Générez 99 % des variants souhaités
Les cribles d’ingénierie des protéines faisant appel à des banques de variants à site unique permettent aux chercheurs d’explorer les régions de séquence d’une protéine et d’étudier la relation entre séquence, structure et fonction des protéines.
La conception de la SSVL de Twist s’appuie sur la synthèse en parallèle d’oligonucléotides à l’aide de la plateforme de synthèse d’ADN au silicone exclusive de Twist. Les banques de Twist sont vérifiées par NGS afin de confirmer que tous les variants souhaités sont présents dans les proportions souhaitées.
Commencez à concevoir dès maintenant votre banque : une équipe d’experts est à votre disposition pour vous aider à concevoir une banque adaptée à vos besoins spécifiques. Commandez et concevez ici.
Découvrez comment Twist aide les entreprises pharmaceutiques à caractériser et à cataloguer les mutations du gène KRAS grâce à des cribles de mutagenèse par saturation à grande échelle.
Découvrez comment les banques de variantes à site unique (SSVL) de Twist permettent d’analyser les régions de séquence pour identifier les résidus clés de la fonction et de la structure des protéines.
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Générez 99 % des variants souhaités
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La conception de la SSVL de Twist s’appuie sur la synthèse en parallèle d’oligonucléotides à l’aide de la plateforme de synthèse d’ADN au silicone exclusive de Twist. Les banques de Twist sont vérifiées par NGS afin de confirmer que tous les variants souhaités sont présents dans les proportions souhaitées.
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Les banques de saturation de site éliminent le biais de codon et les substitutions indésirables, contrairement aux approches traditionnelles telles que les méthodes par dégradation et NNK.
TRIM offre un faible rendement répétitif, conduisant à <50 % de produit de pleine longueur dans une banque classique, tandis que les banques Twist produisent davantage de variants exploitables, augmentant ainsi la taille effective de la banque.
| PCR à risque d’erreur | Dégradation
(NNK/NNS) |
Banques de variants à saturation de site (SSVL) Twist |
|
|---|---|---|---|
| Élimine le biais de séquence | Non | Non | Oui |
| Nombre de codons disponibles | Inconnu | 32 | Tous 64 |
| Évite les motifs indésirables | Non | Non | Oui |
| Permet l’optimisation des codons | Non | Non | Oui |
| Évite les codons d’arrêt | Non | Oui | Oui |
Les SSVL permettent un échantillonnage efficace des régions de séquence d’une protéine dans les analyses de criblage.
Cette figure montre la distribution observée des acides aminés sur 65 positions dans la protéine (19 variants prévus par position) lorsqu’elle est constituée de SSVL Twist par rapport à une PCR à risque d’erreurs. Les barres représentent une position d’acide aminé différente, chaque couleur indiquant la fréquence du variant observé. Tous les variants sont présents dans les proportions attendues dans la banque Twist.
Les banques de saturation de site éliminent le biais de codon et les substitutions indésirables, contrairement aux approches traditionnelles telles que les méthodes par dégradation et NNK.
TRIM offre un faible rendement répétitif, conduisant à <50 % de produit de pleine longueur dans une banque classique, tandis que les banques Twist produisent davantage de variants exploitables, augmentant ainsi la taille effective de la banque.
| PCR à risque d’erreur | Dégradation
(NNK/NNS) |
Banques de variants à saturation de site (SSVL) Twist |
|
|---|---|---|---|
| Élimine le biais de séquence | Non | Non | Oui |
| Nombre de codons disponibles | Inconnu | 32 | Tous 64 |
| Évite les motifs indésirables | Non | Non | Oui |
| Permet l’optimisation des codons | Non | Non | Oui |
| Évite les codons d’arrêt | Non | Oui | Oui |
Les SSVL permettent un échantillonnage efficace des régions de séquence d’une protéine dans les analyses de criblage.
Cette figure montre la distribution observée des acides aminés sur 65 positions dans la protéine (19 variants prévus par position) lorsqu’elle est constituée de SSVL Twist par rapport à une PCR à risque d’erreurs. Les barres représentent une position d’acide aminé différente, chaque couleur indiquant la fréquence du variant observé. Tous les variants sont présents dans les proportions attendues dans la banque Twist.
Une nouvelle approche pour la conception de vos banques
Le nouvel outil de conception de banques (DLD) est votre solution unique pour rationaliser, optimiser et accélérer le processus de conception et de commande de banques d’ADN.
En cas de questions, ne pas hésiter à nous envoyer un e-mail à [email protected].
Jetez un coup d’œil à notre outil de conception de banques
Une nouvelle approche pour la conception de vos banques chez Twist
Regardez étape par étape comment optimiser vos séquences
Commençons
Le nouvel outil de conception de banques est votre solution unique pour rationaliser, optimiser et accélérer le processus de conception et de commandes des banques d’ADN.
Étape 1
Connectez-vous à votre compte. Si vous n’en avez pas, quelques minutes suffisent pour le créer.
Étape 2
Commencez à concevoir votre banque à l’aide du nouvel outil interactif spécialisé doté d’un assistant qui vous guidera pas à pas. Avec cette option, vous pouvez optimiser votre banque en temps réel avec des validations à la volée et une tarification en temps réel. Recevez votre cahier des charges à la fin du processus de soumission.
Étape 3
Une fois le devis accepté par le client, l’équipe chargée des banques envoie le projet à l’équipe de production
Commencez à concevoir dès maintenant
Remarque :
L’outil de conception de banques n’est pas encore disponible dans la région APAC. Veuillez vérifier la date de disponibilité auprès de votre équipe d’assistance locale.
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Fiche produit
Affiche
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Une synthèse de précision des banques de variants permet une interrogation en profondeur d’un espace de variant à site unique
Dépliant
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