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PRÉSENTATION

Une meilleure détection des CNV

Le séquençage de l’exome est un puissant outil d’analyse des régions codantes des protéines du génome. Il couvre environ 1 à 2 % de toutes les bases du génome humain. Si cette méthode rend l’analyse génétique plus efficace que le séquençage du génome entier, elle tend à laisser de côté de grandes régions intergéniques, ce qui peut rendre difficile la détection des variations du nombre de copies (Copy Number Variations, CNV).

Les CNV jouent un rôle crucial dans de nombreuses maladies génétiques. Or, le procédé standard de séquençage de l’exome manque de sondes espacées uniformément pour les identifier de manière fiable.

Les panels spike-in de squelette de CNV Twist sont conçus pour améliorer la détection des CNV en ajoutant des sondes à l’espacement uniforme à travers le génome. Disponibles en trois niveaux de résolution (100 Ko, 50 Ko et 25 Ko), ces panels permettent aux chercheurs d’affiner l’analyse des CNV selon leurs besoins spécifiques.

Intégrer des panels spike-in de squelette de CNV à votre flux de travail d’exome est simple : il suffit de les combiner avec votre panneau d’exome et de suivre les protocoles d’enrichissement ciblé standard de Twist.

Une résolution précise des CNV
Une résolution précise des CNV
Choisissez entre 100 Ko (résolution inférieure), 50 Ko (résolution intermédiaire) ou 25 Ko (haute résolution).
Les sondes sont disposées de façon stratégique dans les régions intergéniques pour améliorer la détection des CNV.
S’intègrent aisément à votre panel d’exome pour un séquençage amélioré de l’exome complet.
Intégration facile
Une intégration facile avec les solutions d’exome Twist
Conçus pour être combinés avec l’exome 2.0 Twist et le panel Comprehensive Spike-in.
Disponibles aux formats 2 réactions (16 échantillons) et 12 réactions (96 échantillons)

Sélectionnez la résolution CNV qu’il vous faut

Panels spike-in de squelette de CNV :
25 Ko
50 Ko
100 Ko

Taille de conception du panel (Mo)

8,32

3,33

1,39

SNV et INDEL appelés

265138

207765

181956

Tous les CNV appelés

472

446

411

CNV de moins de 50 kb appelés

417

385

361

Couverture moyenne de la cible

150

171

161

 

Tableau 1. Exemples de données des panels spike-in de squelette de CNV Twist. Un ensemble d’échantillons hautement caractérisé connu pour contenir des CNV (1) et un ensemble de référence de 12 individus sains ont été séquencés avec 2x150 lectures sur un Illumina NovaSeq 6000. Le nombre moyen de SNV, d’INDEL et de CNV appelés et la profondeur de séquençage à chaque densité de sonde ont été déterminés pour chacun des panels lorsqu’ils ont été introduits dans l’exome Twist 2.0 plus Comprehensive Spike-in. L’appel des CNV a été effectué avec une solution logicielle disponible sur le marché (2)
 

(1) CNVPANEL01 du Coriell Institute, panel CNV humain de référence.
(2) Plateforme eVai (workflow secondaire), logiciel enGenome. 

Une meilleure détection des CNV

Le séquençage de l’exome est un puissant outil d’analyse des régions codantes des protéines du génome. Il couvre environ 1 à 2 % de toutes les bases du génome humain. Si cette méthode rend l’analyse génétique plus efficace que le séquençage du génome entier, elle tend à laisser de côté de grandes régions intergéniques, ce qui peut rendre difficile la détection des variations du nombre de copies (Copy Number Variations, CNV).

Les CNV jouent un rôle crucial dans de nombreuses maladies génétiques. Or, le procédé standard de séquençage de l’exome manque de sondes espacées uniformément pour les identifier de manière fiable.

Les panels spike-in de squelette de CNV Twist sont conçus pour améliorer la détection des CNV en ajoutant des sondes à l’espacement uniforme à travers le génome. Disponibles en trois niveaux de résolution (100 Ko, 50 Ko et 25 Ko), ces panels permettent aux chercheurs d’affiner l’analyse des CNV selon leurs besoins spécifiques.

