Introduction: Minimal residual disease (MRD) monitoring tracks the abundance of any malignant cells remaining in the body after therapeutic intervention. Currently, circulating tumor DNA (ctDNA) is a promising biomarker for MRD diagnosis. Due to low abundance of ctDNA and unique somatic variants developed from each individual, MRD diagnosis requires personalized NGS assays with high sensitivity and specificity. Méthodes : Afin de répondre à ce besoin et évaluer précisément la MRD, Twist a mis au point les panels MRD Rapid 500. Ce produit permet aux clients de concevoir, de fabriquer et d’expédier des panels MRD entièrement personnalisés (jusqu’à 500 cibles) en six jours seulement. To demonstrate the detection sensitivity of Twist Rapid 500 MRD panels, we designed five custom MRD panels which specifically target somatic variants found in Breast, Lung, Colorectal Cancer, Melanoma and Renal Cell Carcinoma. Chacun de ces panels MRD a été conçu pour inclure 197 cibles, avec 3 à 5 variants par origine tissulaire et une sélection de mutations passagères. Probe sequences of each panel were designed to incorporate the variant allele in the test sample set. To create the sample set, we blended synthetic variant sequences with fragmented cell line gDNA (NA12878) to form a contrived specimen which approximates the profile of cell-free and circulating tumor DNA. Cinq niveaux de fréquence ont été créés avec des fréquences moyennes d’allèles variants (VAF) de 0 % (WT), 0,01 %, 0,05 %, 0,1 % et 2 %. Les banques ont été préparées avec des adaptateurs UMI et l’enrichissement ciblé a été réalisé à l’aide des panels MRD. They were sequenced on both Illumina NextSeq and PacBio Onso platforms. Résultats : Avec une profondeur de séquençage de 80 000x, les résultats de l’appel de variants ont révélé qu’une moyenne de 20 cibles SNV peut être détectée avec fiabilité dans les échantillons à 0,01 % de VAF pour chaque panel MRD, une différence clairement visible par rapport aux échantillons de contrôle WT. En plus de démontrer la précision de l’appel de variants en ciblant l’allèle alternatif, nous montrons l’utilité de cibler un grand nombre de variants pour la détection d’une signature de MRD à des niveaux très bas (par exemple, 0,01 % de VAF). Conclusion: En résumé, les panels MRD Rapid 500 de Twist ont montré une détection à haute sensibilité de mutations somatiques à très basse fréquence.