Ressources/Note d’application

Analyse des génomes viraux à l’aide d’oligonucléotides de 300 mer pour étudier la perte immunitaire

Découvrez comment les oligonucléotides de 300 mer permettent de parcourir les génomes et d’interroger des fonctions génétiques autrement cachées.

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Note d’application

Les virus exploitent des structures d’ARN hautement dimensionnelles pour faciliter la réplication virale et empêcher la restriction de l’hôte. Dans cet article, un nouveau procédé de dépistage basé sur le séquençage de nouvelle génération (NGS), appelé Fate-seq, a été utilisé pour définir et caractériser les structures d’ARN à haute dimension du génome du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère (SARSCoV) d’une manière impartiale, à haut débit et complète. Le procédé Fate-seq s’appuie sur les oligonucléotide Twist 300mer pour simplifier la préparation des banques et capturer des séquences génomiques suffisamment longues pour sonder les structures secondaires des ARN.


Abordé dans cette note d’application
Précisions sur Fate-seq, une nouvelle méthode d’analyse à haut débit de la structure secondaire de l’ARN
Comment utiliser des oligos de 300mer pour parcourir un génome et interroger sa fonction ?
Comment les structures secondaires de l’ARN dans le SARS-CoV et le SARS-CoV-2 peuvent-ils contribuer à l’échappement immunitaire ?
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