Une meilleure détection des CNV
Le séquençage de l’exome est un puissant outil d’analyse des régions codantes des protéines du génome. Il couvre environ 1 à 2 % de toutes les bases du génome humain. Si cette méthode rend l’analyse génétique plus efficace que le séquençage du génome entier, elle tend à laisser de côté de grandes régions intergéniques, ce qui peut rendre difficile la détection des variations du nombre de copies (Copy Number Variations, CNV).
Les CNV jouent un rôle crucial dans de nombreuses maladies génétiques. Or, le procédé standard de séquençage de l’exome manque de sondes espacées uniformément pour les identifier de manière fiable.
Les panels spike-in de squelette de CNV Twist sont conçus pour améliorer la détection des CNV en ajoutant des sondes à l’espacement uniforme à travers le génome. Disponibles en trois niveaux de résolution (100 Ko, 50 Ko et 25 Ko), ces panels permettent aux chercheurs d’affiner l’analyse des CNV selon leurs besoins spécifiques.
Intégrer des panels spike-in de squelette de CNV à votre flux de travail d’exome est simple : il suffit de les combiner avec votre panneau d’exome et de suivre les protocoles d’enrichissement ciblé standard de Twist.


Sélectionnez la résolution CNV qu’il vous faut
Panels spike-in de squelette de CNV : |
25 Ko |
50 Ko |
100 Ko |
Taille de conception du panel (Mo) |
8,32 |
3,33 |
1,39 |
SNV et INDEL appelés |
265138 |
207765 |
181956 |
Tous les CNV appelés |
472 |
446 |
411 |
CNV de moins de 50 kb appelés |
417 |
385 |
361 |
Couverture moyenne de la cible |
150 |
171 |
161 |
Tableau 1. Exemples de données des panels spike-in de squelette de CNV Twist. Un ensemble d’échantillons hautement caractérisé connu pour contenir des CNV (1) et un ensemble de référence de 12 individus sains ont été séquencés avec 2x150 lectures sur un Illumina NovaSeq 6000. Le nombre moyen de SNV, d’INDEL et de CNV appelés et la profondeur de séquençage à chaque densité de sonde ont été déterminés pour chacun des panels lorsqu’ils ont été introduits dans l’exome Twist 2.0 plus Comprehensive Spike-in. L’appel des CNV a été effectué avec une solution logicielle disponible sur le marché (2)
(1) CNVPANEL01 du Coriell Institute, panel CNV humain de référence.
(2) Plateforme eVai (workflow secondaire), logiciel enGenome.
Une meilleure détection des CNV
Le séquençage de l’exome est un puissant outil d’analyse des régions codantes des protéines du génome. Il couvre environ 1 à 2 % de toutes les bases du génome humain. Si cette méthode rend l’analyse génétique plus efficace que le séquençage du génome entier, elle tend à laisser de côté de grandes régions intergéniques, ce qui peut rendre difficile la détection des variations du nombre de copies (Copy Number Variations, CNV).
Les CNV jouent un rôle crucial dans de nombreuses maladies génétiques. Or, le procédé standard de séquençage de l’exome manque de sondes espacées uniformément pour les identifier de manière fiable.
Les panels spike-in de squelette de CNV Twist sont conçus pour améliorer la détection des CNV en ajoutant des sondes à l’espacement uniforme à travers le génome. Disponibles en trois niveaux de résolution (100 Ko, 50 Ko et 25 Ko), ces panels permettent aux chercheurs d’affiner l’analyse des CNV selon leurs besoins spécifiques.
Intégrer des panels spike-in de squelette de CNV à votre flux de travail d’exome est simple : il suffit de les combiner avec votre panneau d’exome et de suivre les protocoles d’enrichissement ciblé standard de Twist.


Sélectionnez la résolution CNV qu’il vous faut
Panels spike-in de squelette de CNV : |
25 Ko |
50 Ko |
100 Ko |
Taille de conception du panel (Mo) |
8,32 |
3,33 |
1,39 |
SNV et INDEL appelés |
265138 |
207765 |
181956 |
Tous les CNV appelés |
472 |
446 |
411 |
CNV de moins de 50 kb appelés |
417 |
385 |
361 |
Couverture moyenne de la cible |
150 |
171 |
161 |
Tableau 1. Exemples de données des panels spike-in de squelette de CNV Twist. Un ensemble d’échantillons hautement caractérisé connu pour contenir des CNV (1) et un ensemble de référence de 12 individus sains ont été séquencés avec 2x150 lectures sur un Illumina NovaSeq 6000. Le nombre moyen de SNV, d’INDEL et de CNV appelés et la profondeur de séquençage à chaque densité de sonde ont été déterminés pour chacun des panels lorsqu’ils ont été introduits dans l’exome Twist 2.0 plus Comprehensive Spike-in. L’appel des CNV a été effectué avec une solution logicielle disponible sur le marché (2)
(1) CNVPANEL01 du Coriell Institute, panel CNV humain de référence.
(2) Plateforme eVai (workflow secondaire), logiciel enGenome.
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Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 25 Ko, kit 2 réactions110757
Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 25 Ko, kit 12 réactions110758
Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 50 Ko, kit 2 réactions110759
Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 50 Ko, kit 12 réactions110760
Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 100 Ko, kit 2 réactions110761
Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 100 Ko, kit 12 réactions104132
Kit Twist Exome 2.0, 2 réactions104134
Kit Twist Exome 2.0, 12 réactions104136
Kit Twist Exome 2.0, 96 réactions105034
Exome Twist 2.0 plus Intégration facile de contenu dans le panel complet d’exomes, 2 réactions105035
Exome Twist 2.0 plus Intégration facile de contenu dans le panel complet d’exomes, 12 réactions105036
Exome Twist 2.0 plus Intégration facile de contenu dans le panel complet d’exomes, 96 réactions*Réservé à la recherche. L’utilisation du site Web et des produits de Twist est soumise aux conditions générales de Twist.
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Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 25 Ko, kit 2 réactions110757
Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 25 Ko, kit 12 réactions110758
Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 50 Ko, kit 2 réactions110759
Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 50 Ko, kit 12 réactions110760
Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 100 Ko, kit 2 réactions110761
Panel spike-in de squelette de CNV Twist de 100 Ko, kit 12 réactions104132
Kit Twist Exome 2.0, 2 réactions104134
Kit Twist Exome 2.0, 12 réactions104136
Kit Twist Exome 2.0, 96 réactions105034
Exome Twist 2.0 plus Intégration facile de contenu dans le panel complet d’exomes, 2 réactions105035
Exome Twist 2.0 plus Intégration facile de contenu dans le panel complet d’exomes, 12 réactions105036
Exome Twist 2.0 plus Intégration facile de contenu dans le panel complet d’exomes, 96 réactions*Réservé à la recherche. L’utilisation du site Web et des produits de Twist est soumise aux conditions générales de Twist.
Protocole
Préparation de banque FE 2.0 avec Fragmentation enzymatique et Twist Universal Adapter System
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