Pourquoi le synthétique est-il un meilleur choix pour le contrôle viral ?

Alors que le SARS-CoV-2 s’est propagé dans le monde entier, les chercheurs et les entreprises se sont empressés de mettre au point des tests de diagnostic, des thérapies et des vaccins pour faire face à la crise. Les contrôles positifs viraux sont des éléments essentiels de ces travaux, mais les virus vivants peuvent être difficiles à obtenir et à transporter, ils sont dangereux à manipuler et leur utilisation nécessite des laboratoires équipés de mesures de sécurité renforcées.

Pour surmonter cet obstacle, Twist Bioscience livre de grandes quantités de contrôles positifs synthétiques du SARS-CoV-2 dans le monde entier. Ces contrôles synthétiques simplifient les travaux essentiels de développement des diagnostics et des traitements.

« Dans une situation d’urgence sanitaire, comme celle du COVID-19, les laboratoires doivent impérativement disposer de toutes les ressources nécessaires pour étudier le virus et développer des contre-mesures », a déclaré Emily Leproust, PhD, PDG de Twist Bioscience. « Les contrôle synthétiques de Twist Bioscience sont plus sûrs et plus faciles à utiliser que les virus vivants et donnent aux laboratoires l’accès au génome viral dont ils ont besoin pour innover. »

Les contrôles positifs sont particulièrement importants lors du développement de dosage diagnostique par qPCR et NGS, car ils aident les chercheurs à identifier les raisons d’un résultat négatif. Les contrôles les aident à faire la différence entre les résultats négatifs dus à l’absence de coronavirus dans l’échantillon du patient et ceux qui sont négatifs en raison d’un test défectueux.

Au début de l’épidémie de COVID-19, le virus actif était souvent la principale source de ces contrôles. Cependant, le transport et la manipulation de particules virales vivantes posent d’énormes problèmes : les scientifiques doivent respecter un grand nombre de réglementations pour garantir la sécurité des collaborateurs et de la communauté, et de nombreux laboratoires n’ont que peu ou pas d’expérience du travail avec des virus vivants.

Les laboratoires qui s’appuient sur des virus vivants pour la recherche et le développement d’analyses peuvent également être confrontés à des pénuries de virus. Ces facteurs entravent d’autant plus la recherche essentielle, limitant notre capacité à détecter le virus, à suivre la propagation de la communauté et finalement à le traiter.

Cela explique pourquoi les contrôles synthétiques sont si importants. Les contrôles synthétiques de Twist Bioscience peuvent être facilement expédiés et étudiés en laboratoire. Comme ils ne sont constitués que d’ARN synthétique, et non de virus actifs, le stockage des agents pathogènes n’est plus un problème, ce qui simplifie considérablement les procédés de recherche.

Tout aussi important, la plateforme de synthèse d’ADN à haut débit de Twist permet de générer des contrôles en grandes quantités, ce qui réduit les pénuries potentielles. « Nous travaillons jour et nuit pour mettre à la disposition des chercheurs et des développeurs de tests du monde entier des outils indispensables pour lutter contre cette pandémie mondiale », a déclaré Mme Leproust.

De plus, afin de prévenir les problèmes éventuels de biosécurité, les contrôles synthétiques codent tout le génome viral, mais celui-ci est fragmenté en de nombreuses petites molécules, ce qui le rend très difficile à reconstruire. Les clients qui acquièrent des contrôles synthétiques sont soumis aux protocoles de contrôle de biosécurité les plus stricts de Twist et aux lois et réglementations applicables.

Having a powerful synthetic DNA platform also helps the research community keep pace with this evolving virus. A paper published in early July showed that a variation in a SARS-CoV-2 spike protein made the pathogen more virulent and has been outcompeting the previous version in the United States and Europe. This meant diagnostic labs needed to quickly update their assays in response to the emerging data. Twist launched a new control reflecting this variant within weeks of publication to continue supporting the research community tackling the pandemic.

En plus de l’épidémie de COVID-19, la communauté médicale et de recherche se prépare à faire face à un défi supplémentaire : la saison du rhume et de la grippe. Le COVID-19 présente de nombreux symptômes communs avec ces pathologies moins graves. Le tri des patients en fonction du virus sous-jacent sera important.

Afin de résoudre ce problème, Twist Bioscience a récemment lancé des contrôles contre plusieurs autres virus respiratoires, notamment la grippe, le SARS, le MERS et d’autres encore. Ces contrôles synthétiques peuvent aider les cliniciens à écarter la possibilité d’une grippe ou d’un autre coronavirus, tout en assurant un contrôle négatif pour le SARS-CoV-2.

« Le coronavirus est à l’origine du plus grand défi clinique et scientifique de notre histoire. Heureusement, le matériel génétique synthétique de Twist Bioscience, ainsi que de nombreuses autres ressources, peuvent nous aider à relever ce défi. La pandémie de COVID-19 est loin d’être terminée, et nous continuerons à évaluer les besoins du marché où notre plateforme de synthèse d’ADN pourrait apporter des outils décisifs pour combattre la maladie », conclut Mme Leproust.