La récente pandémie de Coronavirus a suscité une réponse rapide des équipes de recherche et de traitement du monde entier. Ces équipes de recherche ont besoin d’outils génomiques performants et fiables pour classer et caractériser les échantillons viraux, et d’outils d’ingénierie génomique pour développer des vaccins afin d’enrayer la propagation de ce virus mortel.
La plateforme unique d’écriture d’ADN sur silicone de Twist Bioscience permet le développement rapide de panels NGS pour la détection virale et la caractérisation d’échantillons, et nos gènes clonaux et fragments de gène permettent le développement rapide de vaccins sous-unitaires à partir d’un ou plusieurs gènes viraux ou séquences peptidiques présentant des antigènes, ce qui évite aux scientifiques de devoir manipuler des agents pathogènes vivants et potentiellement dangereux, et minimise le temps nécessaire au clonage de fragments d’ADN.
Maintenant disponible : Contrôles synthétiques des souches variantes Alpha, Beta, Gamma et Delta et Omicron (B.1.1.7, B.1.351, P.1, B.1.617.2, AY.1, AY.2 B.1.1.529 BA.1, B.1.1.529 BA.2)
En réponse à l’émergence continue de nouvelles souches de SARS-CoV-2, Twist Bioscience a élargi son portefeuille de contrôles l’ARN synthétique, en ajoutant les contrôles suivants couvrant les nouvelles souches qui deviennent rapidement les variants dominants dans le monde. Ces souches hautement infectieuses de SARS-CoV-2 présentent des changements significatifs dans leur génome, notamment des modifications de la région codant pour la protéine de spicule. Ces changements peuvent rendre certaines sondes de RT-PCR, largement utilisées dans les tests COVID-19, inadéquates pour la détection du gène S.
Twist Bioscience a ajouté quatre nouveaux contrôles synthétiques qui couvrent ces variantes. Les contrôles ARN synthétiques fournissent des mesures de contrôle de la qualité pour une large gamme d’applications, parmi lesquelles la vérification et la validation des tests de diagnostiques des analyses de NGS et de RT-PCR.
Produits :
Contrôle 14 Angleterre/205041766/2020 (lignée B.1.1.7)
Contrôle 15 Angleterre/MILK-9E05B3/2020 (lignée B.1.1.7)
Contrôle 16 Afrique du Sud/KRISP-EC-K005299/2020 (lignée B.1.351)
Contrôle 17 Japon/IC-0564/2021 (lignée P.1)
Contrôle 18 Kappa (lignée B.1.617.1) Inde/CT-ILSGS00361/202
Contrôle 23 Delta (B.1.617.2 lignée) Inde/MH-NCCS-P1162000182735/2021
Contrôle 24 (B.1.617.3 lignée) Inde/MH-SEQ-221_S66_R1_001/2021
Contrôle 28 Delta (lignée AY.1) Portugal/PT9543/2021
Contrôle 29 Delta (lignée AY.2) États-Unis/WA-CDC-UW21061750277/2021
Contrôle 48 Omicron (lignée B.1.1.529, BA.1) Hong Kong/HKU-211129-001/2021
Contrôle 50 Omicron (lignée B.1.1.529, BA.2) Australie/QLD2568/2021
Contrôle 51 Omicron (B.1.1.529, lignée BA.2) Angleterre/MILK-2DF642C/2021
Anticorps COVID-19
Les anticorps ciblant la protéine de spicule du SARS-CoV-2 et l’ACE2 humain ont été développés grâce aux capacités de génération de banques de variants et de criblage de Twist Biopharma. Des données et des informations sur ces anticorps sont disponibles sur le lien ci-dessous.
Comprehensive Viral Research Panel
Le Twist Comprehensive Viral Research Panel offre une solution complète d’enrichissement ciblé qui permet aux chercheurs d’identifier et de caractériser rapidement les nouveaux virus et les virus très évolués dans divers types d’échantillons. Il couvre les séquences de référence de 3 153 virus, dont 15 488 souches différentes.
Ressources associées :
Twist Respiratory Virus Research Panel
Le Twist Respiratory Virus Research Panel permet de détecter plusieurs agents pathogènes viraux à partir d’un seul échantillon, en détectant à peine 100 copies de matériel viral par virus. Grâce à l’analyse effectuée par One Codex, les chercheurs peuvent générer des rapports avec identification des espèces virales et créer des visualisations prêtes à être publiées.
Produits :
- Twist Respiratory Virus Research Panel associé au logiciel One Codex, 2 Réactions, Kit - Référence : 103066
- Twist Respiratory Virus Research Panel associé au logiciel One Codex, 12 Réactions, Kit - Référence : 103067
- Twist Respiratory Virus Research Panel associé au logiciel One Codex, 96 Réactions, Kit - Référence : 103068
Ressources associées :
- [Fiche produit] Twist Respiratory Virus Research Panel
- [Note d’application] Enrichissement de cibles pour NGS pour pathogènes viraux à l’aide du Twist Respiratory Virus Research Panel
Contrôles des virus respiratoires
Les Twist Respiratory Virus Controls permettent d’effectuer des recherches sur la biologie d’une large gamme de virus par NGS et qPCR. Le panel inclut divers variants avec une couverture exhaustive des séquences de virus synthétiques pleine longueur, ce qui permet de faire la distinction entre les principaux agents infectieux.
Ressources associées :
Contrôles synthétiques de l’ARN du
SARS-CoV-2
Les contrôles positifs permettent d’obtenir des mesures de contrôle de la qualité pour la vérification et la validation des tests de diagnostic au point de service, y compris le NGS et les tests RT-PCR. Twist Bioscience propose des contrôles d’ARN SARS-CoV-2 entièrement synthétiques, pour plusieurs séquences de référence distinctes.
Ressources associées :
Panels de recherche SARS-CoV-2
Outre les normes d’ARN rigoureuses, Twist Bioscience propose également des panels d’enrichissement ciblés NGS à usage exclusif de la recherche (RUO) pour la détection et la caractérisation virales des échantillons. Ces panels sont adaptés au contrôle environnemental et aux tests de surveillance, tout en apportant des informations sur la séquence complète pour le suivi de l’évolution virale et de l’origine des souches.
Produits :
- Panel de recherche SARS-CoV-2 Twist Bioscience, 2 Réactions, Kit - Référence : 102016
- Panel de recherche SARS-CoV-2 Twist Bioscience, 12 Réactions, Kit - Référence : 102017
- Panel de recherche SARS-CoV-2 Twist Bioscience, 96 Réactions, Kit - Référence : 102018
Ressources associées :
- [Fiche produit] Panel de recherche SARS-CoV-2 Twist Bioscience
- [Note d’application] Capture de cible par NGS pour la détection et la caractérisation du SARS-CoV-2
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Ressources complémentaires :
À regarder maintenant : Pourquoi les laboratoires impriment le génome du Coronavirus
Découvrez comme le Dr Aaron Sato, le CSO et dirigeant de la division Biopharma de Twist, développe des traitements à base d’anticorps pour lutter contre l’infection par la COVID-19.