) afin d’obtenir, avec un rendement élevé, des banques de haute qualité au moyen de flux de travail courts. Twist propose des flux de travail pour l’enrichissement ciblé et le transcriptome entier comprenant des options pour répondre au mieux aux besoins de votre application. Chaque flux de travail génère des banques de haute qualité prêtes à être séquencées à partir d’un large éventail de quantités de départ et de types d’échantillons, y compris des échantillons de recherche translationnelle.

Chimie fiable pour les échantillons difficiles

Les solutions de séquençage d’ARN Twist (RNA-Seq) sont conçues pour les échantillons difficiles (notamment, avec faibles quantités de départ et fixés au formol et inclus en paraffine) afin d’obtenir, avec un rendement élevé, des banques de haute qualité au moyen de flux de travail courts. Twist propose des flux de travail pour l’enrichissement ciblé et le transcriptome entier comprenant des options pour répondre au mieux aux besoins de votre application. Chaque flux de travail génère des banques de haute qualité prêtes à être séquencées à partir d’un large éventail de quantités de départ et de types d’échantillons, y compris des échantillons de recherche translationnelle.

Flux de travail

 

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Enrichissement ciblé

AVANTAGES

  • Capture de tous les gènes ou sous-ensembles de gènes d’intérêt
  • Enrichissement des fragments d’ARN endommagés provenant d’échantillons fixés au formol et inclus en paraffine
  • Enrichissement des transcrits complets pour les gènes exprimés
  • Création de panels d’ARN personnalisés

Spécifications

infi Module de réparation pour les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine inclus 
barre 1 - 1000 ng 
temps Préparation de la banque :  4,5 - 5 h
mag Enrichissement : pendant la nuit (16 heures) avec Standard Hyb

v2 ou 5 heures avec Twist Fast Hyb et Wash

 

Gamme de produits

Transcriptome entier

AVANTAGES

  • Profilage non biaisé des ARN exprimés
  • Compatible avec les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine
  • Déplétion des gènes de l’ARNr et de la globine
  • Flux de travail rapide

Spécifications

infi Module de réparation pour les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine inclus 
barre 1 - 1000 ng 
temps Préparation de la banque : 4,5 - 5 heures (6 - 6,5 heures avec le module de déplétion)
mag Enrichissement : S.O. 

 

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AVANTAGES

  • Capture de tous les gènes ou sous-ensembles de gènes d’intérêt
  • Enrichissement des fragments d’ARN endommagés provenant d’échantillons fixés au formol et inclus en paraffine
  • Enrichissement des transcrits complets pour les gènes exprimés
  • Création de panels d’ARN personnalisés

Spécifications

infi Module de réparation pour les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine inclus 
barre 1 - 1000 ng 
temps Préparation de la banque :  4,5 - 5 h
mag Enrichissement : pendant la nuit (16 heures) avec Standard Hyb

v2 ou 5 heures avec Twist Fast Hyb et Wash

 

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Transcriptome entier

AVANTAGES

  • Profilage non biaisé des ARN exprimés
  • Compatible avec les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine
  • Déplétion des gènes de l’ARNr et de la globine
  • Flux de travail rapide

Spécifications

infi Module de réparation pour les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine inclus 
barre 1 - 1000 ng 
temps Préparation de la banque : 4,5 - 5 heures (6 - 6,5 heures avec le module de déplétion)
mag Enrichissement : S.O. 

 

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Témoignages

Ce que les scientifiques ont à dire

Le transcriptome offre un accès plus direct à l’état biologique réel de la cellule tumorale, contrairement à la nature plus « statique » de l’ADN. Avec une seule préparation de banque et à partir de trois à cinq coupes de tissus fixés au formol et inclus en paraffine, le kit RNA Exome permet l’analyse parallèle de l’expression des gènes, la détection des fusions, l’identification des variants et des signatures tumorales, etc. Ce kit est un test prometteur à intégrer durablement dans nos routines cliniques.

Dr Koen Jacobs, pathologiste moléculaire, AZ Sint-Lucas

Avis de non-responsabilité : Les résultats présentés sont ceux de l’institution dans laquelle ils ont été obtenus et peuvent ne pas refléter les résultats réalisables dans d’autres institutions.

