Kit de préparation de banque cfDNA

Haute sensibilité. Haute conversion. Faible débit

Le kit de préparation de banque cfDNA Twist permet de relever les défis associés à la préparation de banques d’ADN libre circulant (acellulaire). Les biopsies de liquide jouent un rôle croissant dans la recherche en oncologie, notamment pour l’étude de biomarqueurs potentiels à partir du matériel génétique des tumeurs présentes dans le sang circulant. Ce kit permet de générer des banques d’ADN libre circulant à haute conversion pour la technologie NGS sur les systèmes Illumina. Cette solution vient à bout des défis techniques associés au faible débit et à la dégradation de l’ADN libre circulant, ainsi que ceux liés aux échantillons difficiles à obtenir et dont la teneur en ADN est limitée (c.-à-d. les échantillons d’urine et de LCR).

Les kits de préparation de banque cfDNA Twist constituent le meilleur outil de préparation de banques, offrant des performances stables avec une faible quantité d’échantillons et des taux de conversion élevés.

Le kit de préparation de banque cfDNA Twist, le kit de préparation de banque cfDNA Twist et le kit de mélange pour hybridation permettent des flux de travail de séquençage du génome entier et d’enrichissement ciblé.

Avantages

Optimiser la détection des variants rares

Le taux de conversion élevé assure la détection fiable de variants rares (fréquence allélique de variants ≤ 0,1 %).

Banques à forte couverture compatibles avec les flux de travail de séquençage duplex pris en charge par le système d’adaptateur Twist UMI

Rationaliser le flux de travail des échantillons précieux

Des performances stables, même avec de faibles quantités d’échantillons (< 1 ng)

Banques prêtes à séquencer en 2 heures

*Réservé à l’utilisation dans le cadre de la recherche. Ne pas utiliser dans le cadre de procédures diagnostiques ou cliniques

Témoignage client

« Nous avons effectué une analyse génomique des mutations génétiques qui s’accumulent dans les organes solides et nous construisons un système de détection qui peut détecter de manière fiable les variants à faible fréquence des mutations somatiques. Le kit de préparation de banque d’ADNlc Twist, offre non seulement un rendement de banque comparable à la méthode conventionnelle à partir d’une petite quantité (1,5 ng) d’ADN fragmenté, même si nous réduisons d’un cycle PCR, mais augmente également la couverture moyenne de la séquence cible capturée existante de 30 % après avoir construit des lectures corrigées des erreurs à l’aide d’indices moléculaires uniques. Le processus de ligature de Twist est simple et rapide pour la préparation de banques et devrait permettre d’étendre l’application du codage à barres moléculaire dans les systèmes de traçabilité. » – Dr Nobuyuki Kakiuchi

Professeur associé, Projet Hakubi, Département de pathologie et de biologie des tumeurs, Troisième cycle de médecine, Université de Kyoto, Japon.

* Les résultats présentés sont ceux de l’institution dans laquelle ils ont été obtenus et peuvent ne pas refléter les résultats réalisables dans d’autres institutions.

Taux de conversion plus élevé = rendement plus élevé

Le kit de préparation de banque cfDNA Twist produit des banques d’ADN libre circulant à un rendement plus élevé.

Après la génération de banques, les échantillons ont été élués dans 20 μL d’eau et 1 µL ont été quantifiés grâce au QubitTM dsDNA Broad Range Kit.

Sensibilité et précision accrues

Le kit de préparation de banque cfDNA Twist et le kit de mélange pour hybridation assurent une détection sensible et précise des variants avec une fréquence allélique de variants de 0,25 %.

Les banques ont été créées en uniplexe avec un panel oncologique personnalisé de 50 kb ciblant 217 sites de variant SNP dans le matériel standard Pan-Cancer. Les variants manqués sont calculés en additionnant les sites avec moins de 1 famille de variants divisés par le total des sites de variants détectables.

Duplexage amélioré = plus grande complexité

Le kit de préparation de banque cfDNA Twist et le kit de mélange pour hybridation offrent une plus grande complexité avec et sans déduplication UMI.

Les banques ont été créées en uniplexe avec un panel oncologique personnalisé de 50 kb ciblant des sites variants dans le matériel standard de l’ADN libre circulant avec une recommandation TE présente ou mise à jour.