Intégrer des panels spike-in de squelette de CNV à votre flux de travail d’exome est simple : il suffit de les combiner avec votre panneau d’exome et de suivre les protocoles d’enrichissement ciblé standard de Twist.

Une résolution précise des CNV
Une résolution précise des CNV
Choisissez entre 100 Ko (résolution inférieure), 50 Ko (résolution intermédiaire) ou 25 Ko (haute résolution).
Les sondes sont disposées de façon stratégique dans les régions intergéniques pour améliorer la détection des CNV.
S’intègrent aisément à votre panel d’exome pour un séquençage amélioré de l’exome complet.
Intégration facile
Une intégration facile avec les solutions d’exome Twist
Conçus pour être combinés avec l’exome 2.0 Twist et le panel Comprehensive Spike-in.
Disponibles aux formats 2 réactions (16 échantillons) et 12 réactions (96 échantillons)

Sélectionnez la résolution CNV qu’il vous faut

Panels spike-in de squelette de CNV :
25 Ko
50 Ko
100 Ko

Taille de conception du panel (Mo)

8,32

3,33

1,39

SNV et INDEL appelés

265138

207765

181956

Tous les CNV appelés

472

446

411

CNV de moins de 50 kb appelés

417

385

361

Couverture moyenne de la cible

150

171

161

 

Tableau 1. Exemples de données des panels spike-in de squelette de CNV Twist. Un ensemble d’échantillons hautement caractérisé connu pour contenir des CNV (1) et un ensemble de référence de 12 individus sains ont été séquencés avec 2x150 lectures sur un Illumina NovaSeq 6000. Le nombre moyen de SNV, d’INDEL et de CNV appelés et la profondeur de séquençage à chaque densité de sonde ont été déterminés pour chacun des panels lorsqu’ils ont été introduits dans l’exome Twist 2.0 plus Comprehensive Spike-in. L’appel des CNV a été effectué avec une solution logicielle disponible sur le marché (2)
 

(1) CNVPANEL01 du Coriell Institute, panel CNV humain de référence.
(2) Plateforme eVai (workflow secondaire), logiciel enGenome. 

PASSER COMMANDE
Haute résolution : 

110756

Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 25 Ko, kit 2 réactions

110757

Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 25 Ko, kit 12 réactions
Résolution intermédiaire :

110758

Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 50 Ko, kit 2 réactions

110759

Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 50 Ko, kit 12 réactions
Basse résolution : 

110760

Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 100 Ko, kit 2 réactions

110761

Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 100 Ko, kit 12 réactions
Panels d’exome

104132

Kit Twist Exome 2.0, 2 réactions

104134

Kit Twist Exome 2.0, 12 réactions

104136

Kit Twist Exome 2.0, 96 réactions

105034

Exome Twist 2.0 plus Intégration facile de contenu dans le panel complet d’exomes, 2 réactions

105035

Exome Twist 2.0 plus Intégration facile de contenu dans le panel complet d’exomes, 12 réactions

105036

Exome Twist 2.0 plus Intégration facile de contenu dans le panel complet d’exomes, 96 réactions

*Réservé à la recherche. L’utilisation du site Web et des produits de Twist est soumise aux conditions générales de Twist. 

Haute résolution : 

110756

Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 25 Ko, kit 2 réactions

110757

Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 25 Ko, kit 12 réactions
Résolution intermédiaire :

110758

Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 50 Ko, kit 2 réactions

110759

Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 50 Ko, kit 12 réactions
Basse résolution : 

110760

Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 100 Ko, kit 2 réactions

110761

Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 100 Ko, kit 12 réactions
Panels d’exome

104132

Kit Twist Exome 2.0, 2 réactions

104134

Kit Twist Exome 2.0, 12 réactions

104136

Kit Twist Exome 2.0, 96 réactions

105034

Exome Twist 2.0 plus Intégration facile de contenu dans le panel complet d’exomes, 2 réactions

105035

Exome Twist 2.0 plus Intégration facile de contenu dans le panel complet d’exomes, 12 réactions

105036

Exome Twist 2.0 plus Intégration facile de contenu dans le panel complet d’exomes, 96 réactions

*Réservé à la recherche. L’utilisation du site Web et des produits de Twist est soumise aux conditions générales de Twist. 

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