La technologie d’enrichissement ciblé Twist Target Enrichment est un flux de travail efficace qui nous permet d’analyser avec précision des échantillons de patients contenant plus de 80 variants de fusion dans un flux de travail de laboratoire à haut débit.

Dr Florian Battke, directeur du développement, CeGaT GmbH

Avis de non-responsabilité : Les résultats présentés sont ceux de l’institution dans laquelle ils ont été obtenus et peuvent ne pas refléter les résultats réalisables dans d’autres institutions.

Ce que les scientifiques ont à dire

Le transcriptome offre un accès plus direct à l’état biologique réel de la cellule tumorale, contrairement à la nature plus « statique » de l’ADN. Avec une seule préparation de banque et à partir de trois à cinq coupes de tissus fixés au formol et inclus en paraffine, le kit RNA Exome permet l’analyse parallèle de l’expression des gènes, la détection des fusions, l’identification des variants et des signatures tumorales, etc. Ce kit est un test prometteur à intégrer durablement dans nos routines cliniques.

Dr Koen Jacobs, pathologiste moléculaire, AZ Sint-Lucas

Avis de non-responsabilité : Les résultats présentés sont ceux de l’institution dans laquelle ils ont été obtenus et peuvent ne pas refléter les résultats réalisables dans d’autres institutions.

La technologie d’enrichissement ciblé Twist Target Enrichment est un flux de travail efficace qui nous permet d’analyser avec précision des échantillons de patients contenant plus de 80 variants de fusion dans un flux de travail de laboratoire à haut débit.

Dr Florian Battke, directeur du développement, CeGaT GmbH

Avis de non-responsabilité : Les résultats présentés sont ceux de l’institution dans laquelle ils ont été obtenus et peuvent ne pas refléter les résultats réalisables dans d’autres institutions.

Ressources
FAQ

FAQ

Le Twist RNA Exome est un enrichissement ciblé qui constitue un outil fiable pour générer des données de séquençage du transcriptome à partir d’ARN extrait de diverses sources, y compris les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine. L’exome d’ARN augmente le signal tout en nécessitant moins de lectures de séquençage pour le même nombre de gènes détectés. De plus, l’approche conceptuelle « axée sur les exons » de RNA Exome permet la détection d’isoformes et de jonctions qui seraient autrement perdues avec les méthodes habituelles.

Le module de déplétion est conçu pour travailler avec des échantillons contenant du sang ou d’autres pour lesquels l’élimination des ARNr contaminants et de la globine peut être intéressante.

Le module de réparation pour les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine consiste en une étape optionnelle incluse dans la préparation de banque. Il aide à la déréticulation de l’ADN d’échantillons fixés au formol, ce qui facilite la participation de ces séquences à la génération ultérieure de la banque.

Oui, l’équipe d’experts en bioinformatique de Twist peut créer des panels pour de nombreux organismes différents, comme les microbes, ou pour une variété d’applications.

FAQ

Le Twist RNA Exome est un enrichissement ciblé qui constitue un outil fiable pour générer des données de séquençage du transcriptome à partir d’ARN extrait de diverses sources, y compris les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine. L’exome d’ARN augmente le signal tout en nécessitant moins de lectures de séquençage pour le même nombre de gènes détectés. De plus, l’approche conceptuelle « axée sur les exons » de RNA Exome permet la détection d’isoformes et de jonctions qui seraient autrement perdues avec les méthodes habituelles.

Le module de déplétion est conçu pour travailler avec des échantillons contenant du sang ou d’autres pour lesquels l’élimination des ARNr contaminants et de la globine peut être intéressante.

Le module de réparation pour les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine consiste en une étape optionnelle incluse dans la préparation de banque. Il aide à la déréticulation de l’ADN d’échantillons fixés au formol, ce qui facilite la participation de ces séquences à la génération ultérieure de la banque.

Oui, l’équipe d’experts en bioinformatique de Twist peut créer des panels pour de nombreux organismes différents, comme les microbes, ou pour une variété d’applications.

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