Ressources/Note d’application
Analyse des génomes viraux à l’aide d’oligonucléotides de 300 mer pour étudier la perte immunitaire
Découvrez comment les oligonucléotides de 300 mer permettent de parcourir les génomes et d’interroger des fonctions génétiques autrement cachées.
Les virus exploitent des structures d’ARN hautement dimensionnelles pour faciliter la réplication virale et empêcher la restriction de l’hôte. Dans cet article, un nouveau procédé de dépistage basé sur le séquençage de nouvelle génération (NGS), appelé Fate-seq, a été utilisé pour définir et caractériser les structures d’ARN à haute dimension du génome du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère (SARSCoV) d’une manière impartiale, à haut débit et complète. Le procédé Fate-seq s’appuie sur les oligonucléotide Twist 300mer pour simplifier la préparation des banques et capturer des séquences génomiques suffisamment longues pour sonder les structures secondaires des ARN.